在DNA数据存储领域，接受错误可能比通过严格的编码规则来避免错误更为高效

《IEEE Transactions on Molecular, Biological, and Multi-Scale Communications》：Embracing Errors Can Be More Efficient Than Avoiding Them Through Constrained Coding for DNA Data Storage

DNA数据存储需纠错编码，约束编码避免同聚物和GC失衡但冗余高，随机化编码接受错误用冗余补偿更高效，理论分析显示约束编码仅在高同聚物/GC失衡错误率时有效，而实证表明当前系统这些错误率上升有限。

　　

摘要：

DNA是一种具有吸引力的数字数据存储介质。当数据存储在DNA上时，可能会出现错误，因此纠错代码对于实现可靠的存储至关重要。一种常见的减少错误的方法是采用受限编码技术，该技术避免使用同聚物（连续重复的核苷酸）并平衡GC含量（鸟嘌呤和胞嘧啶的含量），因为这些因素与较高的错误率相关。然而，受限编码会带来冗余度增加的代价。另一种方法是随机化DNA序列，接受错误的存在，并通过额外的编码冗余来弥补。在本文中，我们确定了在哪些错误情况下，接受替换错误比采用受限编码更为高效。我们的研究结果表明，在当前的DNA数据存储系统中，对于替换错误而言，受限编码可能是低效的。理论分析表明，只有在同聚物比例较高且GC含量不平衡的序列中，受限编码才可能有效；而实证数据则显示，在现有系统中，这些核苷酸的错误率增加幅度非常小。