早期宫颈癌中的HPV基因组状态及其与预后的关联

《Journal of Medical Virology》：HPV Genomic Status in Early Cervical Cancer and Its Prognosis Association

HPV捕获结合NGS分析早期宫颈癌患者基因组特征，发现HPV16占60%，40%样本存在病毒整合，其中2例整合至原癌基因，与预后不良显著相关（P=0.0035）。

　　

摘要

通过结合下一代测序（NGS）的HPV捕获技术，确定早期宫颈癌（ECC）患者特定的人乳头瘤病毒（HPV）基因组状态，这些患者符合2018年FIGO分期标准，并将这些状态与预后相关联。在一项回顾性研究中，对34例无组织学前哨淋巴结（SLN）转移的ECC患者的肿瘤样本进行了HPV捕获与NGS联合测序。NGS数据通过我们内部的VIROCAPT2流程进行分析，以确定精确的HPV基因组状态，如HPV基因组的完整序列、是否整合到宿主基因组中，并将这种“病毒身份卡”与患者的临床预后进行关联。正如预期的那样，HPV16仍然是最常见的基因型（60%，n=21/35）。在35个样本中，有40%（n=14/35）检测到HPV整合。我们发现，在ECC中，HPV整合事件与HPV基因型有关（p=0.0005）。在整合HPV的40%样本中，有8例HPV整合到了人类基因中，其中2例整合到了致癌基因中。最终，HPV整合的女性患者预后最差，无进展生存期与HPV整合之间存在显著相关性（p=0.0035），有趣的是，整合到致癌基因中的2例HPV患者均死于癌症。HPV基因组状态似乎是早期宫颈癌的一个关键预后因素，HPV整合与不良预后密切相关。需要更大规模的研究来确认HPV基因组信息在风险分层和治疗决策中的临床意义。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

支持本研究结果的数据可应合理要求向通讯作者索取。