WEE1抑制剂通过GCN2介导的整合应激反应激活引发细胞毒性新机制
《Nature Communications》:WEE1 inhibitors trigger GCN2-mediated activation of the integrated stress response
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时间:2025年11月25日
来源:Nature Communications 15.7
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本研究揭示了WEE1抑制剂(WEE1i)通过直接激活GCN2激酶触发整合应激反应(ISR)的新机制。研究人员通过全基因组筛选发现,WEE1i的细胞毒性不仅依赖于其已知的细胞周期调控功能,还通过激活GCN2-eIF2α-ATF4通路导致翻译抑制。该发现为理解WEE1i的脱靶效应提供了新视角,并为开发更特异的WEE1i治疗方案提供了理论依据。
细胞周期的精确调控对维持基因组稳定性至关重要,而WEE1激酶在这一过程中扮演着"刹车"角色。作为CDK1和CDK2的关键负调控因子,WEE1通过磷酸化CDK的Tyr15位点抑制其活性,从而防止DNA复制未完成或DNA损伤的细胞提前进入有丝分裂。正是基于这一机制,WEE1抑制剂(WEE1i)被开发用于癌症治疗,特别是在TP53突变型肿瘤中显示出良好前景。然而,临床观察发现患者对WEE1i的治疗反应存在显著差异,提示除TP53状态外,还有其他因素影响WEE1i的疗效。
近期发表在《Nature Communications》上的研究由Rinskje B. Tjeerdsma、Timothy F. Ng和Maurits Roorda等科学家共同完成,他们发现WEE1i能意外激活整合应激反应(ISR),这一发现为理解WEE1i的作用机制提供了全新视角。
为了揭示WEE1i敏感性的决定因素,研究团队采用了多种前沿技术方法。他们首先通过单倍体遗传筛选和CRISPR-Cas9全基因组筛选系统鉴定影响WEE1i敏感性的关键基因;利用蛋白质组学(SILAC)和核糖体分析(Ribo-seq)研究翻译调控变化;采用单分子成像技术(socRNA)实时观察核糖体动力学;通过NanoBRET分析评估小分子与激酶的相互作用;并结合流式细胞术、免疫印迹等功能实验验证分子机制。
研究人员首先在HAP1细胞中进行了基因陷阱病毒插入突变筛选,发现除了已知的叶酸代谢途径基因(如MTHFD1、MTHFD2等)外,多个氨基酸-tRNA合成酶和翻译调控因子(如EIF2A)的缺失会增强细胞对AZD1775的敏感性。在RPE1 TP53KO和OVCAR3细胞中敲除EIF2A证实了其对WEE1i的增敏作用,但这种敏感性增加与DNA复制压力或DNA损伤水平无关。
进一步的机制研究表明,WEE1i处理能显著降低全局mRNA翻译水平,这种效应可被ISR抑制剂ISRIB逆转。CRISPR筛选结果显示,GCN2(EIF2AK4)及其共激活因子GCN1(GCN1L1)的缺失赋予细胞对WEE1i的抗性。实验证实,GCN2KO或ATF4KO细胞对WEE1i的敏感性降低,表明ISR通路在介导WEE1i毒性中起关键作用。
研究人员发现,WEE1i引起的GCN2激活不依赖于细胞周期状态,在G1期阻滞的细胞中同样可观察到ATF4上调。重要的是,GCN2抑制并不影响WEE1i诱导的DNA损伤(γH2AX焦点形成)和G2/M检查点 override,表明ISR激活和细胞周期紊乱是WEE1i的两个独立作用机制。在原代外周血单核细胞中同样观察到WEE1i诱导的ISR激活,提示这一现象具有普遍性。
CRISPR筛选还发现,核糖体质量控制(RQC)通路基因(如ZNF598、PELO等)的缺失会增强细胞对WEE1i的敏感性。单分子成像显示,WEE1i处理导致核糖体在Xbp1(S255A)暂停序列上的堆积增加,表明碰撞诱导的核糖体回收受损。这种核糖体动力学改变依赖于GCN2,且需要持续翻译的参与。
令人惊讶的是,研究发现WEE1i诱导的ISR激活不依赖于WEE1本身。siRNA敲低WEE1并不阻止ISR激活,而NanoBRET和激酶谱分析显示,多种WEE1i(AZD1775、Debio 0123等)能直接与GCN2激酶结构域结合。这种结合需要GCN1的存在,且依赖于持续翻译,表明WEE1i通过变构激活机制直接激活GCN2。
WEE1i与PKMYT1i的协同作用不依赖ISR激活
最后,研究人员探讨了联合治疗策略。发现低剂量Debio 0123(不诱导ATF4表达)与PKMYT1抑制剂RP-6306联合使用,能在不激活ISR的情况下产生协同细胞毒性,这为降低WEE1i脱靶毒性提供了潜在策略。
本研究系统阐明了WEE1抑制剂的双重作用机制:一方面通过抑制WEE1导致细胞周期检查点失效和DNA损伤积累;另一方面通过直接激活GCN2触发整合应激反应。这一发现不仅深化了对WEE1i作用机制的理解,也为优化治疗策略提供了重要线索:针对GCN2激活特性,可开发更特异的下一代WEE1i;利用低剂量WEE1i与PKMYT1i的协同效应,可在保持疗效的同时减少ISR相关毒性;对于RQC通路缺陷的肿瘤,现有WEE1i可能特别有效。该研究为WEE1抑制剂的精准医疗应用奠定了理论基础,对改善癌症治疗效果具有重要意义。
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