青光眼多基因风险评分在两个大型多民族队列中的表现存在差异

《Ophthalmology Glaucoma》:Glaucoma Polygenic Risk Scores Demonstrate Heterogeneous Performance across Two Large Multiethnic Cohorts

【字体: 时间:2025年11月27日 来源:Ophthalmology Glaucoma 3.2

编辑推荐:

  多基因风险评分在青光眼中的群体与个体水平表现不一致,需作为辅助工具并改进标准化方法。

  
Niloufar Bineshfar|Liyin Chen|Yan Zhao|Kanza Aziz|Nazlee Zebardast
马萨诸塞州眼耳医院眼科,哈佛医学院,波士顿,MA

摘要

目的

青光眼是不可逆失明的主要原因之一。尽管多基因风险评分(PRSs)在患者风险分层方面显示出潜力,但其在不同人群中的稳定性和可靠性尚未得到充分研究。本研究旨在确定已发表的青光眼PRSs在两个大型、多民族队列中是否表现出一致的人群水平性能和个体风险分配能力。

设计

横断面研究。

研究对象、参与者及对照组:

共纳入243,300名个体(7,190例开角型青光眼(OAG)患者;236,110名对照组)来自“All of Us”(AoU)研究项目,以及30,306名个体(1,899例OAG患者;28,407名对照组)来自Mass General Brigham(MGB)生物库。参与者年龄≥35岁,并具有可用的基因型和电子健康记录(EHR)表型数据。

方法

我们使用逻辑回归模型评估了《多基因评分目录》中发布的11种青光眼PRSs的性能。通过皮尔逊相关系数和杰卡德指数(Jaccard index)来评估PRSs在风险分类上的一致性。

主要结果和指标:

研究探讨了这些PRSs与开角型青光眼之间的关联,以及PRSs在风险分类上的一致性。

结果

较高的PRSs均与较高的OAG风险显著相关;比值比(OR)范围分别为:AoU队列为1.17至1.41,MGB队列为1.17至1.57。在AoU队列中,欧洲血统个体的关联最强(OR为1.22–1.55),而在非洲血统(OR为1.08–1.21)和混血美国血统(OR为1.09–1.33)个体中关联减弱。尽管在人群水平上表现一致,但不同PRSs之间的个体风险一致性较低:高风险分类的中位皮尔逊相关系数为0.42(四分位数范围:0.35–0.50),中位杰卡德指数为0.16(四分位数范围:0.13–0.19)。这种不一致性在病例、对照组、不同血统以及两个队列中均存在。

结论

我们的结果表明,虽然PRSs能够在队列层面预测青光眼风险,但其在个体层面的不稳定性限制了其独立临床应用。因此,PRSs应作为已确定的青光眼风险因素的补充工具。未来的工作应重点开发评估PRSs可靠性的工具,并标准化分析方法,以提高其可比性和临床适用性。

引言

青光眼以进行性视神经损伤和视野丧失为特征,是全球不可逆失明的主要原因。其病因复杂,涉及遗传和环境因素。开角型青光眼是最具遗传性的复杂人类疾病之一,目前已鉴定出数百个相关基因位点。过去十年中,全基因组关联研究(GWAS)发现了300多个与OAG及相关表型(如眼内压IOP和视神经头形态)相关的基因位点。多基因风险评分(PRSs)通过整合全基因组变异效应,成为量化遗传易感性的有效工具,可用于评估青光眼等复杂疾病的风险。PRSs能够有效识别患病个体、病情较重的个体,并预测疾病进展速度。然而,GWAS中的血统构成、表型定义和统计方法的差异可能显著影响PRSs在不同人群中的表现。近期在PRS方法学方面的进展,包括多血统GWAS、精细定位和综合评分技术,旨在提高其准确性和泛化能力。尽管如此,不同PRSs在个体风险分类上的一致性仍需进一步研究,这对临床应用和个性化医疗提出了挑战。本研究通过两个独立的多民族队列(All of Us和Mass General Brigham生物库)评估了多种PRSs之间的一致性及其临床效用,以更好地了解遗传风险分层在青光眼诊疗中的价值。

研究设计

本研究使用了“All of Us”研究项目(Controlled Tier Dataset v8)和MGB生物库的数据。All of Us是一项由NIH资助的纵向研究计划,旨在通过收集超过560,000名个体的遗传、临床和生活方式数据来推进精准医疗。MGB生物库是一个与电子健康记录(EHR)和调查数据相连的研究生物库,包含超过135,000名参与者的数据,其中36,000多名个体提供了遗传信息。

临床特征 AoU队列包括7,190名OAG患者和236,110名对照组;MGB队列包括1,899名OAG患者和28,407名对照组(表1)。AoU队列的平均入组年龄为59.5岁,57.7%的参与者为女性。血统分布为:欧洲血统占61.9%,非洲血统占21.0%,混血美国血统占17.0%。MGB队列的平均年龄为64.3岁,52.4%的参与者为女性。参与者主要为欧洲血统(89.5%)。

讨论

本研究评估了11种已发表的OAGPRSs在两个大型多民族生物库队列中的表现。在两个队列中,所有评估的PRSs在人群水平上均与OAG显著相关,但在不同血统群体内的表现存在差异。不出所料,这些PRSs在欧洲血统个体中的表现最好,而在非洲血统和混血美国血统个体中的效果则有所减弱,这反映了欧洲中心型GWAS衍生PRSs普遍适用性的持续挑战。

利益冲突 NZ从Sanofi/Genzyme公司获得咨询费用。

致谢 我们衷心感谢“All of Us”项目的所有参与者,没有他们的贡献,这项研究就无法完成。同时,我们也感谢美国国立卫生研究院(https://allofus.nih.gov/)提供本研究所需的参与者数据。

资助/支持 本研究得到了NEI 1R01EY036518项目(Zebardast博士资助)的支持。“All of Us”研究项目由美国国立卫生研究院区域办公室资助。

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