《Journal of Hospital Infection》：Screening of Carbapenemase-producing organisms and Vancomycin Resistant Enterococci by a molecular approach: impact and lessons learned
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快速直肠PCR筛查显著缩短了广泛耐药菌（eXDR）检测的周转时间（中位数22.7小时 vs 43.5小时），且未增加成本并减少患者接触（p=0.001），在低流行地区有效。
克莱尔·丁（Claire Dinh）| 奥蕾莉·埃内比克（Aurélie Hennebique）| 梅拉尼·维洛索（Mélanie Veloso）| 尼古拉·贡内（Nicolas Gonnet）| 伊莎贝尔·佩卢（Isabelle Pelloux）| 桑德拉·大卫-丘达（Sandra David-Tchouda）| 卡罗琳·兰德勒（Caroline Landelle）| 桑德琳·布瓦塞（Sandrine Boisset）
法国格勒诺布尔阿尔卑斯大学医院（Grenoble Alpes University Hospital）医院卫生科
摘要 背景 快速检测新兴广谱耐药细菌（eXDR）的携带者，特别是产生碳青霉烯酶的微生物和耐万古霉素的肠球菌，对于控制其传播和预防感染至关重要。本研究评估了在常规实验室条件下，PCR方法与培养方法在检测eXDR方面的周转时间（TAT）的影响，不包括夜间或周末的分析。
方法 本研究在一家法国大学医院进行了前后对比研究。第一阶段（培养）从2022年2月持续到9月，第二阶段（PCR）从2022年9月持续到2023年3月。周转时间定义为从样本采集到结果交付给感染控制团队和/或医生的时间。纳入标准为年龄超过18岁且符合特定筛查条件的患者。本研究使用了两种PCR试剂盒：BD MAXTM Check-Points CPO试剂盒和VIASURE耐万古霉素实时PCR检测试剂盒。该研究已注册在
ClinicalTrials.gov （NCT05200546）。
结果 第一阶段共纳入2049名患者，第二阶段共纳入1861名患者。第一阶段有16名患者首次检测出eXDR阳性，第二阶段有25名患者。第二阶段的中位周转时间为22.7小时（16.0-41.3小时），显著短于第一阶段的43.5小时（31.9-69.7小时；p=0.001）。与第二阶段相比，第二阶段患者接触者的中位数显著减少。无论采用何种eXDR检测方法，总筛查次数和住院费用均无显著差异。
结论
在低流行背景下，使用PCR进行快速直肠筛查可显著缩短结果周转时间，且不会增加成本。
引言 新兴广谱耐药细菌（eXDR），尤其是产生碳青霉烯酶的微生物（CPO）和耐万古霉素的肠球菌（VRE）的全球传播已成为严重的公共卫生威胁。在欧洲，近三分之一的国家报告称Klebsiella pneumoniae 的碳青霉烯耐药率超过10%，而VRE的平均耐药率从2018年的16.2%上升至2022年的17.6%。
检测CPO和/或VRE的携带者对于控制其传播和预防感染至关重要。健康携带者可能成为传播的媒介，因此筛查非常重要。在法国，多年来一直采用针对高风险患者的直肠培养方法进行监测。研究表明，在法国医院治疗一名CPO患者需额外花费642,104欧元。CPO疫情的估计成本为110万欧元，而VRE疫情的成本约为60,524欧元。采取预防措施更有可能阻止疫情爆发，并且成本低于应对已发生的疫情。
因此，实验室提供筛查结果的周转时间（TAT）对于实施预防措施至关重要。
我们假设更快地识别VRE和CPO有助于立即实施控制策略和/或为患者开始适当的治疗。然而，基于PCR的检测方法通常比培养方法更昂贵，这可能限制了在试剂预算有限的实验室中的使用。本研究旨在衡量PCR在检测CPO和VRE方面对eXDR检测周转时间的影响，并评估其对感染控制和预防（ICP）措施（如隔离、接触者数量、传播途径）以及医疗成本的影响。
研究设计 这项前瞻性、单中心、前后对比研究在法国格勒诺布尔阿尔卑斯大学医院（CHUGA）进行，该医院是一家拥有1,989张床位的教学医院，每年约有460,000个住院日。在我们的医院中，产生碳青霉烯酶的肠杆菌科细菌和产生碳青霉烯酶的葡萄糖非发酵革兰氏阴性杆菌均被视为新兴广谱耐药细菌（eXDR）。第一阶段仅使用培养技术
结果 第一阶段共有2049名患者在2,347次住院期间接受了采样，其中139份样本（5.3%）来自高风险患者；第二阶段共有1861名患者在2,114次住院期间接受了采样，其中165份样本（6.8%）来自高风险患者。大多数高风险患者曾在过去一年内曾在国外住院，而低风险患者主要因为过去一年内至少有过一次住院经历而被筛查（图1）。研究人群的中位年龄为
讨论 我们的研究表明，基于PCR测试的快速直肠筛查策略显著缩短了新确诊eXDR阳性患者从样本采集到结果交付给医生和/或ICP团队的时间。如果在患者入院后48小时内进行筛查，使用PCR的方法相比培养方法，接触者的数量显著减少。无论采用何种技术，患者的住院费用均相似
结论 使用PCR测试进行快速直肠筛查在降低结果周转时间方面具有显著优势，尤其是在低流行背景下，且无需改变实验室的组织结构。需要一项高质量的证据水平的研究，例如在高流行地区进行的多中心随机对照研究，以进一步明确观察到的临床和经济趋势。
CRediT作者贡献声明 桑德琳·布瓦塞（Sandrine Boisset）： 撰写——审稿与编辑、撰写——初稿、监督、方法学、资金获取、数据分析、概念构思。奥蕾莉·埃内比克（Aurélie Hennebique）： 研究工作。克莱尔·丁（Claire Dinh）： 研究工作、数据管理。卡罗琳·兰德勒（Caroline Landelle）： 撰写——初稿、监督、方法学、研究工作、资金获取、概念构思。尼古拉·贡内（Nicolas Gonnet）： 项目管理。梅拉尼·维洛索（Mélanie Veloso）： 数据分析。桑德拉·大卫-丘达（Sandra David-Tchouda）： 方法学、数据分析。
数据和材料的获取
本研究使用和/或分析的数据集可向相应作者提出合理请求后获取。
伦理批准和参与同意
本研究于2002年5月17日获得国家伦理委员会的评估和批准，批准号为21.03247.000043。
出版同意
不适用。
资助
本研究部分得到了MIAI@Grenoble Alpes（ANR-19-P3IA-0003）和贝克顿迪金森公司（BD）的支持。BD提供了BD MAX仪器和所有PCR试剂。资助方未参与研究的实施、数据收集、管理和分析，也未参与手稿的撰写。
利益冲突
不适用。
致谢
作者感谢凯文·桑切斯（Kevin Sanchez）、范妮·拉诺（Fanny Lanoe）和卡米尔·布鲁内（Camille Brunet）进行CPO和VRE的PCR检测工作。
