一株产多环特特拉姆酸大环内酰胺的新种属海洋稀有放线菌的发现及鉴定

　　 摘要:

【背景】 海洋作为巨大的生物资源宝库，蕴含着数量丰富、种属多样的稀有放线菌，从海洋稀有放线菌的次级代谢产物中挖掘结构新颖的天然产物将会在药物研发、疾病治疗等方面发挥重要作用。【目的】 鉴定新种属海洋稀有放线菌，并评估其产生次级代谢产物的潜力。【方法】 基于16S rRNA基因序列相似度、平均核苷酸一致性(average nucleotide identity, ANI)以及数字DNA-DNA杂交(digital DNA-DNA hybridization, dDDH)对稀有放线菌进行鉴定，并通过培养基发酵优化明确其主要代谢产物。【结果】 鉴定了一株海洋来源稀有游动放线菌(Actinoplanes sp.) G11-F43，与新疆游动放线菌(Actinoplanes xinjiangensis) DSM 45184的16S rRNA基因序列相似度最高，为98.68%；与最相似标准菌株库氏游动放线菌(Actinoplanes couchii) DSM 45050的ANI最大值为86.87%，小于新种鉴定阈值95%，可认定为新物种；与最相似标准菌株德温特游动放线菌(Actinoplanes derwentensis) DSM 43941的dDDH最大值为31%，小于新种鉴定阈值70%，可认定为新物种。同时，通过培养基发酵优化培养，确定该菌株可产生多个5/5双环及5/5/6三环的特特拉姆酸大环内酰胺类天然产物。【结论】 本研究鉴定了一株新种海洋稀有游动放线菌(Actinoplanes sp.) G11-F43，有效丰富了海洋微生物资源库。此外，通过培养基优化实现了多个特特拉姆酸大环内酰胺类天然产物的发酵产生，为进一步研究该类活性天然产物提供了新的产生菌。