综述：整合肠道微生物组与宿主转录组学，以实现炎症性肠病的个性化管理

《Epigenomics》：Integrating gut microbiome and host transcriptomics for the personalized management of IBD

炎症性肠病（IBD）全球患者约680万，现有生物制剂疗效受限，肠道菌群失调通过代谢异常和屏障破坏加剧炎症。表观基因组学揭示DNA甲基化及增强子激活模式重塑免疫通路，多组学整合可分层患者实现精准治疗，但数据标准化和计算成本仍是挑战。

　　

摘要

炎症性肠病（IBD），包括克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC），全球约有680万人受到影响。尽管生物制剂或小分子药物治疗可以改善患者的预后，但随着时间的推移，治疗反应不佳的情况仍然普遍存在，这凸显了开发新的精准医疗策略的必要性。肠道微生物群的失调表现为有益微生物的减少以及促炎性病原体的过度生长。在IBD中，肠道菌群失调通过改变代谢物谱型和破坏上皮屏障来促进慢性肠道炎症。多组学整合技术的最新进展为更好地理解IBD的发病机制提供了方法。表观基因组学研究揭示了疾病特异性的DNA甲基化模式和增强子激活模式，这些模式会重塑免疫途径并损害上皮屏障的完整性，这是IBD病理生理学中的关键机制。这些分子特征使得可以将IBD患者分为不同的亚组，从而制定更加针对性的治疗策略。本文探讨了整合肠道微生物组、宿主转录组学和表观基因组学在改善IBD患者疾病管理方面的潜在益处。尽管仍存在一些挑战，如数据标准化、计算复杂性和成本问题，但随着多组学方法的不断发展，预计能够通过降低IBD患者的高治疗失败率来改善其预后。