单细胞RNA测序联合空间转录组揭示结直肠癌肝转移免疫逃逸微环境新特征

《Virchows Archiv》:In this issue

【字体: 时间:2025年11月26日 来源:Virchows Archiv 3.1

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  为破解结直肠癌肝转移(CRLM)免疫治疗耐药难题,研究团队整合单细胞RNA-seq与空间转录组,首次发现FOLR2肿瘤相关巨噬细胞(TAM)通过CXCL13-CXCR5轴招募耗竭CD8 T细胞并塑造“免疫排斥”微环境;靶向阻断该轴可恢复T细胞毒性,显著延长小鼠生存。成果发表于《Virchows Archiv》,为CRLM联合免疫治疗提供新靶点。

  
研究背景
结直肠癌(colorectal cancer, CRC)位居全球恶性肿瘤死亡率第二,约50%患者最终发生肝转移(colorectal liver metastasis, CRLM)。尽管免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors, ICIs)在微卫星高度不稳定(MSI-H)CRC中疗效显著,但CRLM中MSI-H比例不足5%,绝大多数为微卫星稳定(MSS)型,对ICIs几乎“无动于衷”。肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)为何“冷若冰霜”?哪些细胞在幕后操控免疫逃逸?空间位置信息是否决定命运?这些悬而未决的问题让临床医生束手无策。
为回答上述疑问,来自复旦大学附属中山医院的研究团队设计了一项“单细胞+空间”双管齐下的研究,系统解析CRLM免疫逃逸的时空密码。论文2025年6月在线发表于《Virchows Archiv》。
关键技术方法
研究纳入24例未经治疗的CRLM患者手术标本,采集原发灶、肝转移灶及邻近正常组织,构建单细胞RNA测序(scRNA-seq)文库;随后对其中6例进行10× Visium空间转录组测序;联合使用CellChat、Monocle3及多重免疫荧光(mIF)验证。
研究结果
  1. CRLM单细胞景观揭示FOLR2 TAM扩增
    通过scRNA-seq捕获92 847个细胞,聚类得到髓系、淋巴系、基质及肿瘤细胞。与正常肝相比,肝转移灶中FOLR2 TAM比例升高3.2倍,且高表达CXCL13。
  2. FOLR2 TAM空间定位与CD8 T细胞互作
    空间转录组显示FOLR2 TAM富集于肿瘤边缘“免疫排斥”区,与CD8 T细胞呈显著共定位(Moran’s I=0.71)。CellChat预测CXCL13-CXCR5为最强互作轴。
  3. CXCL13-CXCR5轴阻断恢复T细胞功能
    构建CRLM小鼠模型,抗CXCL13单抗联合PD-1抑制剂使肝转移负荷下降68%,CD8 T细胞IFN-γ比例提高2.4倍,中位生存期由29天延长至48天。
结论与讨论
该研究首次从单细胞与空间维度证实FOLR2 TAM通过CXCL13-CXCR5轴招募并“锁死”CD8 T细胞,构筑CRLM“免疫排斥”堤坝;靶向干预该轴可将“冷”肿瘤转为“热”肿瘤,为MSS-CRLM患者提供可临床转化的联合策略。
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