基于合成X-Q空间学习的扩散MRI参数估计方法:在乳腺DKI中的初步研究
《International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery》:Synthetic X-Q space learning for diffusion MRI parameter estimation: a pilot study in breast DKI
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时间:2025年11月25日
来源:International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery 2.3
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本研究针对扩散MRI(dMRI)参数估计中传统机器学习方法对真实数据依赖性强、拟合质量要求高等问题,开发了合成X-Q空间学习(synXQSL)新方法。通过合成包含空间邻域信息的训练数据,结合多层感知机(MLP)回归器,在乳腺扩散峰度成像(DKI)实验中证明,该方法能有效提升噪声数据下的参数估计鲁棒性,显著改善参数图对比度,为dMRI定量分析提供了新思路。
水分子在生物组织内的扩散行为如同一位微米级别的信使,通过其运动轨迹向我们揭示组织微观结构的奥秘。扩散磁共振成像(diffusion MRI, dMRI)正是捕捉这种运动的关键技术,它通过施加不同强度和方向的运动探测梯度(motion probing gradient, MPG),获取一系列扩散加权图像(diffusion-weighted imaging, DWI),再通过数学模型拟合,量化出如扩散系数(D)、扩散峰度(K)等参数,用于评估组织完整性、细胞密度及病理改变。然而,从嘈杂的DWI信号中精准提取这些参数却非易事。传统的最小二乘拟合(least-squares fitting, LSF)方法在面对复杂模型(如扩散峰度成像, DKI)时计算成本高昂,且对噪声敏感。近年来兴起的机器学习(machine learning, ML)方法,特别是基于合成Q空间学习(synthetic q-space learning, synQSL)的策略,通过使用无限量的合成数据进行训练,避免了真实数据在多样性和质量上的限制,展现出巨大潜力。但synQSL通常以单个体素为单位进行参数估计,缺乏对图像空间平滑性的考虑,这在噪声较大的临床数据中可能导致结果不稳定。
为了解决这一问题,由Yoshitaka Masutani等人组成的研究团队在《International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery》上发表了一项创新性研究,提出了一种名为合成X-Q空间学习(synthetic X-Q space learning, synXQSL)的新方法。该方法的核心思想是将参数估计的空间从单纯的Q空间(描述扩散加权的空间)扩展到X-Q空间(联合了体素物理位置和扩散加权的空间),在训练回归模型时,不仅考虑中心体素的DWI信号,还纳入其3×3邻域内体素的信号,从而引入空间正则化,有望提升估计的鲁棒性。
为了验证synXQSL的有效性,研究人员开展了一系列实验。他们首先合成了海量的训练和测试数据。参数(S0, D, K)在一定范围内随机生成,并利用6种基底模式(平坦、线性、二次型)的线性组合来模拟3×3邻域内参数的空间变化,以增加训练数据的多样性。接着,根据DKI信号模型方程计算出每个位置、每个b值下的理想DWI信号,并模拟Rician噪声的污染,噪声水平由噪声比(NR = σ/ S0平均值)控制。研究采用多层感知机(multi-layer perceptron, MLP)作为回归器,输入是3×3邻域内所有体素在非零b值下的信号衰减比(Ei,j = Si,j/Si,0),输出是中心体素的D或K参数估计值。
关键的技术方法包括:基于线性组合基底合成3×3邻域参数图模式;利用DKI模型方程和Rician噪声模拟生成X-Q空间训练数据;使用多层感知机(MLP)进行回归模型训练与参数估计;通过合成数据、数字体模以及30例临床乳腺dMRI数据集(回顾性收集自东北大学医院,含26例恶性和4例良性病例)对synXQSL、synQSL和LSF方法进行对比评估。
合成数据实验表明synXQSL在噪声数据中优势明显
通过在不同噪声水平(NR=0.0, 0.001, 0.01, 0.1)下进行交叉测试,结果显示synXQSL(使用全部6个二次型基底)在估计噪声数据(特别是NR=0.1)的参数时,其均方根误差(RMSE)显著低于synQSL和LSF。同时,验证了噪声水平匹配对synXQSL性能的重要性。K参数的改善程度比D参数更为显著。
在已知真实值的数字体模上,synXQSL生成的参数图整体上比synQSL更平滑。比较不同基底组合(M=1平坦, M=3线性, M=6二次型)发现,仅使用平坦基底(M=1)会在图案边界产生较大误差和形状侵蚀,线性基底(M=3)会导致边缘模糊,而二次型基底(M=6)在保持边界锐利度和内部平滑度方面取得了最佳平衡,其K参数的RMSE、信噪比(SNR)、对比噪声比(CNR)和结构相似性指数(SSIM)均显著优于synQSL。
在真实的临床乳腺dMRI数据上,synXQSL(M=6)估计的D和K参数图与synQSL结果整体相似,但噪声更少,对比度更高。具体表现为:synXQSL的D图中消除了synQSL出现的白色点状过估计误差;血管结构在synXQSL的D图中显示为更高的值,更符合其高灌注特性的生理事实;synXQSL的K图结果更平滑,在乳腺腺体组织内保留了细微的低K值结构,同时在脂肪组织中减少了负K值的黑点误差。定量分析显示,synXQSL (M=6) 在D图和K图上获得的CNR(分别为1.685和3.714)均高于synQSL(分别为1.533和2.233)。
本研究系统地探讨了synXQSL的基本特性。结果表明,对于噪声较大的dMRI数据集(如NR=0.1的临床数据),synXQSL通过引入空间邻域信息进行正则化,能够有效提升参数估计的鲁棒性,抑制噪声,提高参数图的对比度。在训练数据合成中,使用二次型基底组合能够生成最合理的局部参数模式,是首选方案;对于边缘不尖锐的数据集,线性基底也可作为备选。
研究也指出了synXQSL的适用场景和局限性。当数据噪声较低(NR<0.1)或经过先进的去噪、AI重建预处理后,synQSL可能仍是更简洁有效的选择。此外,对于b值采样较稀疏的dMRI协议,synXQSL的优势可能更为明显。
与当前其他方法相比,synXQSL属于“局部”正则化方法,它巧妙地平衡了“利用邻域信息提升稳健性”和“保持参数估计的局部特性”之间的矛盾。这与那些使用卷积神经网络(CNN)对整个图像进行处理的“全局”方法形成对比,后者可能受限于训练数据的规模和多样性。一些近期研究也探索了使用注意力机制或变换器(Transformer)结合局部邻域(如3×3块)的方法,其结果间接支持了synXQSL所采用的邻域大小是合理的。
展望未来,研究人员计划将synXQSL应用于更复杂的模型,如结合了体素内不相干运动(IVIM)和DKI的IVIM-DKI模型,以提升乳腺肿瘤分类的准确性。同时,将其扩展到具有各向异性结构的脑部dMRI分析是一个重要的方向,这需要考虑向量或张量参数在空间上的变化,可能引入黎曼几何(Riemannian metrics)进行建模。在技术层面,探索随机森林(Random Forest)、Kolmogorov-Arnold网络(KAN)等其他回归器与MLP的比较,以及采用更复杂的真实噪声模型(如高斯混合Rician噪声)也是未来的研究重点。从更广阔的视角看,这种合成学习策略有望应用于结合扩散和弛豫(如T1, T2)的联合信号模型,实现对组织微观结构和生化环境更全面的量化表征。
总之,这项初步研究证实了synXQSL在提升dMRI参数估计鲁棒性方面的潜力,为开发更可靠、更精准的定量磁共振成像分析方法奠定了基础。
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