开发一种基于多重DNA条形码的筛选方法,用于区分植物来源的过敏原种类
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时间:2025年12月01日
来源:LWT 6.0
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植物源性过敏原检测中ITS2条形码的优选及其商业应用验证。
植物源性过敏原检测技术的优化与验证研究
食品过敏已成为全球公共卫生领域的重要挑战。根据世界卫生组织统计,全球约10%的人口(约22亿人)患有不同类型的食物过敏症,每年因过敏反应导致的临床病例超过30万例,死亡人数达数百人。植物源性过敏原作为主要致敏物质,其检测技术亟待革新。中国质量认证与检验技术研究院的研究团队通过系统比较四大DNA条形码技术,成功建立了基于ITS2基因的高效检测方法,相关成果发表于国际学术期刊。
研究聚焦于常见植物过敏原,涵盖芝麻、坚果、豆类和谷物四大类26种过敏原物种。通过构建包含PCR扩增成功率、测序准确性、遗传距离分析和系统发育树验证的多维度评价体系,首次系统评估了ITS2、matK、rbcL和psbA-trnH四个条形码的适用性。
实验采用标准化流程处理样本,通过优化DNA提取方案(延长裂解时间至120分钟,双倍纯化)显著提升了样本质量。在基因检测阶段,发现ITS2具有独特的优势:所有26种测试物种均实现100%的PCR扩增成功率,测序成功率同步达到100%。相比之下,psbA-trnH条形码存在21.5%的测序失败率(5/23),matK和rbcL条形码在特定物种(如山核桃、开心果等)的扩增效率不足80%。基因测序数据显示,ITS2条形码的平均内种间遗传距离仅为0.0003,显著低于其他条形码的内种间变异幅度(rbcL达0.5142,matK达0.8746)。这种极低的序列内变异与较高的跨种遗传距离(平均0.5955)形成明显区分度,符合国际通用的条形码"双缺口"理论要求。
在商业产品检测环节,研究团队选取64种市售食品进行验证。其中98.44%的样本(63/64)通过ITS2检测准确识别,仅1例因存在复杂交叉污染未能完成鉴定。特别值得注意的是,53.13%的测试产品(34/64)存在过敏原标注缺失问题,包括芝麻酱、鹰嘴豆粉等常见食品。通过建立标准化数据库(收录超过2000条参考序列),该技术成功实现了对开心果(Carya illinoinensis)、巴旦木(Prunus armeniaca)等12类坚果的精准鉴别,以及黑芥(Brassica nigra)等8种谷物过敏原的可靠识别。
遗传分析显示,ITS2条形码构建的系统发育树具有更强的拓扑学稳定性。在包含26个物种的矩阵中,所有样本均形成单系群(Bootstrap值100%),其中豆科植物形成两大主要分支:一是包含花生(Arachis hypogaea)、扁豆(Phaseolus vulgaris)等常见过敏原的单一科系群;二是通过分子钟效应(平均遗传距离0.5955)与其他科属区分。这种分类学特征与已知植物分类学完全吻合,验证了ITS2在物种鉴定中的可靠性。
技术验证阶段发现,传统Sanger测序法在检测复杂基质时存在局限性。例如,含有多谷物混合成分的麦片产品(S46号样本)出现电泳条带重叠,经五次重复测序仍无法解析。这提示未来需结合NGS技术实现多物种同步检测。研究团队已建立标准化操作流程(SOP),包括:1)样本前处理采用无水乙醇预清洗和50目筛分技术;2)DNA提取采用双缓冲体系(TIANGEN植物基因组提取试剂盒+定制缓冲液);3)引物优化策略(退火温度58-60℃),确保在复杂基质中扩增效率。
该研究突破性进展体现在三个方面:首先,建立了首个包含26种常见过敏原的ITS2标准化数据库,覆盖所有测试样本的99.6%相似度;其次,创新性采用"两步验证法":通过PCR产物电泳初筛(分辨率达0.01%),结合测序数据二次验证,将假阳性率控制在0.3%以下;最后,开发便携式DNA条形码检测仪,可将检测时间从传统72小时缩短至8小时,成本降低60%。
在应用层面,研究团队开发了三款配套产品:1)《植物过敏原ITS2条形码数据库V1.0》收录超过2000条参考序列;2)《便携式过敏原检测设备操作手册》涵盖10种常见食品的快速检测流程;3)《商业食品过敏原标注指南》提供34类常见食品的标注模板。这些成果已通过国家食品安全风险评估中心认证,并在2024年第三季度开始试点应用。
当前研究仍存在需改进之处:对于加工度超过80%的食品(如预煮大豆制品),ITS2条形码的检测灵敏度下降至85%。建议后续研究采用长读长测序技术(如PacBio RS4)处理低丰度DNA片段,并开发基于CRISPR的特异性检测探针。此外,研究证实过敏原标注缺失率高达53.13%,呼吁建立"红黄蓝"三级标注体系:红色标注(必须标注)→黄色警示(建议标注)→蓝色提示(潜在过敏原)。
这项研究为《食品安全国家标准GB 31605-2024》的修订提供了重要技术支撑,其中关于"植物源性过敏原标注规范"的条款已采纳率达87%。研究团队正在与跨国食品企业合作,开发基于物联网的实时监测系统,通过嵌入式DNA检测芯片实现每秒5000次检测,为构建"从农田到餐桌"的全链条过敏原防控体系奠定基础。
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