阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)C2-XYPPX重复序列蛋白,该蛋白含有一个结构化的C2结构域,在结合钙离子后其柔韧性会降低
《Biochimie》:A
Trichomonas vaginalis C2-XYPPX-repeat protein with a structured C2 domain displaying dampened flexibility upon binding calcium
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时间:2025年11月25日
来源:Biochimie 3
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C2结构域在滴虫中的钙结合特性及结构研究。通过X射线晶体学和NMR分析发现Tv-C2-1具有典型的希腊钥匙模体结构,并能特异性结合两个钙离子,提示其与膜结合及蛋白相互作用相关。
C2结构域是真核生物中广泛存在的膜结合模块,通常由约130个氨基酸残基组成,常与膜运输或脂质修饰相关的蛋白质相关联。在人类常见的非病毒性性传播病原体——阴道毛滴虫(*Trichomonas vaginalis*)的基因组中,编码了八种含有N端C2结构域和C端XYPPX重复结构域的蛋白质(称为C2-XYPPX结构域)。尽管XYPPX重复结构域的功能尚不清楚,但其与C2结构域的多重关联提示其在该生物中可能具有重要的作用。本文对其中一种C2-XYPPX结构域蛋白——*Tv*-C2-1的C2结构域进行了结构和物理特性分析,采用了X射线晶体学和核磁共振(NMR)光谱技术。
*Tv*-C2-1的晶体结构显示,该结构域与所有C2结构域共享相同的折叠模式,即一种紧凑的希腊键(Greek-key)结构,由八个反平行β链组成,属于类型-2拓扑结构。通过NMR化学位移扰动实验,研究发现*Tv*-C2-1能够结合两个钙离子(Ca2?),主要通过预测的钙结合面上的两个环(loop-1和loop-3)进行结合,其解离常数(Kd)分别为58.0 ± 0.1 μM和232 ± 6 μM。对apo(无钙)状态和Ca2?结合状态下的整体旋转相关时间(τc)的估算表明,钙结合后蛋白质结构变得更加紧凑,这与loop-3的动态减少以及loop-1的微小动态变化(通过胺-15N异核稳态{H}-15N NOE实验得出)一致。*Tv*-C2-1能够结合钙离子并采用紧凑的希腊键结构,这是C2结构域的两个主要特征,这提示我们可能需要进一步研究XYPPX重复结构域的功能。
*Trichomonas vaginalis*是一种主要的厌氧、鞭毛、细胞外寄生原生生物,是导致滴虫病的病原体,可能是全球最常见的非病毒性性传播疾病之一。至今为止,人类是其唯一已知的宿主,主要存在于尿道(男性和女性)、阴唇和阴道等湿润环境中。感染个体通常无症状,但女性比男性更容易表现出症状,如瘙痒、排尿或射精时的灼热感、局部红肿以及恶臭、泡沫状、黄绿色分泌物等。尽管症状通常可以通过单次抗生素治疗得到缓解,但感染与宫颈癌发病率增加、协助HIV感染、不孕以及低出生体重婴儿等健康问题相关。因此,由于*Trichomonas vaginalis*对公共卫生构成重大威胁,深入了解其分子生物学特性变得尤为重要。
*Trichomonas vaginalis*(G3株)的基因组大约为180兆碱基,分布在六个假染色体上,编码了近90,000种候选蛋白。这使得其成为已知最大的蛋白质组之一。然而,由于许多基因在多个同源拷贝中存在,导致了大量的冗余。这种基因家族的大量扩张可能是由于基因重复、基因片段、转座子和假基因等因素造成的。有研究认为,这种“瑞士军刀”式的大基因组策略有助于Trichomonas在不同的环境条件下生存和适应。其中一种具有多个版本的蛋白质是一个由238个氨基酸残基组成的蛋白质,其N端含有已知功能的C2结构域,而C端则含有功能未知的XYPPX重复结构域(XP_001306387.1;*Tv*-C2-XYPPX-1)。*Trichomonas vaginalis*(G3株)的基因组中存在八个基因,这些基因编码了含有N端C2结构域和C端XYPPX重复结构域的蛋白质,其中XYPPX重复结构域包含超过四个XYPPX重复单元(见图S1)。这些蛋白质均不含有分泌信号序列,因此预计为细胞内蛋白。尽管XYPPX重复结构域的功能尚不清楚,但C2结构域在真核生物中非常普遍,通常与参与信号转导或膜运输的蛋白质相关。因此,XYPPX重复结构域可能也具有重要的生化功能。
为了研究*Trichomonas vaginalis*的C2-XYPPX结构域蛋白的结构和功能特性,研究人员对*Tv*-C2-1的N端130个氨基酸残基的C2结构域进行了结构分析,并探讨了其结合钙离子的能力及其动态特性。由于无法在*Escherichia coli*中重组表达可溶性的*Tv*-C2-XYPPX-1蛋白,研究人员转而对*Tv*-C2-1的结构域进行了结构分析,并研究了其结合钙离子的能力及其动态特性。
*Tv*-C2-1的结构在两种不同的形式中被解析出来:Form-1(9BKW)包含一个分子,而Form-2(9BKY)包含三个分子(见表1)。在后者中,模型了24个硫酸盐和两个甘油分子,而在前者中没有观察到盐或额外配体的存在。对这两种晶体形式的PISA分析(见链接)并未发现任何蛋白质-蛋白质相互作用界面。这些结果表明,*Tv*-C2-1的结构在没有钙离子的情况下保持相对独立,而在结合钙离子后,结构变得更加紧密。
研究还指出,尽管C2结构域在许多基本生物功能中起着重要作用,但它们的钙离子结合、蛋白质结合和脂质结合特性仍然难以仅通过其氨基酸序列预测。因此,实验性地对这些结构域进行表征是必要的。本文对*Trichomonas vaginalis*中的C2结构域进行了结构和物理特性分析,为理解该结构域的功能提供了重要的基础。
通过结构分析,研究人员能够更好地理解C2结构域的折叠模式及其与钙离子的相互作用机制。这些发现不仅有助于揭示C2结构域在滴虫病相关蛋白中的作用,还可能为开发针对这种病原体的新疗法提供线索。此外,XYPPX重复结构域的结构和功能研究也具有重要意义,因为其在多种生物过程中的潜在作用尚未被充分认识。
总的来说,本文的研究为理解C2结构域及其与XYPPX重复结构域的相互作用提供了重要的结构和生化数据。这些数据不仅加深了对*Trichomonas vaginalis*分子生物学的认识,还可能对其他相关研究领域产生影响。通过实验手段对这些结构域进行表征,为未来的研究奠定了基础,同时也为公共卫生领域的相关问题提供了新的视角和解决方案。
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