通过计算机模拟方法鉴定出一种新型的α/β水解酶折叠结构域蛋白，该蛋白与诺卡氏菌（Nocardia farcinica，菌株：JJSBBCNF_01）的毒力及抗生素抗性相关

《Molecular Diversity》：In silico identification of novel alpha/beta hydrolase fold domain-containing protein associated with virulence and antibiotic resistance in Nocardia farcinica (Strain: JJSBBCNF_01)

Nocardia farcinica高致病性和耐药性促使新型治疗靶点研究，通过结构生物信息学筛选出α/β水解酶折叠域蛋白，结合CMNPD等化学库的虚拟筛选，确定MNPD738等候选药物，为多药耐药性感染提供新策略。

　　

摘要

诺卡菌病可能导致疾病扩散，并影响多种生理系统，最常见的是皮肤、肺部和中枢神经系统。Nocardia farcinica在其他Nocardia物种中具有较高的致病性和抗生素耐药性，因此更有可能引起脑脓肿和其他影响多个器官的广泛感染。因此，迫切需要新的治疗靶点来对抗这种多重耐药的院内病原体N. farcinica。本研究旨在利用结构生物信息学方法对候选抑制剂进行优先排序，识别参与N. farcinica独特代谢途径的治疗靶点，并通过高通量虚拟筛选来发现潜在的药物化合物。含有alpha/beta水解酶结构域的蛋白质被确定为有前景的治疗靶点。通过对CMNPD、MNPD、Seaweed和 Specs化学库进行虚拟筛选，根据其ADME性质和结合亲和力，发现了五种有潜力的候选化合物。其中，MNPD738因在分子动力学模拟中的稳定性以及较低的结合自由能而被认为是一种有效的抑制剂。这些潜在的治疗靶点将有助于开发能够抑制病原体独特代谢途径的有效药物。所识别的药物靶点和先导化合物可能有助于开发出对抗耐药N. farcinica感染的有效疗法。未来的研究应重点关注这些化合物的实验验证，并进一步探索N. farcinica的致病机制。