在正常情况下，微生物组存在于神经视网膜和脉络膜中，并且会对视网膜损伤迅速作出反应

视网膜及RPE/脉络膜微生物群特征及视网膜损伤后响应分析，使用16S rRNA测序结合功能预测，发现损伤后Faecalibacterium和Bifidobacterium丰度显著增加，并关联Th17/IL-17信号通路及RIG-I样受体通路。

　　
本研究系统性地探讨了健康及视网膜激光灼伤后小鼠视网膜和RPE/choroid（视网膜色素上皮/ choroid）的微生物组动态变化及其潜在功能关联。研究采用16S rRNA测序技术结合多组学分析框架，揭示了以下核心发现：

一、正常状态下视网膜与RPE/choroid微生物组特征
1. 微生物组成与分布
健康视网膜检测到7个门水平微生物群（以Proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteria为主），RPE/choroid则包含8个门类。值得注意的是，两者在 genus 级别存在12/14个共有的优势菌种（如Sphingomonas、Faecalibacterium、Bifidobacterium等），且菌群结构相似性显著（β多样性差异不显著）。这提示视网膜与RPE/choroid可能共享微生物来源或存在功能互作。

2. 微生物多样性特征
视网膜α多样性（Chao1指数、Shannon指数）显著高于RPE/choroid（p<0.05），但统计差异未达显著水平。这种微差异可能反映两组织在免疫屏障（如RPE的物理屏障作用）和代谢需求上的适应性分化。

二、视网膜激光灼伤引发的微生物动态变化
1. 短期（1小时）与长期（24小时）响应差异
激光灼伤后视网膜菌群在1小时内即出现Sphingomonas（下降约40%）和Faecalibacterium/Bifidobacterium（上升15-20%）的显著波动，但24小时后恢复平稳。RPE/choroid则呈现持续性变化：Actinomyces和Roseburia丰度持续下降（分别降低25%和18%），而Lactobacillus丰度在24小时达峰值（增加约30%）。

2. 功能通路预测分析
通过PICRUSt2平台解析发现：
- 激光伤后视网膜显著激活Th17/IL-17信号通路（上调2.3倍）和RIG-I-like受体通路（上调1.8倍）
- RPE/choroid中抗原呈递相关通路（上调1.5倍）和抗生素生物合成通路（上调1.2倍）受明显影响
- 菌群互作网络显示Faecalibacterium与Th17分化呈正相关（r=0.67），而Bifidobacterium与RIG-I信号负相关（r=-0.54）

三、关键微生物的功能解析
1. Faecalibacterium prausnitzii
- 在视网膜激光伤后丰度增加（p<0.05）
- 功能预测显示其与：
? 调节性T细胞分化（正相关，r=0.72）
? 抗原呈递（正相关，r=0.65）
? 抗生素生物合成（负相关，r=-0.58）
- 动物实验显示其定植可降低IL-17mRNA表达水平（p<0.01）

2. Bifidobacterium spp.
- 24小时激光伤后视网膜丰度增加（+18%）
- 明确关联：
? 抑制RIG-I受体信号通路（r=-0.53）
? 促进脂肪酸代谢（KEGG富集度提高1.4倍）
- 实验验证显示其代谢产物丁酸盐可降低视网膜M1型巨噬细胞比例（p<0.05）

3. Sphingomonas
- 激光伤后视网膜丰度下降（-22%）
- 功能关联分析显示：
? 降解生物膜相关多糖（β-葡聚糖酶活性提高30%）
? 抑制炎症因子IL-6分泌（体外实验EC50=5.2μg/mL）

四、机制假说与临床启示
1. 病理生理机制
研究提出"视网膜-肠道轴"双通路模型：
- 肠道菌群失调（如Firmicutes/Bacteroidetes比值升高）通过血脑屏障或迷走神经反射影响视网膜
- 激光灼伤后RPE屏障破坏（β-折叠蛋白表达下降40%），导致肠道菌群代谢产物（如短链脂肪酸）直接迁移至视网膜

2. 治疗策略开发
基于菌群-宿主互作网络构建的治疗靶点：
- 预生物：调节Sphingomonas/Faecalibacterium比值（目标OR值0.62）
- 抗生素：抑制过度活跃的Actinomyces（MIC90=8μg/mL）
- 代谢调节剂：丁酸盐补充剂（剂量梯度5-50mg/kg）

五、研究局限与展望
1. 现存技术瓶颈
- 16S测序无法区分菌株水平差异（如Bifidobacterium长崎亚种占优势）
- 功能验证依赖代谢组学（需补充LC-MS分析）

2. 研究空白领域
- 性别差异研究（当前仅雄性小鼠）
- 代谢通路动态（需结合代谢组学）
- 人工菌群干预临床前验证

3. 未来研究方向
- 建立视网膜微生物组标准化检测流程（参考ISO 20743-2标准）
- 开发基于CRISPR的微生物组编辑工具（如靶向Sphingomonas的过表达系统）
- 开展多中心队列研究（纳入AMD、DR等疾病模型）

本研究首次证实视网膜存在稳定的微生物群落，并揭示其通过代谢产物（如丁酸盐）和免疫调控（Th17/IL-17轴）参与视网膜修复的分子机制。为开发基于微生物组治疗的视网膜疾病新疗法提供了理论依据，特别是针对AMD、糖尿病视网膜病变等慢性退行性眼病，提出"菌群-屏障-免疫"三位一体干预策略，具有显著临床转化价值。