细粒棘球绦虫热休克蛋白Hsp90基因多样性初步研究:一种潜在的物种鉴定新标记

《Parasitology Research》:Preliminary investigation of heat shock protein 90 gene diversity in Echinococcus granulosus sensu lato: a potential nuclear marker for species identification

【字体: 时间:2025年11月29日 来源:Parasitology Research 2

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  本研究针对细粒棘球绦虫复合体物种鉴定难题,首次系统开展了核基因Hsp90的遗传多样性分析。研究人员通过设计特异性引物对G1/G3/G5/G7基因型样本进行PCR扩增和测序,发现Hsp90基因在种间存在显著变异(G5/G7分别呈现25/29个SNPs),系统发育分析支持其作为补充分子标记用于物种区分,为包虫病流行病学研究提供了新的核基因标记选择。

  
在寄生虫病研究领域,细粒棘球绦虫复合体引起的囊型包虫病(Cystic Echinococcosis, CE)作为重要的人畜共患病,其精准物种鉴定始终是流行病学监测的关键挑战。传统线粒体基因标记虽广泛应用,但存在局限性,迫切需要开发新型核基因标记。发表于《Parasitology Research》的这项研究首次将目光投向热休克蛋白90(Heat Shock Protein 90, Hsp90)基因,探索其作为种间鉴别标记的潜力。
研究人员创新性地采用多学科技术路线:首先收集来自突尼斯和法国的49份G1基因型、2份G3基因型、1份E. ortleppi(G5)和4份E. canadensis(G7)DNA样本,通过生物信息学设计四对重叠引物覆盖Hsp90基因全长,采用PCR扩增结合Sanger测序技术,运用MEGA软件进行系统发育分析和p-距离计算,并利用DnaSP和PopArt软件构建单倍型网络。
序列特征分析
成功获得2,033bp的Hsp90基因序列(接近全长2,289bp),所有样本均检测到保守的G222C单核苷酸多态性(SNP)。值得注意的是,E. granulosus s.s.(G1/G3)仅显示1个SNP,而E. ortleppi(G5)和E. canadensis(G7)分别呈现25和29个SNP,所有变异均为同义突变,未引起氨基酸改变。序列数据已存入GenBank(PQ310116-PQ310121)。
系统发育关系
最大似然法构建的系统发育树显示:G1和G3基因型紧密聚类,与参考序列(NW_020170614.1)形成独立分支;E. ortleppi(G5)和E. canadensis(G7)则以81%的引导值形成另一显著分支,其中G7分离株以100%引导值形成亚群。这一结果与基于线粒体基因(Cox1、nad1等)和核基因(ITS1、rpb2等)的既往研究高度一致。
单倍型网络
单倍型网络分析进一步证实遗传分化:E. granulosus s.s.(G1/G3)、E. ortleppi(G5)和E. canadensis(G7)分别形成三个明显独立的单倍型,彼此间通过多个突变步骤分隔,反映出显著的种间遗传差异。
本研究首次证实Hsp90基因在细粒棘球绦虫复合体中具有种特异性变异模式。虽然编码区变异均为同义突变,但内含子区域的变化为物种鉴别提供了新线索。研究结果支持Hsp90作为补充性核标记用于系统发育重建,特别是在物种水平区分方面展现重要价值。未来需要扩大样本量和地理范围进行验证,并探索这些多态性的功能意义。该研究为包虫病的分子流行病学追踪和进化研究提供了新的工具选择。
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