基于多组学数据整合与药物重定位数据库挖掘阿片使用障碍治疗新策略

《Translational Psychiatry》:Identifying compounds to treat opiate use disorder by leveraging multi-omic data integration and multiple drug repurposing databases

【字体: 时间:2025年11月23日 来源:Translational Psychiatry 6.2

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  本研究针对阿片使用障碍(OUD)治疗药物匮乏的临床难题,通过整合基因组学(GWAS)、转录组学(DGE)和蛋白质相互作用网络(PPI)等多组学数据,系统筛选了4大药物数据库(Pharos/Open Targets/TTD/DrugBank)。研究团队开发了四种基因筛选策略,最终鉴定出31种特异性靶向OUD相关基因的已批准药物(如埃司酮胺/替拉布鲁替尼等),为药物重定位提供了新思路。该框架有效桥接了基础研究与临床转化,为加速OUD治疗研发提供了重要资源。

  
随着合成阿片类药物的泛滥,阿片使用障碍(OUD)已成为全球性的公共卫生危机。2023年美国因阿片过量死亡人数已超过8.7万,是1999年的10倍之多。然而面对如此严峻的形势,目前FDA批准用于OUD的药物辅助治疗药物仅有美沙酮、纳曲酮和丁丙诺啡三种,外加一种解毒剂洛非西定。与2型糖尿病拥有37种不同药理类药物的治疗选择相比,OUD的药物治疗方案显得尤为匮乏。这种治疗手段的短缺不仅加剧了社会负担,更凸显了开发新治疗策略的紧迫性。
传统的新药研发周期长、成本高,且失败率惊人——仅有21%的化合物能最终获得FDA批准。在这种情况下,药物重定位(即利用已批准药物治疗新适应症)成为极具吸引力的替代策略。已批准药物具有明确的剂量和安全数据,能够更快、更经济地进入新适应症的临床验证阶段。尽管药物重定位在肿瘤等领域取得显著进展,但针对OUD的系统性研究仍相对有限。
正是在这一背景下,发表于《Translational Psychiatry》的这项研究开辟了新路径。研究团队创新性地构建了一个整合多组学证据与药物数据库的筛选框架,旨在系统识别具有OUD治疗潜力的已批准药物。该研究充分利用了目前最大规模的OUD基因组关联分析(GWAS)和死后人脑转录组学数据,通过多维度证据整合,为药物重定位提供了坚实的科学基础。
研究人员采用了几项关键技术方法:首先整合了迄今为止最大规模的OUD基因组关联分析(GWAS)meta分析数据(涉及23,367例病例和384,629例对照),通过MAGMA进行基因水平分析;同时纳入了285例人脑前额叶皮层样本的差异基因表达(DGE)meta分析结果;利用dmGWAS进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析以识别富集GWAS信号的功能模块;最后系统查询了Pharos、Open Targets、治疗靶点数据库(TTD)和DrugBank四大药物数据库,建立了完整的基因-药物关联图谱。
研究结果方面,通过“GWAS与差异表达基因的交叉验证”发现,独立分析显示GWAS仅识别出3个显著基因,而DGE分析发现了335个差异表达基因。但当采用Fisher方法进行跨组学meta分析后,鉴定出的显著基因数量大幅增加,表明多组学整合能有效提升信号检测能力。
在“蛋白质相互作用网络揭示新靶点”方面,研究团队通过双向验证策略在22个显著富集的PPI模块中识别出70个独特基因。这些模块中的基因虽然单个可能未达到全基因组显著性,但作为功能单元显示出与OUD的强关联,有效扩展了潜在治疗靶点的范围。
关于“四步筛选策略的系统比较”,研究设计了从严格到宽松的四种证据阈值策略:“严格无网络”策略仅包含最显著证据,识别出72个基因;“严格加网络”策略纳入PPI网络基因,扩展至137个基因;“混合”策略平衡各证据来源,获得223个基因;“广泛”策略采用更宽松阈值,最终包含676个基因。这种阶梯式设计既保证了核心靶点的可靠性,又避免了遗漏潜在重要信号。
在“特异性药物的成功鉴定”方面,经过滤除靶向已知精神病学相关受体(如OPRM1和DRD2)的药物后,研究最终锁定了31种具有高度特异性的候选药物。这些药物中,有24种主要靶向三个基因:SLCO1B1(11种药物)、GUCY1B1(10种药物)和ERBB3(3种药物)。其余7种药物各靶向单一基因,包括靶向ERBB3/MAP4K5的奈拉替尼、靶向LIG1的博来霉素、靶向SST的半胱胺、靶向TEC的替拉布鲁替尼、靶向CKMT2的肌酸、靶向BDNF的艾氯酮胺以及靶向LTK的恩曲替尼。
值得注意的是,这些发现中既包含了预期内的靶点,也出现了令人意外的关联。例如艾氯酮胺(esketamine)主要通过阻断NMDA受体发挥作用,但研究显示其能通过下游信号级联调节BDNF表达。这解释了为什么DrugBank将其标注为BDNF靶向药物,同时也体现了多数据库查询的价值——不同数据库的注释差异可能反映药物作用的不同层面。
然而,一些看似新颖的关联需要谨慎解读。例如奈拉替尼、博来霉素等抗癌药物与OUD的关联,目前缺乏直接证据支持。SLCO1B1主要在肝脏表达,其作为中枢神经系统疾病治疗靶点的合理性存疑。而GUCY1B1编码的鸟苷酸环化酶参与一氧化氮信号通路,已知能调节阿片类镇痛药作用,且脑内表达丰富,更具治疗潜力。
研究讨论部分强调,这种多组学整合框架的优势在于三个方面:支持高通量查询OUD相关基因;能识别单一方法遗漏的重要靶点;为领域专家评审提供了浓缩的证据摘要。尽管存在局限性(如未考虑多药使用、效应方向等),但这种方法显著加速了从基础发现到临床转化的进程。
这项研究的真正价值在于建立了一个可扩展、可重复的研究范式。随着更多组学数据的积累(如表观遗传学、多组织表达谱等),这一框架能够不断融入新证据,持续优化候选药物列表。更重要的是,该方法可轻松适配于其他精神疾病或复杂性状的研究,为整个精神药理学领域的药物重定位提供了模板。
在OUD治疗选择有限的当下,这项研究不仅提供了一系列值得深入验证的候选药物,更重要的是开辟了一条将大数据转化为临床价值的可行路径。随着更多功能性验证的开展,这些候选药物中很可能诞生下一代OUD治疗方案,为应对阿片危机带来新的希望。
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