扩展观察性医疗结果合作组织(OMOP)的通用数据模型以应用于重症监护医学:利用重症监护医学学会的重症监护数据词典(C2D2)来标准化复杂的ICU数据的框架

《Critical Care Medicine》:Extending the Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) Common Data Model for Critical Care Medicine: A Framework for Standardizing Complex ICU Data Using the Society of Critical Care Medicine’s Critical Care Data Dictionary (C2D2)

【字体: 时间:2025年11月22日 来源:Critical Care Medicine 6.0

编辑推荐:

  评估SCCM C2D2与OMOP CDM的兼容性,发现49.6%概念完全匹配,46.4%需修改,4.0%无映射。语义匹配模型(F1 70.7%)在呼吸机参数、复合评分等场景存在挑战,需扩展OMOP支持时间精度和专科概念,并平衡标准化与可持续性。

  

摘要

目标:

评估美国重症监护医学学会(SCCM)的重症监护数据字典(C2D2)与观察性医疗结果合作组织(OMOP)的通用数据模型(CDM)之间的兼容性,并启动一系列步骤,以扩展OMOP以适应专门的重症监护数据元素。

设计:

采用三层语义匹配方法进行系统分析和映射研究,以证明技术可行性并识别重症监护数据标准化中的根本挑战。

背景:

重症监护医学信息学研究环境。

研究对象:

SCCM的C2D2元素。

干预措施:

无。

测量方法和主要结果:

我们使用三层分类系统(完全匹配、部分匹配和不匹配)评估了C2D2临床变量与OMOP CDM的兼容性。对226个C2D2元素的分析显示,49.6%的概念有完整的OMOP对应项,46.4%需要修改,4.0%没有合适的映射。主要的不兼容性出现在呼吸机参数、综合评分系统和高级器官支持文档中。基于大型语言模型的语义匹配系统在优化后的相似性阈值0.90下,实现了59.5%的精确度、87.0%的召回率和70.7的F1分数。这些发现强调了在重症监护领域内协调数据标准化方法的必要性,包括如何处理单个变量中的概念叠加、年龄特定标准以及通过SCCM Delphi流程制定的专门结构,但也揭示了OMOP映射的不兼容性或缺失的变量。

结论:

将OMOP CDM扩展到重症监护领域在技术上是可行的,需要针对复合评分、时间精度和专门的重症监护概念进行有针对性的修改,同时还需要相应的资源来支持这一构建。该领域迫切需要做出关键决策:是继续推进OMOP集成,还是调整C2D2以适应2.0版本;是通过观察性健康数据科学和信息学流程将C2D2纳入OMOP词汇表;还是与电子健康记录供应商合作以获得本地的重症监护标准支持。这些决策需要在技术可行性和长期可持续性及维护需求之间取得平衡。

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