α-amyrin（来自Calotropis procera）对HIV-1逆转录酶的抑制潜力：来自计算机模拟和体外实验的见解

《In Silico Pharmacology》：Inhibitory potential of α-amyrin from Calotropis procera against HIV-1 reverse transcriptase: insights from in silico and in vitro assays

α-羊乳素（Calotropis procera）通过分子对接和体外实验显示对HIV-1逆转录酶（RT）的显著抑制作用，IC50为26 μg/mL，接近Nevirapine的21 μg/mL，且在高浓度下抑制率分别为82%和92%，提示其作为植物基NNRTI的潜力。

　　

摘要

全球HIV疫情持续对公共卫生构成重大挑战，全球有数百万人受到影响，因此有必要探索新型抗逆转录病毒药物。本研究旨在通过分子对接和体外实验，评估来自Calotropis procera的植物化学物质α-amyrin对HIV-1逆转录酶（RT）的抑制潜力。研究首先采用计算机模拟（in silico）分子对接方法评估α-amyrin与HIV-1 RT的结合亲和力，随后进行药代动力学分析。随后使用比色ELISA试剂盒进行了体外HIV-1 RT抑制实验，以奈韦拉平作为参考药物。分子对接结果显示α-amyrin与HIV-1 RT的结合亲和力很强，结合能为-7.33 kcal/mol。该化合物与别构结合位点中的关键残基（Cys181和Gln182）形成了两个氢键。体外实验表明α-amyrin的抑制作用具有剂量依赖性，IC50值为26 μg/mL，与奈韦拉平（IC50 = 21 μg/mL）相当。在最高浓度（200 μg/mL）下，α-amyrin的抑制率为82%，而奈韦拉平的抑制率为92%。结合计算机模拟和体外实验的双重分析方法表明，α-amyrin是抑制HIV-1 RT的有希望的候选物质。其强的结合亲和力、显著的酶抑制作用以及良好的药代动力学特性表明，它有潜力进一步开发成基于植物的非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTI），从而解决药物耐药性问题，并有助于改进抗逆转录病毒疗法。

图形摘要

全球HIV疫情持续对公共卫生构成重大挑战，全球有数百万人受到影响，因此有必要探索新型抗逆转录病毒药物。本研究旨在通过分子对接和体外实验，评估来自Calotropis procera的植物化学物质α-amyrin对HIV-1逆转录酶（RT）的抑制潜力。研究首先采用计算机模拟（in silico）分子对接方法评估α-amyrin与HIV-1 RT的结合亲和力，随后进行药代动力学分析。随后使用比色ELISA试剂盒进行了体外HIV-1 RT抑制实验，以奈韦拉平作为参考药物。分子对接结果显示α-amyrin与HIV-1 RT的结合亲和力很强，结合能为-7.33 kcal/mol。该化合物与别构结合位点中的关键残基（Cys181和Gln182）形成了两个氢键。体外实验表明α-amyrin的抑制作用具有剂量依赖性，IC50值为26 μg/mL，与奈韦拉平（IC50 = 21 μg/mL）相当。在最高浓度（200 μg/mL）下，α-amyrin的抑制率为82%，而奈韦拉平的抑制率为92%。结合计算机模拟和体外实验的双重分析方法表明，α-amyrin是抑制HIV-1 RT的有希望的候选物质。其强的结合亲和力、显著的酶抑制作用以及良好的药代动力学特性表明，它有潜力进一步开发成基于植物的非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTI），从而解决药物耐药性问题，并有助于改进抗逆转录病毒疗法。

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