氟伏沙明马来酸盐晶体结构解析:同步辐射X射线粉末衍射与密度泛函理论优化研究
《Powder Diffraction》:Crystal structure of fluvoxamine maleate, (C15 H22 F3 N2 O2 )(HC4 H2 O4 )
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时间:2025年11月28日
来源:Powder Diffraction 0.4
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本研究针对氟伏沙明马来酸盐晶体结构不明确的问题,采用同步辐射X射线粉末衍射结合密度泛函理论(DFT)优化,成功解析了该抗抑郁药物的晶体结构。研究确定了空间群P21/c(#14)的晶胞参数(a=21.6310(15) ?, β=99.979(5)°, V=2,215.48(25) ?3),揭示了阳离子-阴离子双层交替排列的独特堆叠模式,并通过氢键网络分析阐明了其稳定机制。该成果为药物多晶型研究和质量控制提供了重要的结构基础。
在药物研发领域,晶体结构的精确解析犹如解开分子世界的"指纹密码",对药效发挥和质量控制具有决定性意义。氟伏沙明作为一种广泛使用的抗抑郁药物(商品名Luvox?),其马来酸盐形式的晶体结构长期缺乏准确表征。早期研究曾提示该药物可能存在多晶型现象——即同一分子在不同结晶条件下形成不同空间排列结构的特性,这对药物生物利用度和稳定性产生重要影响。然而,由于传统分析技术的局限性,特别是1996年Foda等人报道的X射线衍射图谱缺失低角度区域数据,使得该药物的完整晶体结构一直笼罩在迷雾之中。
为攻克这一技术难题,研究团队开展了系统的晶体学解析工作。研究人员首先通过同步辐射光源获取高质量粉末衍射数据,结合先进的指标化算法和数据库检索,初步确定了晶胞参数。随后采用蒙特卡洛模拟退火技术进行结构解析,并利用Rietveld精修方法对模型进行优化。值得注意的是,团队创新性地引入两种不同的密度泛函理论(DFT)计算软件(VASP和CRYSTAL23)进行结构优化对比,为结果可靠性提供了双重验证。
关键技术方法包括:使用加拿大光源中心Wiggler低能束线收集同步辐射X射线粉末衍射数据(波长0.819826(2) ?,步长0.0025°);采用DICVOL06指标化程序和EXPO2014软件进行结构解析;运用GSAS-II软件进行Rietveld精修(包含66个几何约束);利用VASP和CRYSTAL23分别进行密度泛函理论几何优化计算;通过Mercury软件进行分子叠合和晶体堆积分析。
实验部分详细记录了晶体结构解析的全过程。样品采用市售氟伏沙明马来酸盐(TargetMol公司),在0.5mm直径Kapton毛细管中完成数据采集。衍射图谱显示样品可能存在混合相,且实验过程中可能出现光束损伤。通过对比发现,同步辐射图谱比历史数据多出若干衍射峰,提示可能存在多晶型差异。指标化过程发现单斜晶系(Z=4)不能完全拟合所有衍射峰,而尝试的2×超晶胞模型虽能改善拟合度,但导致不合理的分子几何构型,最终被证实为错误路径。
III. RESULTS AND DISCUSSION
晶体学参数精确定位为单斜晶系P21/c空间群,晶胞参数经DFT优化后显示阳离子和阴离子沿bc平面形成交替双层结构。特别值得注意的是,三氟甲基基团在堆积过程中相互邻近,而氢键网络则像"分子胶水"一样连接着阴阳离子层。研究首次精确表征了分子内O-H···O氢键(键长1.054?和1.402?)和三个分子间N-H···O氢键(键长1.782-1.894?),其中铵基质子与马来酸根氧原子形成的氢键对晶体稳定性起关键作用。
DFT优化结果对比揭示重要发现:两种计算方法得到的结构存在显著差异(RMSD=0.454?),主要体现在阳离子甲氧丁基侧链的构象变化上。而阴离子结构则高度一致(RMSD=0.043?),证实了马来酸根结构的稳定性。与实验结构相比,DFT优化后的模型显示出更合理的几何参数,说明实验过程中可能因光束损伤导致结构畸变。
氢键分析显示晶体中存在丰富的相互作用网络。分子间氢键形成R24(8)环状结构和C22(9)链状结构,这些由Etter和Bernstein发展的图集理论描述的超分子组装模式,为理解药物晶体中的分子识别提供了理论框架。Hirshfeld表面分析进一步证实,晶体堆积密度正常(每个非氢原子体积18.5?3),且主要短接触均来自氢键作用。
晶体形态预测表明,根据Bravais-Friedel-Donnay-Harker理论,氟伏沙明马来酸盐可能呈现{100}晶面主导的板状结晶习性。实验观察到的织构指数为1.109(6),证实了在旋转毛细管样品中存在显著的择优取向现象。这一发现对药物制剂过程中的结晶工艺控制具有指导意义。
研究结论部分强调,尽管实验样品存在多相混合和可能的光束损伤问题,但通过DFT优化获得的晶体结构模型具有化学合理性,能够满足药物相鉴定和定量分析的需求。该工作首次完整表征了氟伏沙明马来酸盐的晶体结构,不仅填补了药物晶体学数据库的空白,更重要的是建立了将同步辐射粉末衍射与理论计算相结合的研究范式。这种多技术联用策略为难以获得单晶的药物化合物提供了可靠的结构解析方案,对制药工业中的多晶型控制和知识产权保护具有重要应用价值。
这项发表于《Powder Diffraction》的研究成果已提交至国际衍射数据中心(ICDD),将作为标准参考数据收录于粉末衍射文件(PDF?)数据库中,为全球药物研发机构提供权威的结构参考。该工作彰显了现代晶体学技术在新药开发和质量控制中的关键作用,为类似难获得单晶的药物分子结构解析提供了可借鉴的技术路线。
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