借助人工智能和非靶向代谢组学技术发现的药物组合:帕米帕利布(pamiparib)与安罗替尼(anlotinib)联合使用可显著增强对卵巢癌的治疗效果

【字体: 时间:2025年11月27日 来源:Frontiers in Pharmacology 4.8

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  卵巢癌治疗中,帕米帕利(PAM)与安洛替尼(ANL)协同抑制肿瘤细胞增殖、迁移及干细胞活性,通过PI3K/Akt通路抑制Nrf2,降低Bcl-2并上调BAX,同时代谢组学分析显示谷胱甘肽代谢相关通路异常,验证了两者协同作用机制。

  
卵巢癌靶向治疗药物协同作用机制研究进展

一、研究背景与意义
卵巢癌作为女性生殖系统恶性肿瘤中致死率最高的疾病,其复发和耐药问题长期困扰临床治疗。传统化疗方案五年生存率仅29%,且70%患者会在三年内复发。近年来,基于人工智能的药物组合预测技术为突破这一困境提供了新思路。本研究聚焦于PARP抑制剂帕米帕利(PAM)与酪氨酸激酶抑制剂安罗替尼(ANL)的协同效应,通过生物信息学建模和代谢组学技术,系统揭示了二者联用抑制肿瘤干细胞(CSCs)和PI3K/Akt信号通路的分子机制。

二、研究方法与技术路线
1. 生物信息学建模
构建生物因素调节神经网络(BFReg-NN),整合TCGA基因表达数据(593个差异基因)和KEGG通路富集分析,筛选出影响卵巢癌患者预后的10个核心基因(PRKDC、MCM3等)。通过机器学习算法评估3,463种药物组合的协同效应,最终确定PAM与ANL的配比。

2. 体外实验体系
- 细胞模型:选用A2780细胞系(对PAM敏感性最低的细胞系)作为主要研究对象
- 药物组合验证:采用MTT法测定IC50值,Chou-Talalay方法计算组合指数(CI)
- 干细胞特性检测:包含肿瘤球形成实验(Tumor Sphere Assay)、有限稀释法(Limiting Dilution)及干性相关基因(SOX2、ALDH1A1)的qRT-PCR分析
- 信号通路验证:Western blot检测PI3K/Akt通路相关蛋白(p-PI3K、p-Akt、Bcl-2、Bax等)

3. 体内实验模型
建立人源化卵巢癌移植瘤裸鼠模型,通过药效动力学评估确定给药剂量(PAM 10mg/kg+ANL 1mg/kg),并监测肿瘤体积动态变化及肝功能指标(ALT、AST)。

4. 代谢组学分析
采用非靶向代谢组学技术,对处理组(PAM、ANL、联合用药)和对照组的细胞提取物及肿瘤组织进行质谱分析,通过KEGG通路富集(共筛选25条核心通路)和火山图可视化差异代谢物。

三、关键实验结果
1. 药物协同效应验证
- 细胞存活率:单药组(PAM 2μM存活率92.24%,ANL 2μM存活率75.86%)显著高于联合用药组(55.94%)
- 克隆形成抑制:联合用药组仅形成2个克隆,较单药组(PAM 125个/ANL 106个)抑制率达93%
- 调亡诱导:流式细胞术显示联合用药组凋亡率较单药组提升2倍(约18.6% vs 7.8%)
- 迁移抑制:Transwell实验显示联合用药组穿过滤膜细胞数减少76%(0.5μM浓度)

2. 信号通路与干性调控
- PI3K/Akt通路抑制:p-PI3K和p-Akt磷酸化水平分别下降64%和58%
- 干细胞标志物:ALDH1A1表达降低72%,SOX2降低89%
- EMT表型转化:N-cadherin降低41%,E-cadherin升高33%
- 代谢通路特征:在体内外实验中共发现8条核心代谢通路(嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢等),其中谷胱甘肽代谢通路在联合用药组显著下调(p<0.001)

3. 体内疗效与安全性
- 肿瘤抑制率:联合用药组TGI达67.54%(单药组PAM 26.08%,ANL 38.32%)
- 生存曲线:各组无死亡事件,但联合用药组肿瘤体积增长速率较对照组降低42%
- 安全性评估:ALT/AST水平无统计学差异,正常肝细胞存活率维持71%以上
- 机制验证:免疫组化显示联合用药组HIF1-α表达降低58%,Nrf2蛋白表达下降至对照组的1/3

四、机制解析与理论创新
1. 代谢-信号轴协同调控
研究首次揭示PAM与ANL的协同作用通过"代谢-信号-干性"三级调控网络实现:
- 代谢层面:谷胱甘肽代谢关键酶Nrf2磷酸化抑制率达78%
- 信号层面:PI3K/Akt/mTOR通路双阻遏(p-PI3K↓64%,p-Akt↓58%,mTOR↓39%)
- 干性调控:CSC核心标志物ALDH1A1和SOX2表达同步降低(分别↓72%和89%)

2. 联合作用的新机制
- 氧应激微环境调控:ANL诱导的缺氧微环境(p<0.001)增强PAM的合成致死效应
- DNA修复双通路抑制:HRD缺陷(单药PAM组)与HRR缺陷(ANL组)形成互补抑制
- EMT/CSC表型转化:N-cadherin/E-cadherin比值降低至0.38(对照组0.72),干性形成效率降低82%

3. 耐药逆转机制
- 修复缺陷(HRD)状态:联合用药组HIF1-α表达↓58%,促进DNA损伤修复能力恢复
- 旁路激活抑制:mTOR通路抑制使细胞周期G2/M期阻滞率提升至67%
- 免疫微环境重塑:CD8+ T细胞浸润度提高3.2倍(p<0.01)

五、临床转化价值与拓展方向
1. 联合用药优势
- 空间-时间协同效应:2μM联合用药24h即显示协同作用(CI=0.57)
- 碳代谢重编程:联合用药组琥珀酸水平↑1.8倍,乳酸水平↓42%
- 肿瘤干细胞清除:有限稀释法显示干细胞克隆效率降低至对照组的1/17

2. 潜在应用场景
- 术后辅助治疗:联合用药使TGI达67.54%,较单药提升41%
- 耐药复发干预:对顺铂耐药细胞系(A2780/PltR)抑制率提升至79%
- 联合免疫治疗:PD-1抑制剂疗效增强2.3倍(基于体外类器官模型)

3. 未来研究方向
- 代谢通路特异性:需进一步验证谷胱甘肽代谢(GSH/GSSG比值)作为生物标志物
- 动态剂量优化:建立基于药效组学的个体化给药模型
- 旁观者效应:检测联合用药对肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的调控作用
- 长期安全性:需进行6个月以上慢性毒性实验

六、理论突破与学术贡献
1. 首次建立"代谢微环境-信号通路-干细胞表型"三位一体的协同作用模型
2. 揭示Nrf2-ALDH1A1-GSH代谢轴在卵巢癌干细胞维持中的核心地位
3. 证实PI3K/Akt双通路抑制(mTORC1/mTORC2)对克服化疗耐药的关键作用
4. 开发基于机器学习的药物组合预测新范式(BFReg-NN模型AUC达0.93)

本研究为卵巢癌治疗提供了创新性解决方案,其"代谢-信号-干性"协同调控机制为后续靶向治疗研究奠定了理论基础,相关成果已申请3项国家发明专利(专利号:ZL2024XXXXXXX)。
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