通过CeRNA网络在乳头状甲状腺癌中鉴定ITGA2作为受甲基化调控的癌基因

《Hormones & Cancer》：Identification of ITGA2 as a methylation-regulated oncogene through a CeRNA network in papillary thyroid carcinoma

甲状腺乳头状癌（PTC）的ceRNA网络研究通过整合GEO和TCGA数据，构建miRNA介导的mRNA-mRNA网络，筛选出8个肿瘤相关基因。ITGA2在PTC组织中显著高表达，其沉默抑制细胞增殖、侵袭和转移能力，并发现PTC细胞ITGA2启动子去甲基化与其过表达相关。

　　

摘要

目的

乳头状甲状腺癌（PTC）是最常见的内分泌系统恶性肿瘤。本研究旨在构建一个竞争性内源性RNA（ceRNA）网络，以识别潜在的分子靶点并验证其生物学功能。

方法

整合了来自基因表达组学数据库（GEO）和癌症基因组图谱（TCGA）的基因表达谱，构建了一个基于ceRNA框架的miRNA介导的mRNA-mRNA网络。通过通路富集分析来筛选候选基因，并利用Western blot和qRT-PCR验证临床样本中的差异表达。在PTC细胞系中沉默目标基因后进行了功能检测。同时使用甲基化特异性PCR（MSP）来评估启动子甲基化与基因表达之间的关系。

结果

共鉴定出160对潜在的ceRNA对，其中51对与甲基化状态相关。进一步的功能富集分析将候选基因缩小到8个与肿瘤发生相关的基因。在这些基因中，整合素α2（ITGA2）在PTC组织中显著过表达。在PTC细胞中敲低ITGA2显著抑制了细胞的增殖、侵袭和转移能力。MSP分析显示，与对照组相比，PTC细胞中ITGA2的启动子甲基化程度降低，表明其上调与启动子甲基化水平降低有关。

结论

本研究建立了PTC中的ceRNA调控网络，并确定ITGA2为潜在的治疗靶点。其表达失调与表观遗传改变密切相关，为PTC的分子机制提供了新的见解。