从松树标本中分离出Cryptococcus gattii（基因型VGI）：对其在墨西哥城自然栖息地的研究方法

《Revista Iberoamericana de Micología》：Isolation of Cryptococcus gattii (genotype VGI) from a specimen of Pinus. An approach to its natural habitat in México City

墨西哥通过地理信息系统定位隐球菌病患者活动区域树木采样，首次在Schinus molle、Erythrina coralloides和Pinus属中分离到C. gattii sensu stricto（VGI型），证实其自然存在。

　　

劳拉·罗西奥·卡斯塔尼翁·奥利瓦雷斯（Laura Rosio Casta?ón Olivares）|尤里希·保拉·阿吉莱拉·莱昂（Yurixhi Paola Aguilera León）|费尔南达·玛琳·莫雷诺·曼里克（Fernanda Marlene Moreno Manrique）|何塞·恩里克·雷耶斯·利拉（José Enrique Reyes Lira）|埃尔瓦·巴桑·莫拉（Elva Bazán Mora）|埃迪丝·桑切斯·帕雷德斯（Edith Sánchez Paredes）

墨西哥国立自治大学医学院微生物学系，墨西哥城，墨西哥

摘要

背景：在墨西哥，Cryptococcus gattii sensu lato已被确定为约10.8%的隐球菌病病例的致病菌；然而，从自然环境中分离出这种病原体以确认其在环境中的存在尚未成功。

目的：从一名被诊断为由该菌种引起的隐球菌病患者活动范围内的树木样本中分离出C. gattii。

方法：基于一个包含被鉴定为C. gattii的临床分离株的数据库，联系了该患者并获取了他的活动路线；通过地理空间分析，确定了附近的树木位置。对这些树木的树洞进行了采样，并对分离出的Cryptococcus菌株进行了生化和基因检测。

结果：从Schinus molle、Erythrina coralloides以及Pinus属的树木中分离出了4株Cryptococcus菌株：其中3株被鉴定为Cryptococcus neoformans sensu stricto，1株被鉴定为C. gattii sensu stricto。

结论：利用地理信息系统划定了环境采样区域，从而首次在墨西哥记录到自然环境中分离出C. gattii VGI基因型的案例。