KRAS突变在结直肠癌中的精准靶向治疗:系统性分析揭示突变谱系、抑制剂进展与临床试验格局
《npj Precision Oncology》:KRAS-targeted therapies in colorectal cancer: a systematic analysis of mutations, inhibitors, and clinical trials
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时间:2025年11月28日
来源:npj Precision Oncology 8
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本刊推荐:针对KRAS突变结直肠癌(CRC)靶向治疗选择有限的临床挑战,研究团队开展了KRAS突变谱系、共突变模式及靶向治疗进展的系统性分析。通过对三大公共数据集(DFCI/TCGA/MSKCC)中2280例样本的分析,揭示了KRAS突变在微卫星稳定(MSS)与高度不稳定(MSI)肿瘤中的分布差异,发现G12C抑制剂仅适用于3%的MSS病例,而针对G12D/G12V等高频突变的新型抑制剂及pan-RAS(ON)抑制剂正在临床试验中展现潜力。该研究为KRAS突变CRC的精准分型及联合治疗策略提供了重要依据。
在肿瘤研究领域,KRAS基因曾被视为"不可成药"的靶点,这一魔咒持续了近40年。作为结直肠癌(CRC)中最常突变的致癌基因,KRAS突变发生在超过三分之一的病例中,主要影响密码子12和13,较少见于密码子61、117和146。这些突变驱动细胞增殖、阻碍分化并抑制凋亡,导致患者预后更差、复发率更高,并对EGFR靶向治疗产生耐药性。尽管根据KRAS突变状态对患者进行分层已成为指导治疗的标准做法,但不同突变携带的致癌性和治疗反应并不相同。
近年来,针对特定KRAS突变亚型的抑制剂开发取得突破性进展,特别是sotorasib和adagrasib等KRAS G12C抑制剂的成功上市,重新定义了KRAS作为药物靶点的价值。然而,在结直肠癌中,G12C突变仅占约3%,且几乎不出现于微卫星高度不稳定(MSI)肿瘤中,这使得大多数KRAS突变结直肠癌患者仍缺乏有效靶向治疗选择。
发表在《npj Precision Oncology》上的这项研究,由Maria Navarro-Jiménez、Beatriz Gonzalez、Nuria Mulet、Cinta Hierro和Sergio Alonso共同完成,对KRAS突变频率和共突变模式进行了系统性分析,回顾了当前靶向治疗进展,并考察了针对结直肠癌中最常见KRAS改变的正在进行中的临床试验。研究人员整合了来自三大公共数据库(DFCI、TCGA和MSKCC)的2280例结直肠癌样本数据,通过多变量逻辑回归分析和Fisher精确检验,详细描绘了KRAS突变在不同分子亚型中的分布特征。
关键技术方法方面,研究团队从cBioportal获取了三个大型结直肠癌队列(DFCI的619例原发CRC、TCGA的528例原发CRC、MSKCC的601例原发CRC和532例转移灶)的突变和临床数据,通过多变量逻辑回归分析和Fisher精确检验评估突变频率差异,使用COSMIC数据库进行突变谱比较,并系统检索了NCI Thesaurus、PubChem和ClinicalTrials.gov数据库,识别出106种靶向KRAS/SOS1/SHP2的化合物及156项相关临床试验。
研究显示,在原发结直肠癌中,KRAS突变率为38%(670/1748),而NRAS和HRAS的突变率显著较低(分别为4.9%和0.9%)。转移灶中的突变频率与原发肿瘤相似,表明RAS突变是结直肠癌中的早期事件。KRAS突变在微卫星稳定(MSS)肿瘤中比MSI/高突变肿瘤更常见(38% vs 2%),且在晚期肿瘤(III/IV期)中比早期肿瘤(I/II期)更频繁(41.8% vs 34.1%)。
在MSKCC数据集的19对原发灶-转移灶配对样本中,KRAS突变状态高度一致(17/19,89%),支持KRAS突变的克隆起源。仅两例显示不一致:一例原发灶KRAS野生型而转移灶携带G12A突变(突变等位基因频率8.8%),提示为克隆扩张后获得的次级事件;另一例原发灶有G13C突变而转移灶无此突变(等位基因频率3.5%),表明原发灶中KRAS突变非克隆性。
密码子12和13的突变共同占所有KRAS突变的近82%。G12D是最常见的突变(占所有KRAS突变的28%),其次是G12V(12%)、G13D(11%)和G12C(3%)。MSI/高突变结直肠癌中G12突变的发生率低于MSS结直肠癌(11% vs 27%),而G13、Q61、K117和A146密码子的突变在两组间无显著差异。
在MSS原发结直肠癌中,KRAS突变与APC、PIK3CA、FBXW7、AMER1和SMAD2的较高突变频率显著相关,而与BRAF、NRAS和TP53的突变频率较低相关。1.2%的原发结直肠癌和1.5%的转移灶存在KRAS和BRAF共突变,其中大多数(77%)携带非典型BRAF突变(非V600E)。
在MSI/高突变原发肿瘤中,鉴定出11个基因的突变频率因KRAS突变密码子而异,其中5个基因(DDR2、KDR(VEGFR2)、EPHA3、ALK和FLT1(VEGFR1))编码MAPK通路上游的跨膜受体蛋白酪氨酸激酶。
与先前报道不同,本研究未发现KRAS G13突变与NF1突变之间存在显著关联。NF1和RASA1的突变频率在MSS和MSI/高突变肿瘤中与大小相似的其他基因相当,表明这些基因的突变未受到强烈的正向选择。
系统检索识别出106种靶向SHP2/SOS1/KRAS的药物或细胞治疗,包括73种抑制剂、15种TCR、14种疫苗、3种降解剂和1种反义寡核苷酸。其中85种已在结直肠癌患者的临床试验中进行或正在进行研究。
对ClinicalTrials.gov的系统检查检索到156项临床试验,其中52项评估仅靶向KRAS G12C的化合物,尽管该突变在结直肠癌中发生率很低。越来越多的试验正在研究靶向结直肠癌中更常见的KRAS突变(如G12D、G12V)的药物,以及pan-KRAS抑制等更广泛的方法。
研究结论强调,KRAS突变在结直肠癌中高度普遍,其在原发和转移病灶间的高度一致性反映了其早期克隆起源。突变分布因微卫星不稳定性状态而异:MSS肿瘤中G12突变更常见,而G12C突变在MSI/高突变肿瘤中几乎不存在。共突变模式分析显示,MSS原发结直肠癌中KRAS常与PIK3CA共突变,提示单独靶向KRAS可能不足以抑制肿瘤生长。
截至2025年6月,仅adagrasib和sotorasib获FDA批准用于治疗结直肠癌患者,且均仅靶向罕见的G12C突变。然而,治疗格局正在迅速扩大,包括针对更常见KRAS等位基因(如G12D、G12V、G13D)的抑制剂、pan-RAS和RAS(ON)药物,以及疫苗和TCR疗法等免疫治疗策略的临床试验正在进行中。
该研究的重要意义在于为KRAS突变结直肠癌的精准分型提供了全面依据,揭示了不同分子背景下的突变分布差异,为针对更广泛患者群体的治疗策略开发指明了方向。随着针对常见KRAS突变的新型抑制剂及联合治疗策略的不断发展,KRAS突变结直肠癌的治疗前景正迎来重大转变,有望为更多患者提供有效的个性化治疗选择。
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