综述：超越DNA结合：CTCF在染色质结构与表观转录组调控的交汇点

《Epigenomics》：Beyond DNA binding: CTCF at the crossroads of chromatin architecture and epitranscriptomic regulation

CTCF蛋白通过DNA结合调控染色体组织和绝缘子功能，同时通过RNA结合影响转录动态和RNA加工，其与表观转录组学修饰（如m6A、m5C）的交互作用在疾病发生中起关键作用。

　　

摘要

转录调控是一个至关重要的生物过程，它确保了基因表达的准确性，使细胞能够维持其身份并响应环境刺激。CCCTC结合因子是一种基本的蛋白质，积极参与转录调控，作为一种高度保守的结构性调节因子。CTCF传统上被认为在染色质组织和隔离中起作用。它通过建立拓扑相关结构来协调活跃或被抑制的转录过程，并有助于保持增强子-启动子的身份。除了其DNA结合功能外，CTCF还显著参与RNA生物学。它通过其RNA结合域与新生RNA、前体mRNA和长非编码RNA相互作用，从而影响不同的转录动态。与此同时，快速发展的表观转录组学领域揭示了其他RNA修饰形式，如N6-甲基腺苷（m⁶A）、5-甲基胞嘧啶（m⁵C）和假尿苷（Ψ），这些修饰共同调节RNA的稳定性、运输、翻译和降解。因此，这些变化的失调或CTCF活性的异常与肿瘤发生、发育问题以及治疗抵抗性密切相关。CTCF介导的基因组结构与表观转录组调控的交汇点突显了其作为染色质和RNA网络复杂整合者的功能。本综述总结了当前对CTCF在DNA和RNA结合方面双重作用的理解，探讨了它们之间的相互作用如何影响转录调控、RNA加工以及与疾病的相关性。