使用酶法合成的同位素标记内标,通过LC-MS/MS技术对基因组DNA中的6-甲基硫代-2′-脱氧鸟苷和6-硫代-2′-脱氧鸟苷进行定量分析

《ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY》:LC-MS/MS quantification of 6-methylthio-2′-deoxyguanosine and 6-thio-2′-deoxyguanosine in genomic DNA with enzymatically synthesized isotope-labelled internal standards

【字体: 时间:2025年11月24日 来源:ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY 3.8

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  本研究建立LC-MS/MS方法用于定量基因组DNA中的6-硫代-2'-脱氧鸟苷(dTG)及其甲基代谢物6-甲基硫代-2'-脱氧鸟苷(dMeTG),并通过Jurkat细胞和患者样本验证该方法的有效性,为探讨硫嘌呤类药物抗白血病机制及突变效应提供工具。

  

摘要

硫嘌呤类药物6-巯嘌呤(6-mercaptopurine)和6-硫鸟嘌呤(6-thioguanine,简称TG)是鸟嘌呤的类似物,用于治疗血液系统恶性肿瘤和免疫介导的炎症性疾病。其作用机制包括TG与天然鸟嘌呤竞争性地掺入DNA(形成DNA-TG)。DNA-TG可发生S6-甲基化(DNA-MeTG),而O6-甲基鸟嘌呤甲基转移酶能够去除O6-烷基鸟嘌呤上的烷基,但对DNA-MeTG的去除效果较差,这会导致DNA中S6-MeTG与T碱基之间的错配。如果这种错配未被复制后错配修复系统(MMR)识别,可能会导致突变负荷增加并形成新的表位,从而可能增加肿瘤细胞被免疫系统识别的概率。DNA-MeTG在硫嘌呤类药物抗白血病作用中的确切机制仍有待阐明。本文介绍了一种基于液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)的方法,用于定量基因组DNA中的6-硫代-2′-脱氧鸟苷(6-thio-2′-deoxyguanosine,简称dTG)及其甲基化代谢物6-甲基硫代-2′-脱氧鸟苷(6-methylthio-2′-deoxyguanosine,简称dMeTG),该方法使用了酶法合成的同位素标记内标6-硫代-2′-脱氧鸟苷-13C215N和6-甲基硫代-2′-脱氧鸟苷-D3。纯化的DNA经过酶消化后转化为核苷,随后通过LC-MS/MS技术定量dMeTG和dTG,并将其含量相对于DNA中的2′-脱氧鸟苷含量进行标准化。该方法在经TG处理的Jurkat细胞中的适用性得到了验证,即使在DNA含量低于2 μg的样本中也能成功检测到dMeTG和dTG。此外,该方法也在患者样本中检测到了dMeTG,尽管其含量较低,主要出现在DNA-TG水平较高的样本中。所开发的dMeTG和dTG定量方法可用于进一步研究DNA-MeTG在硫嘌呤类药物作用机制中的作用,包括其抗白血病效果以及对获得性突变的影响。

硫嘌呤类药物6-巯嘌呤(6-mercaptopurine)和6-硫鸟嘌呤(6-thioguanine,简称TG)是鸟嘌呤的类似物,用于治疗血液系统恶性肿瘤和免疫介导的炎症性疾病。其作用机制包括TG与天然鸟嘌呤竞争性地掺入DNA(形成DNA-TG)。DNA-TG可发生S6-甲基化(DNA-MeTG),而O6-甲基鸟嘌呤甲基转移酶能够去除O6-烷基鸟嘌呤上的烷基,但对DNA-MeTG的去除效果较差,这会导致DNA中S6-MeTG与T碱基之间的错配。如果这种错配未被复制后错配修复系统(MMR)识别,可能会导致突变负荷增加并形成新的表位,从而可能增加肿瘤细胞被免疫系统识别的概率。DNA-MeTG在硫嘌呤类药物抗白血病作用中的确切机制仍有待阐明。本文介绍了一种基于液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)的方法,用于定量基因组DNA中的6-硫代-2′-脱氧鸟苷(6-thio-2′-deoxyguanosine,简称dTG)及其甲基化代谢物6-甲基硫代-2′-脱氧鸟苷(6-methylthio-2′-deoxyguanosine,简称dMeTG),该方法使用了酶法合成的同位素标记内标6-硫代-2′-脱氧鸟苷-13C215N和6-甲基硫代-2′-脱氧鸟苷-D3。纯化的DNA经过酶消化后转化为核苷,随后通过LC-MS/MS技术定量dMeTG和dTG,并将其含量相对于DNA中的2′-脱氧鸟苷含量进行标准化。该方法在经TG处理的Jurkat细胞中的适用性得到了验证,即使在DNA含量低于2 μg的样本中也能成功检测到dMeTG和dTG。此外,该方法也在患者样本中检测到了dMeTG,尽管其含量较低,主要出现在DNA-TG水平较高的样本中。所开发的dMeTG和dTG定量方法可用于进一步研究DNA-MeTG在硫嘌呤类药物作用机制中的作用,包括其抗白血病效果以及对获得性突变的影响。

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