濒危的亚洲最高树木——藏东柏（Cupressus austrotibetica，属于柏科）具有较高的遗传负荷，并经历了近期由人类活动导致的种群瓶颈效应

《Journal of Systematics and Evolution》：High genetic load and recent anthropogenic bottleneck in the endangered Cupressus austrotibetica (Cupressaceae), Asia's tallest tree

理解濒危物种的遗传多样性和遗传负荷对制定有效保护策略至关重要，尤其在喜马拉雅等生态敏感区。本研究通过对比雪松属两种濒危物种（Cupressus austrotibetica与C. gigantea）的转录组数据，发现前者遗传多样性更高（π=0.0091 vs 0.0042），但有效种群规模更小（N≈7200 vs 17,600），并检测到3次历史瓶颈事件（2次与第四纪气候波动重合）。此外，C. austrotibetica携带更严重的有害突变，提示近期人为干扰导致其种群遗传负担加重，亟需优先保护。

　　

摘要

了解濒危物种的遗传多样性和遗传负荷对于制定有效的保护策略至关重要，尤其是在像喜马拉雅山脉这样生态敏感的地区。Cupressus austrotibetica是一种稀有的针叶树，也是亚洲记录中最高的树木，可生长到101.2米高，但它面临着严重的人为和环境威胁。为了评估其遗传状况，我们对在其有限分布范围内采集的54个个体的转录组进行了测序，并将其与96个C. gigantea个体的转录组进行了比较。C. gigantea是一种亲缘关系密切的濒危物种，分布范围更广，生长在更高的海拔地区。分析结果显示，C. austrotibetica的遗传多样性（π = 0.0091）高于C. gigantea（π = 0.0042）。人口统计分析发现了C. austrotibetica的三个历史性瓶颈事件和C. gigantea的两个瓶颈事件，其中两个事件与第四纪气候波动同时发生。尽管C. austrotibetica的遗传多样性相对较高，但其有效种群规模（根据Stairway Plot 2计算得出，Ne ≈ 7200）仍小于C. gigantea（Ne ≈ 17,600）。此外，C. austrotibetica携带了更高比例的严重有害突变，而C. gigantea则保留了更多中等程度的有害变异。这些发现表明，最近的人为因素可能导致了C. austrotibetica种群规模的减少和遗传负荷的增加，从而凸显了对该物种进行保护的紧迫性。

研究结果总结

我们的研究对象是Cupressus austrotibetica（一种稀有且高度极高的针叶树）和与其亲缘关系密切的濒危物种C. gigantea（均分布于喜马拉雅山脉）。通过对这两个物种在其分布范围内的54个个体进行转录组测序，我们发现C. austrotibetica的遗传多样性较高，但其有效种群规模（Ne ≈ 7000）小于C. gigantea（Ne ≈ 17,600）。人口统计分析揭示了多个历史性瓶颈事件，其中一些事件与第四纪气候波动同时发生。遗传负荷分析表明C. austrotibetica含有更多严重的有害突变。这些发现表明，近期的人为影响可能是导致C. austrotibetica种群规模减少和遗传负荷增加的原因，进一步强调了对该物种进行保护的紧迫性。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

转录组测序数据已存放在国家基因组数据中心（https://bigd.big.ac.cn/），项目编号为BioProject: PRJCA036881。