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更正通知:阐明预测的miRNAs在Medicago truncatula的转录后基因调控及共生作用中的功能角色
《Current Bioinformatics》:Corrigendum to: Elucidating the Functional Role of Predicted miRNAs in Post-Transcriptional Gene Regulation Along with Symbiosis in Medicago truncatula
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年11月26日 来源:Current Bioinformatics 2.9
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预测了186个miRNA(含165个新miRNA)及770个靶蛋白,揭示51个新miRNA靶向282个lncRNAs,阐明其在豆科植物共生根瘤菌互作中的转录调控机制,为提升大豆固氮能力及土壤肥力提供理论依据。
在题为《阐明预测miRNAs在Medicago truncatula的转录后基因调控及共生中的功能作用》的研究论文中存在一处错误。该论文中的数字与发表在《Current Bioinformatics》2020年第15卷第2期[1]的主文及摘要不一致。
本文提供了错误的详细信息及更正内容。
原文内容:
摘要:背景:microRNAs是小型非编码RNA,能够抑制翻译和转录后过程;而长链非编码RNA则能够调节转录和转录后基因表达。Medicago truncatula是一种用于研究豆科植物生物学的著名模式植物,同时也被用作饲料作物。尽管它在固氮和改善土壤肥力方面具有重要意义,但关于其在共生过程中发挥重要作用的非编码RNA的信息却很少。
目的:本研究旨在探讨Medicago的非编码RNA在共生及转录因子调控中的作用。
方法:我们通过计算方法(考虑了长度、MFEI值、AU含量、SSR特征等参数)识别出新的miRNAs,并利用psRNATarget服务器确定了这些miRNAs的靶标蛋白,从而建立了它们之间的相互作用模型。
结果:共预测出149个新的miRNAs及其对应的770个靶标蛋白。我们还发现其中51个miRNAs靶向282个lncRNAs。
结论:本研究阐明了Medicago miRNAs在多种转录因子调控中的作用。这些发现将有助于提升这种重要模式植物的固氮能力,进而改善土壤肥力。
更正后的内容:
摘要:非编码RNA(ncRNAs)是基因表达的重要调控因子。microRNAs(miRNAs)属于小型ncRNAs,可抑制翻译和转录后过程;而长链ncRNAs则能调节转录和转录后基因表达。Medicago truncatula是研究豆科植物生物学的常用模式植物。尽管其在固氮方面具有重要作用,但关于其在共生过程中起关键作用的非编码RNA的信息仍然有限。
目的:本研究旨在从Medicago truncatula的基因组中预测miRNAs及其靶标,并阐明它们在共生和转录调控中的作用。
方法:我们开发了一种计算方法来识别Medicago truncatula中的miRNAs,并预测了这些miRNAs参与的多种生物过程的靶标蛋白,同时建立了它们之间的相互作用模型。
结果:共预测出186个miRNAs,其中165个为新的miRNAs。此外,还预测了这些miRNAs所靶向的770个蛋白质。研究发现,51个新的miRNAs靶向282个lncRNAs。通过分析预测的miRNAs与其结瘤素靶标蛋白之间的相互作用,进一步探讨了它们在共生过程中的调控机制。
结论:这些发现将有助于我们更好地理解这种重要模式植物的固氮能力,从而改善土壤肥力。
我们对造成的错误表示歉意,并向读者致以诚挚的歉意。
原文链接:https://www.eurekaselect.com/article/101155
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