与草莓根腐病病原菌Ceratobasidium sp. AG-A株SR-LN-10相关的一种新型 alphapartitivirus 的特征研究

《Archives of Virology》：Characterization of a novel alphapartitivirus associated with Ceratobasidium sp. AG-A strain SR-LN-10, a causal agent of strawberry root rot

草莓根腐病病原真菌Ceratobasidium anastomosis group-A菌株SR-LN-10中鉴定到新型无包膜双链RNA病毒CeAPV1，其基因组包含1891bp的dsRNA1（编码578aa RdRp）和1878bp的dsRNA2（编码546aa CP）。RdRp与Leucocoprinus alphapartitivirus 1同源性74.78%，CP与Bondarzewia berkeleyi partitivirus 1同源性44.24%。系统发育分析显示CeAPV1属于Partitiviridae科Alphapartitivirus属，首次完整基因组解析AG-A型真菌中的新型α分节病毒。

　　

摘要

在植物病原真菌Ceratobasidium的吻合群（AG）-A菌株SR-LN-10中鉴定出一种新型的alphapartitivirus，暂命名为“Ceratobasidium alphapartitivirus 1”（CeAPV1）。该菌株是从表现出典型根腐症状的病株草莓根部分离获得的。CeAPV1的完整基因组由两个线性双链RNA（dsRNA）片段组成：dsRNA1和dsRNA2。较大的dsRNA1片段（1891 bp）包含一个开放阅读框（ORF），预测编码一种含有578个氨基酸的RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）。较小的dsRNA2片段（1878 bp）包含一个ORF，编码一种含有546个氨基酸的衣壳蛋白（CP）。BLASTp分析显示，CeAPV1编码的RdRp与Leucocoprinus alphapartitivirus 1（LeAPV1）的RdRp具有最高的序列相似性（74.78%）。CeAPV1编码的CP与Bondarzewia berkeleyi partitivirus 1（BbPV1）的CP具有最高的序列相似性（44.24%）。系统发育分析表明，CeAPV1与属于Alphapartitivirus属的mycoviruses一起聚类在Partitiviridae科中。综上所述，这表明CeAPV1是一种新型的alphapartitivirus。这是首次报道感染AG-A菌株的新型alphapartitivirus的完整基因组序列。