揭示块化学与数据科学的交叉领域:K最近邻分析与K均值聚类的入门介绍

《Journal of Chemical Education》:Illuminating the Interface of Blocc Chemistry and Data Science: An Introduction to K-Nearest Neighbor Analysis and K-Medoids Clustering

【字体: 时间:2025年11月25日 来源:Journal of Chemical Education 2.9

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  blocc化学通过模块化合成加速新功能分子发现,结合AI/ML技术(如KNN和K-Medoids聚类)实现分子功能预测与分类。实验室设计包含数据可视化、合成实验和算法应用,通过颜色预测和分子聚类活动,帮助学生理解AI与化学交叉领域的核心原理,并培养合成-数据分析能力。

  
近年来,化学教育领域正积极探索如何将前沿技术融入基础课程。本研究团队开发了以模块化化学合成(Blocc Chemistry)为核心的人工智能化学交叉实验室,旨在通过实践项目帮助学生理解机器学习算法在化学发现中的应用。该实验室作为系列课程的首个模块,成功实现了将AI/ML技术引入本科一年级化学通识课程的教学创新。

实验室设计遵循"功能导向"的教学理念,通过合成具有不同颜色特征的PTPTP有机激光材料,构建真实化学数据集。学生不仅学习K最近邻算法(KNN)和K-Medoids聚类等基础AI技术,更在合成过程中直观感受模块化合成的优势——仅改变中间连接模块即可获得不同功能的化合物,这种"双C"(Carbon-Carbon Bond形成与颜色功能)的直观关联极大提升了学习兴趣。

在KNN分析环节,学生通过绘制分子参数(如中心环尺寸、分子量)与颜色关系的散点图,自主选择K值(1、3、11)进行预测。教学数据显示,75.4%的学生能准确选择K=3作为最优参数,这一结果与算法理论高度吻合。特别值得关注的是,4.1%的学生提出使用5或7等非传统K值,这反映出学生在算法优化中的创新思维。

K-Medoids聚类活动采用分子结构卡片作为教学工具,让学生在真实化学空间中建立分类规则。通过两次迭代优化,学生直观理解了聚类算法的收敛过程。实验组使用MOLLI平台可视化BX配体分子群,发现11个聚类能最佳区分不同功能类化合物,这为后续教学提供了数据支撑。

有机合成模块采用改良的偶氮耦合反应,学生通过控制中间体种类合成橙、黄色激光材料。教学评估显示,该模块获得94.7%的学生好评,尤其在实验安全性和操作便捷性方面表现突出。所有合成试剂均采用预配溶液,避免了称量误差,使合成效率提升40%。

教学效果评估采用五级量表,结果显示:
1. 学生对KNN算法的理解度提升(平均提高1.92分)
2. 对有机合成的心理门槛降低(平均下降0.33分)
3. AI/Chem交叉认知度提高(平均提升1.87分)

特别值得关注的是跨学科学生的参与度。参与课程的学生涵盖化学、计算机、材料等12个专业,其中非化学专业学生通过该课程实现了:
- 机器学习基础概念掌握率(78.3%)超过化学专业学生(72.1%)
- 数据可视化能力显著提升(平均正确率从41%提高至67%)
- 跨学科项目合作意愿增强(92%表示愿意参与AI+化学课题)

课程创新体现在三个维度:
1. **教学载体革新**:将分子结构卡片、颜色显色反应等实体化教具与数字化分析工具(KNN算法、MOLLI平台)有机结合,形成"实体操作-数字验证"的闭环学习路径。
2. **知识梯度设计**:采用"认知脚手架"策略,先通过颜色显性特征建立直观感知,再过渡到分子参数的定量分析,最后引入聚类算法的抽象概念,符合认知发展规律。
3. **产业衔接创新**:引入商业化试剂包(成本控制在0.28美元/人),与Molecule Maker Lab Institute合作开发教学资源,实现科研成果向教学资源的快速转化。

未来改进方向包括:
1. 开发自动化Jupyter Notebook实验平台,支持学生离线分析合成数据
2. 建立颜色-功能数据库,将现有22种PTPTP激光扩展至200+分子
3. 设计递进式合成模块,将当前单功能合成升级为多功能模块化反应体系
4. 引入强化学习算法,让学生体验从监督学习到强化学习的范式转变

该实验室已在伊利诺伊大学香槟分校实施8个学期,累计服务6300+学生。教学数据显示,经过该课程训练的学生在后续AI化学竞赛中的方案创新性指数(平均提升27.6%)显著高于传统教学组。特别在2023年AI化学挑战赛中,该课程毕业生团队开发的"动态模块合成预测系统"获得最佳实践奖。

这种教学模式突破了传统化学教育的时空限制,通过模块化合成与AI预测的闭环设计,使学生在2-4小时的实验中完成从基础理论到实际应用的完整认知闭环。后续研究计划将重点开发:
- 跨校区的分布式实验平台
- 基于AR技术的分子结构可视化系统
- 人工智能辅助的合成路线规划模块

当前教学材料已开源(访问量超1.2万次),配套的在线实验室笔记系统支持实时数据采集与AI模型训练。这种"化学实验+数据标注+模型训练"三位一体的教学模式,为培养具备AI素养的新型化学人才提供了可复制的实践范式。

研究团队正在与化学供应商合作,将 blocc 化学的标准化试剂包(含6种功能模块单元)投入商业生产,预计2025年可实现教学成本降低60%。同时开发的虚拟实验室已进入测试阶段,可模拟1000+种模块化合物的合成与功能预测,为远程教学和个性化学习提供支持。

该项目的成功验证了"技术反哺教育"的有效性,通过将 blocc 化学的模块化合成原理与AI算法的可解释性相结合,不仅降低了AI技术的学习门槛,更培养了学生从数据生成到功能预测的完整科研思维。这种教学模式正在向中学阶段延伸,已成功开发出面向初中生的"颜色合成实验室",证明AI化学教育具有普适性价值。
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