人类全生命周期脑网络拓扑转折图谱:UMAP 揭示 0–90 岁四大关键节点

《Nature Communications》:Topological turning points across the human lifespan

【字体: 时间:2025年11月26日 来源:Nature Communications 15.7

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  编辑荐读:为破解“脑网络怎样随年龄跃迁”这一难题,研究者整合 9 大数据集 4 216 例 0–90 岁扩散成像,以 UMAP 流形降维首次定位 9、32、66、83 岁四大拓扑转折节点,划分五大生命周期,发现小世界性(small-worldness)与模块化(modularity)交替主导发育方向,为认知衰退、精神疾病风险窗口提供新生物标记。

  
“大脑像一座不断扩建又拆除的城市,道路密度、交通枢纽与街区边界在一生中反复重构。”过去,神经影像学家虽已捕捉到儿童期突触修剪、中年期效率顶峰及老年连接稀疏等片段式变化,却缺乏一张跨越 0–90 岁的连续“交通规划图”,更不知道整座城市的交通逻辑究竟在哪些时刻发生“路线突变”。这种认知缺口让“何时干预发育障碍”“何时预防退行性病变”缺少可量化的节点坐标。
为回答“人脑网络拓扑是否存在宏观转折、何时转向”这一核心问题,Alexa Mousley 与 Richard A. I. Bethlehem 等研究者联合英美 9 大神经影像队列,收集 4 216 名健康志愿者的高角分辨率扩散成像(HARDI),以图论 12 指标刻画整合(integration)、分离(segregation)与中心性(centrality)三维特征,并首次引入 Uniform Manifold Approximation and Projection(UMAP)将高维拓扑轨迹嵌入三维流形空间,系统扫描非线性拐点。论文于 2025 年 11 月 25 日在线发表于《Nature Communications》。
关键技术方法(≤250 字):
  1. 多中心 HARDI 数据(dHCP、BCP、HCP 系列、Cam-CAN 等)经 QSIprep/DSI Studio 行 GQI+ 确定性纤维追踪,统一配准至 AAL90 年龄匹配模板;2. 双次 ComBat 协变量调和消除扫描仪差异;3. 密度控制(10% 连接度)与可变密度双轨阈值;4. 11 项图论指标评估全局效率、小世界性、模块化、s-core 等;5. 968 参数组合的 UMAP 流形降维;6. 广义加性模型(GAM)与 LASSO 正则化筛选年龄预测因子;7. 主成分分析(PCA)与动态时间规整(DTW)比较五大时期轨迹形状。
研究结果
连接度一生起伏
密度控制前分析显示,网络密度出生最高、14 岁最低,90 岁再次下降;平均连接强度则几乎线性增长至 90 岁,提示“密而弱→稀而强”的整体策略。
拓扑指标生命周期曲线
全局效率(Global Efficiency)呈倒 U 形,29 岁达峰值;特征路径长度(Characteristic Path Length)与 small-worldness 谷值同步出现;模块化(Modularity)31 岁最低、90 岁最高;局部效率与聚类系数线性递增;s-core 持续上升,k-core 无显著变化;中心性指标中,介数中心性(Betweenness Centrality)31 岁最低,子图中心性(Subgraph Centrality)线性增加。
UMAP 定位四大拓扑转折
综合 968 个流形投影,9、32、66、83 岁被反复识别为“梯度方向反转”高密度点,由此划分五大生命周期:
Epoch1(0–9 岁)“婴幼童年”——聚类系数驱动,small-worldness 上升,全局整合下降;
Epoch2(9–32 岁)“青少年”——small-worldness 成为最强年龄预测器,网络整合增强、全局模块化下降;
Epoch3(32–66 岁)“成年期”——局部效率取代 small-worldness,整合开始下降、局部连接增强;
Epoch4(66–83 岁)“早老龄”——模块化主导,网络进一步分离;
Epoch5(83–90 岁)“晚老龄”——仅子图中心性与年龄相关,拓扑-年龄关联减弱。
PCA 与 DTW 验证转折强度
PCA 前三成分解释 76.6% 方差,PC1 对应分离指标,PC2 对应整合指标,PC3 混合中心性与模块化。9 岁与 32 岁在 PC1/PC2 均显著跃迁;66 岁三成分同时偏移,提示“全维度重塑”;83 岁仅 PC2 变化,幅度最小。DTW 显示 66 岁前后轨迹形状差异最大,32 岁为方向反转最剧点。
结论与讨论
研究首次在群体水平绘制 0–90 岁脑网络拓扑“航迹图”,证实人类大脑发育并非平滑曲线,而是在 9、32、66、83 岁出现四次“航线变更”。9 岁对应突触修剪尾声与青春期启动,32 岁对齐白质完整性峰值与认知效率顶点,66 岁契合高血压与痴呆风险上升,83 岁标志拓扑-年龄耦合衰退。四大节点可作为监测认知衰退、定制教育干预及老年健康管理的“时间窗”。此外,方法学上证明 UMAP 流形学习比传统单指标拐点检测更敏感,为后续精神疾病纵向追踪与干预时机研究提供可迁移框架。
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