极度濒危的海薰衣草（Limonium estevei）的保护基因组学研究：近期面临的遗传瓶颈以及与广泛分布的近缘物种之间的低水平基因渗入

《Conservation Genetics》：Conservation genomics of the critically endangered sea lavender Limonium estevei: a recent bottleneck and low introgression from a widespread congener

地中海东南部濒危海悬崖（Limonium estevei）的生殖系统及基因组分析显示其遗传多样性极低，种群在5000年前快速扩张后因近世纪人类活动出现严重瓶颈，与广泛近缘种L. cossonianum存在单向杂交入侵。需结合基因组管理、栖息地保护与长期监测实施精准 conservation。

　　

摘要

地中海盆地拥有全球10%的植物多样性，以其丰富的特有物种而闻名。尤其是伊比利亚东南部地区，是一个重要的植物多样性热点。上个世纪的人类活动，如城市化、栖息地丧失和外来物种入侵，对该地区的生态系统造成了深远影响。海薰衣草（Limonium estevei，属于铅丹科）是一种极度濒危的狭域特有物种，其种群分布极为有限且分散。本文收集了关于其未知繁殖系统的信息，并利用全基因组单核苷酸多态性（SNP）数据来研究其种群多样性和结构，评估其与广泛分布的近缘种L. cossonianum之间的潜在杂交情况，并重建其种群进化动态。研究结果表明：L. estevei是一种二倍体、通过有性繁殖的物种，其繁殖依赖于孢子体的自交不亲和性。该物种的遗传多样性极低，基因流受限，有效种群规模也极小，这些因素共同增加了其灭绝风险。种群动态分析显示，该物种在约5000年前开始迅速扩张，这与过去的气候变化及该地区的干旱化过程有关；随后由于上个世纪人类活动的强烈影响，其种群数量出现了显著下降。虽然杂交现象较为罕见，但有趣的是，主要发生的是从L. estevei向L. cossonianum的基因渗入。这些发现凸显了实施针对性保护措施的紧迫性，以确保L. estevei的生存。高分辨率基因组数据的整合能够显著提升保护工作的效果。我们提倡将数据驱动的遗传管理与原地保护、异地保护以及长期种群监测相结合。