基于配体的设计与优化:Tecovirimat衍生物作为针对猴痘病毒的强效抗病毒剂

《European Journal of Medicinal Chemistry》:Ligand-Based Design and Optimization of Tecovirimat Derivatives as Potent Antiviral Agents Against Monkeypox Virus

【字体: 时间:2025年12月06日 来源:European Journal of Medicinal Chemistry 5.9

编辑推荐:

  猴痘病毒(MPXV)当前是全球最严重的传染病之一,需新型抗病毒药物。本研究基于已获批药物 tecovirimat 设计并合成系列衍生物,发现 C12(EC50=12.14 nM)具有最佳体外抗病毒活性,小鼠口服药代动力学显示生物利用度达 162%,且低毒(2000 mg/kg 单剂或 100 mg/kg 连续 14 天)。分子对接证实 C12 与 VACN 病毒 p37 蛋白结合模式与 tecovirimat 一致,为优化候选药物提供结构依据。

  
近年来,猴痘病毒(MPXV)作为重要的正痘病毒科病原体持续引发全球关注。2022年全球性疫情导致超过14.6万例确诊和343例死亡,而2023-2024年刚果民主共和国出现的Clade Ib亚型病毒,其传播性和致病性显著增强,已造成近1.7万例疑似病例和600例死亡,并首次在乌干达、肯尼亚等非疫区实现本地传播。世界卫生组织于2024年8月再次将猴痘列为突发公共卫生事件,凸显了新型抗病毒药物研发的紧迫性。

当前治疗正痘病毒的主要药物包括针对DNA聚合酶的西多福韦和布林西多夫韦,以及通过抑制p37蛋白发挥作用的替考维林。其中,替考维林作为FDA批准的口服抗病毒药物,通过阻断病毒包膜形成关键蛋白p37的活性,在临床应用中展现出良好安全性和有效性。然而现有药物存在治疗窗口期短、长期疗效不明确、可能诱导耐药突变等问题,特别是在Clade Ib病毒中已观察到对替考维林的潜在耐药性。

基于此背景,深圳关键药物研发实验室的研究团队通过系统化药物设计策略,成功开发出新型替考维林衍生物C12。该化合物经体外筛选显示其50%抑制浓度(EC50)达到12.14 nM,显著优于传统替考维林(EC50约20 nM)。值得注意的是,C12在动物模型中展现出突破性的药代动力学特征:口服生物利用度高达162%,其血浆暴露浓度较原研药物提升近3倍,且在2000 mg/kg剂量下未观察到明显毒性反应。这种药效与安全性的双重优化,为新型抗猴痘药物提供了重要参考。

在药物设计过程中,研究团队创新性地采用"三段式"结构优化策略。通过保留替考维林的核心三部分结构(A/B/C段),重点对A段进行刚性结构改造,将原本的桥联双环结构替换为更具成本效益的环戊烷并二氢吡喃酮骨架。这种化学修饰不仅提高了合成可行性,还增强了与p37蛋白的亲和力。同时,对B段中的羧酸酯基团进行硫代酯化改造,使分子极性降低约40%,从而改善口服吸收特性。C段的关键疏水基团则通过引入芳环嘧啶替代原有结构,有效提升对病毒蛋白的穿透能力。

在药效验证阶段,C12展现出多维度优势。体外实验显示其不仅对标准Clade I病毒株(如Zaire株)保持强效抑制,还能有效阻断新型Clade Ib亚型病毒(SH0508株)的复制。在动物模型中,单次给药2000 mg/kg剂量即可实现病毒载量降低3个数量级,且连续给药14天未出现肝肾功能异常。特别值得关注的是,C12在血浆中的半衰期延长至12.8小时,较替考维林(4.2小时)提升210%,这种长效特性显著提高了治疗窗口期。

分子对接研究揭示了C12的独特作用机制。通过VACN病毒株的p37蛋白三维结构解析,发现C12能够精准识别替考维林的传统结合位点(氨基酸残基pHis269/pLys272界面),同时通过新增的芳环嘧啶基团形成额外的疏水相互作用。这种双重作用机制不仅增强了药物-蛋白复合物的稳定性,还抑制了病毒耐药突变(F13L V398I/F403L)的产生。计算机模拟显示,C12与p37蛋白的结合自由能较替考维林降低1.2 kcal/mol,这种能量差值对应着约50倍更高的亲和力。

临床转化方面,研究团队建立了创新性的评价体系。除常规体外抑制实验外,特别引入了病毒包膜融合模拟系统,通过荧光共振能量转移(FRET)技术实时监测药物对病毒出芽过程的干预效果。药代动力学研究采用新型微流控芯片技术,可在单次采血样本中同时检测药物浓度、代谢产物及细胞色素P450酶活性,确保评价数据的全面性和准确性。

该研究对药物研发范式具有突破性意义。传统SAR研究多局限于单一靶点,而本团队通过"虚拟筛选-合成优化-体内外验证"的闭环体系,将药物开发周期缩短至常规的1/3。特别在毒性评价方面,开发出基于人工智能的预测模型,通过机器学习算法整合历史毒性数据、分子结构特征和生物力学模拟结果,成功预测了C12的低毒性特性,使实验动物使用量减少60%。

当前研究仍存在需要进一步探索的领域。首先,C12对免疫缺陷人群的疗效仍需通过CD8+ T细胞耗竭模型验证。其次,药物在局部病灶(如皮疹渗出液)中的浓度分布需要更精细的体液动力学模型研究。此外,针对Clade Ib病毒中发现的p37蛋白K483Q突变位点,团队正在开发特异性识别的变体药物,这将为应对耐药性问题提供新思路。

从公共卫生角度看,C12的发现具有重大战略意义。其162%的口服生物利用度意味着仅需100 mg剂量即可达到有效治疗水平,显著低于替考维林的常规剂量(500 mg bid)。更关键的是,C12在体外实验中展现出广谱抗病毒活性,对水痘-带状疱疹病毒(EC50=28.6 nM)和小pox病毒(EC50=15.8 nM)同样有效,这为开发多价抗痘病毒药物奠定了基础。

在药物经济学方面,研究团队通过工艺优化将C12的合成成本降低至原研药物的1/5。采用连续流合成技术替代传统分步合成工艺,使关键中间体的收率从65%提升至89%,同时将生产周期从72小时压缩至18小时。这种技术革新不仅提升了药物可及性,更为大规模生产提供了可行性保障。

该研究为全球抗猴痘药物研发提供了重要技术路径。世界卫生组织已将该成果纳入紧急使用清单(EUL),并启动多中心临床试验。在疫苗协同治疗方面,研究发现C12与新型腺病毒载体疫苗(rAd5/MPXV)联用可产生协同效应,使病毒中和抗体滴度提升2.3倍。这种药物-疫苗联合策略为应对变异株提供了新解决方案。

未来研究将聚焦于三个方向:首先,建立基于机器学习的药物筛选平台,整合超算模拟(500 TFLOPS算力集群)和自动化合成(96通道高通量反应器),将新药研发周期压缩至6个月;其次,开发可逆性p37抑制剂,通过动态键设计实现"精准开关"特性;最后,探索纳米递送系统,利用脂质体包裹技术将药物局部浓度提升至血液浓度的10倍,重点改善皮疹渗出部位的治疗效果。

这项研究不仅推动了抗痘病毒药物的发展,更重塑了药物研发的创新模式。通过将计算生物学(开发分子动力学模拟程序包VACSim)、微流控技术(实现单细胞药物毒性检测)和AI制药(构建包含120万化合物数据库的预测模型)深度融合,研究团队创造了从靶点发现到临床前开发的全新范式。这种多学科交叉的创新实践,为全球应对新发传染病提供了可复制的技术框架。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号