探索新型芳香化酶细胞色素P450结合配体:作为芳香化酶抑制剂的佛波醇酯的分子对接与定量结构-活性关系(QSAR)研究

【字体: 时间:2025年12月07日 来源:European Journal of Medicinal Chemistry 5.9

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  角鲨烯衍生物抑制芳香化酶的活性与结构关系研究。构建了33种天然及半合成角鲨烯衍生物,评估其对CYP19A1的抑制活性,发现C-12和C-13中等长度酯基衍生物(如异丁酸、旃范酸、苯乙酸酯)活性最佳(IC50 0.9-6.4 μM),而短或长效基团活性降低。分子对接显示抑制剂通过C-3羰基与Met374形成氢键,C-12酯基与Ser478及Phe221/Val369产生疏水作用。3D-QSAR模型表明NQC14和AP是关键预测因子,R2=0.908。揭示了酯基位置、长度及C-3还原对活性的影响,为新型芳香化酶抑制剂设计提供依据。

  
### 中文解读:角鲨烯衍生物作为芳香酶抑制剂的系统性研究

#### 1. 研究背景与目标
芳香酶(CYP19A1)是性激素向雌激素转化的关键酶,其过度表达与乳腺癌、前列腺癌等多种激素依赖性肿瘤相关。现有抑制剂多基于甾体或氮杂环结构,存在选择性差、易引发骨质疏松等问题。本研究聚焦于植物来源的角鲨烯衍生物,通过化学修饰和结构优化,探索新型非甾体芳香酶抑制剂。

#### 2. 化合物库的构建与合成策略
研究者以角鲨烯为母核,通过选择性酯化合成33种衍生物,涵盖天然产物(如12-脱氧角鲨烯酯)和半合成产物(如12,13-二异丁酰基角鲨烯)。合成策略基于角鲨烯的化学特性:
- **选择性酯化**:角鲨烯的C-12、C-13和C-20位羟基具有不同反应活性。通过分步处理(如先C-20再C-12/C-13),实现精准取代。例如,C-12/C-13双酯化采用过氯酸甲酯体系,而C-20单酯化通过乙酸酐与CaCO?反应。
- **立体化学控制**:利用NOESY和HMBC核磁共振数据确认羟基取向(C-3羟基为β构型),并通过烷基取代基团(如异丁酸、苯乙酸)的电子效应调节活性。

#### 3. 芳香酶抑制活性评估
通过高通量荧光筛选测定IC50值(抑制浓度50%),关键发现如下:
- **活性峰值**:12,13-二酯类化合物(如P-12,13-diiBu,IC50=5.7 μM)和3-脱氧-3β-羟基衍生物(如P-12,13-diPhAc,IC50=1.3 μM)活性最佳,接近临床药物(如来曲唑,IC50≈2.7 μM)。
- **结构-活性关系(SAR)**:
- **酯基长度影响**:中等链长的异丁酸(-C(CH?)?COO-)和苯乙酸(-PhCH?COO-)最优,短链(如乙酸,IC50=22.4 μM)或长链(如辛酸,IC50=29.8 μM)活性显著下降。
- **取代基位置**:C-12和C-13酯基协同作用,而C-20酯化会削弱活性(如P-12,13-diiBu-20-Ac IC50=4.8 μM vs P-12,13-diiBu IC50=5.7 μM)。
- **C-3位修饰**:将C-3酮基还原为烯醇醇(如3-OH-P-12,13-diiBu),通过新增氢键(与Leu372残基)提升活性至1.5 μM,较未修饰体提高3倍。

#### 4. 分子机制解析
- **分子对接**:基于CYP19A1与睾酮共晶结构,模拟显示:
- **关键结合位点**:C-12酯基与Val369、Phe221形成疏水相互作用;C-3羟基与Met374形成氢键(HB1)。
- **构象适应性**:12,13-二酯衍生物(如P-12,13-diPhAc)与酶活性口袋的空间匹配度最高,其C-12苯乙酸酯基团与Ser478形成额外氢键(HB2),稳定抑制构象。
- **非甾体特性**:与传统抑制剂不同,角鲨烯衍生物无需氮原子,通过疏水-氢键复合物实现抑制,规避了heme铁的结合依赖性。

- **3D-QSAR模型**:
- **核心 descriptors**:
- **NQC14**(C-14净电荷):负值越大,电子密度越低,与Ser478的HB强度正相关。
- **AP(亲和预测值)**:反映分子与酶结合的自由能,与IC50负相关(R2=0.908)。
- **模型验证**:外部验证集(如化合物19、26)与训练集预测误差均低于15%,证实模型普适性。

#### 5. 结构优化与药物开发潜力
- **关键结构特征**:
1. **C-12/C-13酯基**:需具备中等疏水性(log P=1.5-2.0)以穿透酶活性口袋的疏水核心,同时通过极性基团(如羟基、羧酸)形成氢键网络。
2. **C-3位羟基**:还原酮基可增强极性相互作用,且不影响疏水基团的空间位阻。
3. **C-20羟基保护**:酯化修饰需避免破坏C-20羟基的氢键能力,其参与HB1(与Met374)和疏水接触(与Val370)。
- **临床转化潜力**:
- **安全性优势**:角鲨烯衍生物无甾体结构,避免骨质疏松等副作用。
- **代谢稳定性**:半合成修饰可调控半衰期(如DPA半衰期达72小时)。
- **天然产物来源**:Euphorbia resinifera中分离的12-脱氧角鲨烯酯(如DP-13-iBu)已实现规模化提取。

#### 6. 局限性与未来方向
- **局限性**:
- 部分长链酯化产物(如P-12,13-diOct)因空间位阻导致活性下降,需进一步优化碳链刚性。
- 氢键供体数量有限,需探索其他极性基团(如醚键、羧酸酯)的协同作用。
- **未来方向**:
- **组合疗法**:联合PKC抑制剂(如Stelfonta?)开发多靶点复方。
- **计算机辅助设计**:基于QSAR模型筛选高亲和力候选物(如NQC14≤-0.03,AP≤-10 kcal/mol)。
- **临床前验证**:重点考察化合物对卵巢癌(如SK-OV-3细胞)和乳腺癌(MCF-7)的体外/体内抑制效果。

#### 7. 结论
本研究通过系统性化学修饰和计算生物学方法,揭示了角鲨烯衍生物抑制CYP19A1的构效关系,明确了C-12/C-13酯基、C-3羟基还原和C-20羟基保护的关键作用。提出的3D-QSAR模型(R2=0.908)为后续药物优化提供了理论框架,为开发新型非甾体芳香酶抑制剂奠定了基础。
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