JGTA-Net:基于联合几何拓扑分析的颅内动脉瘤检测与分割新方法

《IEEE Transactions on Biomedical Engineering》:A Joint Geometric Topological Analysis Network (JGTA-Net) for Detecting and Segmenting Intracranial Aneurysms

【字体: 时间:2025年11月28日 来源:IEEE Transactions on Biomedical Engineering 4.5

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  针对颅内动脉瘤(IA)自动检测难题,研究人员提出联合几何拓扑分析网络(JGTA-Net)。该模型通过层次化几何特征学习和持续同调拓扑分析,结合多尺度特征融合模块,在IntrA数据集上实现Dice=0.95、IOU=0.90的优异分割性能,并在两个独立验证集上证实其强泛化能力(>10% SC提升),为临床动脉瘤风险评估提供可靠技术支撑。

  
在大脑的血管网络中,颅内动脉瘤就像潜伏的"定时炸弹"——这些血管壁的异常膨出平时毫无症状,一旦破裂却会导致致命的蛛网膜下腔出血。尽管现代医学影像技术如CT血管成像(CTA)和磁共振血管成像(MRA)能够发现未破裂动脉瘤,但医生在阅片时面临着巨大挑战:动脉瘤通常体积微小,且隐藏在错综复杂的脑血管网络中,肉眼识别极易漏诊。在医疗资源匮乏地区,缺乏经验丰富的放射科医生更是雪上加霜。传统计算机辅助诊断系统多基于血管曲率、阈值分割等算法,其准确性难以满足临床需求。
随着深度学习技术的发展,三维点云作为高效的三维物体表示方式,为动脉瘤自动检测带来了新机遇。与传统的二维图像和体素表示相比,点云不仅内存占用更少,还能更全面地保留血管的立体形态特征。然而,现有点云分割方法在处理精细三维物体时,往往难以有效捕捉复杂的结构细节,特别是对动脉瘤这种具有复杂拓扑结构的形态学特征识别不足。
针对这一难题,美国密歇根理工大学Jingfeng Jiang团队开发了JGTA-Net(联合几何拓扑分析网络),该研究成果发表在《IEEE Transactions on Biomedical Engineering》上。这一创新模型巧妙地将几何特征学习与拓扑数据分析(TDA)相结合,在动脉瘤分割任务中实现了突破性进展。
研究人员采用了几项关键技术方法:基于PointNet++的层次化几何特征学习框架提取局部几何信息;持续同调(Persistent Homology)拓扑分析模块捕获多尺度拓扑特征;多头部通道注意力融合模块整合不同模态特征;同时引入拓扑损失函数PD优化分割结果的拓扑正确性。研究使用了公开IntrA数据集(116个动脉瘤点云)和两个内部验证集(42个长血管段和110个短血管段案例),通过5折交叉验证评估模型性能。
层次化几何特征学习
研究团队在PointNet++基础上进行改进,增加了两个关键几何参数:每个点到母动脉中心线的距离(d2cl)和到动脉瘤顶点的测地距离(gd)。通过最远点采样(FPS)算法和球查询分组,模型能够在不同空间尺度上学习局部几何特征。这一模块通过多个抽象层处理点云数据,每个抽象层包含采样、分组和特征提取三个步骤,逐步捕获从细粒度到粗粒度的几何结构信息。
拓扑数据分析模块
这是研究的核心创新点。该模块利用Ripser++软件包计算Vietoris-Rips持续同调,通过过滤过程追踪拓扑特征的演化。如图5所示,模块首先构建单纯复形过滤,记录拓扑特征的"生命周期",然后生成持续图(Persistence Diagram),最后将拓扑特征转换为持续图像(Persistence Image)的矩阵表示。这一过程能够有效过滤短寿命的噪声特征,保留稳定的拓扑不变量,重点关注一维(环状)和二维(空洞)特征。
多头部通道注意力融合模块
为解决不同模态特征的有效整合问题,研究人员设计了特征融合模块。该模块通过线性变换将输入特征映射到多个子空间,每个注意力头独立计算查询(Q)、键(K)、值(V)的注意力分数,使用softmax函数归一化注意力权重,最终加权求和生成融合特征。这种设计充分考虑了多个网络组件的集体贡献,实现了几何与拓扑特征的优势互补。
损失函数设计
研究采用了联合损失函数Total = λ1CE + λ2PD,其中交叉熵损失CE监督空间分类,拓扑损失PD基于Wasserstein距离度量预测与真实标签在拓扑特征上的差异。这种设计确保了分割结果在保持几何准确性的同时,具备正确的拓扑关系。
实验结果
在IntrA数据集上,JGTA-Net在512个采样点设置下取得了最佳性能:IOU为89.91%,DSC为96.52%,远优于其他7种对比方法。特别是在假阳性率(FPR=0.86%)和假阴性率(FNR=1.85%)方面表现突出,显著降低了误诊和漏诊风险。
在内部验证集1(长血管段)上,模型面对更复杂的血管结构仍保持稳定性能,IOU和DSC分别达到70.47%和81.27%,明显优于其他方法。这表明JGTA-Net能够有效处理临床环境中常见的复杂血管形态。
在内部验证集2(短血管段)上,模型性能与IntrA数据集相当,IOU和DSC分别为90.52%和94.78%,进一步证明了其强泛化能力。与其他方法相比,JGTA-Net在各项指标上均保持领先优势。
消融实验分析
多模块嵌入实验表明,单独使用几何特征(Geo)时mIOU为79.71%,加入拓扑分析模块(TDA)后提升至86.15%,最终结合注意力融合模块(Atten)达到89.94%,证明了各模块的有效性。
损失函数消融实验显示,加入拓扑损失PD后,mIOU从83.01%提升至89.94%,验证了拓扑损失函数对提升分割质量的重要作用。
形态学参数影响实验证实,同时使用d2cl和gd参数时性能最优(mIOU=93.27%),说明这两个几何描述符对动脉瘤分割具有互补作用。
研究结论表明,JGTA-Net通过融合几何与拓扑分析,在颅内动脉瘤分割任务中实现了state-of-the-art性能。其创新性在于首次将TDA应用于动脉瘤检测,通过持续同调捕捉多尺度拓扑特征,结合注意力机制实现有效特征融合。该模型在三个数据集上的稳定表现,证明了其在真实临床场景中的应用潜力。
值得注意的是,该方法能够准确识别多个相邻动脉瘤和大小差异显著的动脉瘤,这一能力对临床诊断尤为重要。同时,低假阴性率意味着模型漏诊风险小,这对于动脉瘤这种致命性疾病的筛查至关重要。
未来,该技术可与计算流体动力学结合,构建完整的动脉瘤风险评估系统。尽管当前模型在计算复杂度方面存在优化空间,但其整体框架为三维医学图像分割提供了新思路。随着自动血管分割技术的发展,JGTA-Net有望成为临床动脉瘤智能诊断平台的核心组件,为脑血管疾病的早期发现和干预提供可靠工具。
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