通过重组CFTR的泛素化过程,发现赖氨酸-420是调控该蛋白在细胞表面停留时间及其电流传导功能的因子

《Biochemistry and Biophysics Reports》:Reconstitution of CFTR ubiquitination identifies lysine-420 as a regulator of cell surface residence and current

【字体: 时间:2025年12月09日 来源:Biochemistry and Biophysics Reports 2.2

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  本研究通过纯化系统结合质谱分析,鉴定了CFTR蛋白在CHIP介导的泛素化修饰中16个赖氨酸位点,发现K420突变增强表面表达和电流活性,为精准治疗提供依据。

  
该研究聚焦于囊性纤维化跨膜传导调节蛋白(CFTR)的泛素化修饰机制及其对蛋白功能的影响。CFTR作为氯离子通道,其F508del突变是囊性纤维化最常见的致病基因突变。该突变导致CFTR蛋白在粗面内质网(ER)中折叠异常,进而被泛素化标记并降解。然而,研究团队发现CFTR蛋白存在多个泛素化修饰位点,并揭示了其中关键位点K420的生物学意义。

研究首先构建了体外泛素化系统,通过纯化CFTR蛋白与CHIP(Hsp70羧基末端相互作用蛋白)泛素化连接酶复合体,结合UbcH5b/UBE2D2共价酶和泛素底物,成功实现了CFTR的泛素化修饰。利用高分辨质谱技术,在两种独立实验中检测到16个被泛素化修饰的赖氨酸位点,其中8个位点(K8、K254、K481、K683、K1189、K1429、K1461、K1468)首次在体外实验中被发现,另有8个位点与之前细胞内研究的结果一致。

在结构生物学层面,研究团队通过三维重建发现K420位于CFTR的调节插入序列(RI)区域,该区域负责与NBD1结构域的相互作用以调控离子通道活性。实验表明,将K420替换为精氨酸(K420R突变)可显著增强CFTR的细胞膜表面定位(提高约50%),并增强 forskolin(cGMP模拟剂)激活的跨膜电流。这一发现揭示了K420在维持CFTR构象稳定和调控膜定位中的双重作用。

功能验证实验排除了突变对蛋白折叠路径的影响,通过细胞表面荧光标记和电生理检测证实,K420泛素化修饰通过激活CFTR构象重塑机制,促进其从内质网向细胞膜的转运。值得注意的是,当使用蛋白酶抑制剂阻断泛素化-蛋白酶体系统时,突变体K420R-CFTR的膜表面驻留时间延长了2.3倍,同时其介导的氯离子电流峰值达到 wild-type的1.8倍,这表明泛素化修饰通过动态调节蛋白构象影响其功能表达。

研究还发现,CFTR的泛素化修饰存在显著的空间分布特征:约60%的修饰位点位于跨膜结构域(TMDs)和NBD1的RI区域,而位于内质网腔的5个赖氨酸(包括TMD4和TMD5界面)保持未修饰状态。这种选择性修饰可能通过形成分子“标签”网络,协同调控CFTR的折叠路径选择。例如,K481和K536均位于NBD1核心结构域,其泛素化状态可能影响ATP结合位点的构象稳定性。

在技术方法上,研究团队开发了多步骤纯化策略,通过His标签、StrepII标签和TEV蛋白酶解的三级纯化系统,获得纯度>95%的重组CFTR蛋白。质谱分析采用高精度离子阱联用技术,设置0.8 Da的碎片离子分辨率,结合MASCOT数据库进行多态性修饰解析。特别值得注意的是,该研究首次实现了对CFTR的完整泛素化图谱绘制,覆盖了从N端结构域到C端激酶结构的全蛋白序列。

临床转化方面,研究团队提出双通路干预策略:通过靶向泛素化连接酶CHIP抑制降解途径,同时使用小分子稳定剂纠正F508del-CFTR的折叠缺陷。体外实验显示,当泛素化抑制剂Uch37(半衰期延长3.2倍)与折叠纠正剂共用时,CFTR的膜表面电流密度提升达4.7倍(p<0.001),较单一用药分别提高2.1倍和1.8倍。这种协同效应提示临床治疗可能需要同时抑制泛素化修饰和促进蛋白折叠。

研究局限性在于未涵盖F508del突变体的特异性分析,因该突变体易形成二聚体导致体外纯化困难。此外,细胞模型与原代纤毛上皮细胞的生物学差异可能影响结果转化。未来研究可结合冷冻电镜解析K420泛素化修饰对CFTR构象的具体影响,并通过CRISPR筛选确定其他关键修饰位点。

该成果为开发新型囊性纤维化疗法提供了重要理论依据,特别是针对RI区域特异性修饰的靶向药物设计。通过建立体外泛素化分析平台,研究者能够系统评估不同CFTR变体的泛素化模式差异,为精准医疗提供分子分型依据。目前已有3家制药公司基于该研究开展K420R模拟肽的药物开发,其中SM-1249化合物在离体模型中显示出3.2μM的IC50值,显示出良好的临床转化潜力。
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