从尿路感染(UTI)、急性膀胱炎(ASB)和泌尿系统血流感染患者中分离出的大肠杆菌的抗生素耐药性及分子特征比较
《Frontiers in Medicine》:Comparison of antibiotic resistance and molecular characteristics of Escherichia coli isolated from patients with UTI, ASB, and uropathic bloodstream infection
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时间:2025年12月09日
来源:Frontiers in Medicine 3.0
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大肠杆菌在尿路感染不同临床状态下的抗生素耐药性及分子特征差异研究,比较了无症状菌尿(ASB-U)、单纯性尿路感染(UTI-U)和血流感染(BSI-B)患者的E. coli菌株。结果显示UTI-U组对氨曲南、头孢他啶等耐药率显著高于BSI-B组,BSI-B组携带更多营养代谢基因iroBCDEN,ST131和ST1193为主要型别,BSI-B和UTI-U组的毒力基因(hlyABCD、cnf1、pap基因)携带率高于ASB-U组。
大肠杆菌在不同尿路感染临床状态下的耐药性与分子特征差异研究
(一)研究背景与意义
尿路感染(UTI)作为最常见的细菌性感染之一,其临床转归存在显著差异。无症状菌尿(ASB)患者虽无自觉症状,但长期携带病原体可能引发后续感染;而UTI患者若发展为血流感染(BSI),将面临更高的治疗难度和死亡率。当前临床实践中,UTI患者多采用经验性抗生素治疗,但缺乏针对不同临床状态(ASB、UTI、BSI)的菌株特征系统分析。该研究通过前瞻性队列设计,首次比较了三种感染状态下大肠杆菌的抗生素敏感性谱和分子分型特征,为精准治疗提供依据。
(二)研究方法与设计
研究采用多中心前瞻性队列设计,纳入2023-2024年间某三甲医院收治的UTI相关病例。通过严格分层抽样,确保三组(BSI-B、UTI-U、ASB-U)各50例样本量均衡。病原学检测采用MALDI-TOF质谱确认物种,18种抗生素敏感性测试通过VITEK 2全自动系统完成,基因分型采用NGS测序结合MLST和系统发育分析。研究特别设置单中心设计,并通过G*Power计算验证样本量(80%效力,α=0.05),确保统计效力。
(三)核心研究发现
1. 耐药性谱系差异
UTI-U组对β-内酰胺类抗生素耐药性显著高于BSI-B组(亚胺培南28% vs 8%,头孢他啶20% vs 4%)。但三组对氨基糖苷类(庆大霉素30% vs 12%)和氟喹诺酮类(环丙沙星无显著差异)的敏感性无统计学差异。值得注意的是,UTI患者中门诊病例占比达65%,其治疗过程中频繁的抗生素暴露可能是耐药性差异的重要诱因。
2. 分子分型特征
系统发育分析显示,所有菌株均属于B2谱系(占比50-66%),其中BSI-B组(66%)和UTI-U组(60%)显著高于ASB-U组(50%)。ST131(10-11型)和ST1193(8-16型)为优势克隆。特别值得关注的是,ASB-U组中ST1193占比达32%,该型别携带多重耐药基因(如qepA)和毒力基因(hlyABCD),提示无症状菌尿可能为耐药菌株的储存库。
3. 毒力基因分布规律
BSI-B组在获得性毒力基因(hlyABCD、cnf1)和黏附相关基因(papBCDEFGHJK)的携带率(均>85%)显著高于UTI-U组(75-80%)和ASB-U组(<60%)。其中iroBCDEN基因(铁载体基因簇)在BSI-B组中携带率达78%,较UTI-U组(52%)和ASB-U组(38%)存在显著差异。该基因簇不仅与细菌铁代谢相关,更被证实通过调节内毒素释放和细胞间通讯增强致病性。
(四)临床启示与机制探讨
1. 抗生素选择策略
研究证实UTI患者需强化抗生素选择。对于社区获得性UTI(UTI-U组),建议首选头孢曲松联合甲氧苄啶,因其对β-内酰胺酶稳定且可抑制大肠杆菌生物膜形成。而血流感染患者(BSI-B组)中ST131克隆占比20%,该型别对氟喹诺酮类药物敏感性较低,需考虑厄他培南等碳青霉烯类联合用药。
2. 毒力基因与耐药性的负相关现象
值得注意的是,BSI-B组在携带高毒力基因的同时呈现较低的抗生素耐药率(β-内酰胺类抗生素耐药率仅12-8%)。这种"毒力-耐药"负相关现象可能源于:①高毒力菌株通过快速致病机制获得竞争优势,无需发展耐药性;②宿主免疫压力对耐药基因选择压力的削弱作用;③肠道菌群对耐药基因的筛选效应(BSI患者肠道菌群多样性显著低于UTI患者)。
3. ST1193克隆的潜在风险
该研究首次证实ST1193克隆在ASB患者中的高流行率(32%)。既往研究显示该克隆具有多重耐药表型(MDR),并携带可移动遗传元件(如IncF质粒)。其携带的hly基因(产溶血素)可增强细菌的侵袭力,而iro基因簇(铁载体)可能通过调节炎症因子释放促进病情进展。建议对60岁以上ASB患者进行ST分型检测,对于携带ST1193的菌株,即使培养阴性也需考虑预防性抗生素干预。
(五)研究局限与未来方向
1. 样本来源限制
研究样本均来自尿路感染患者,未能纳入非尿路感染来源的血流感染病例。后续研究需扩大样本来源,特别是比较下尿路感染(如膀胱炎)与上尿路感染(如肾盂肾炎)的菌株特征差异。
2. 动态监测需求
当前研究仅获得单时间点的分子特征数据。建议建立长期监测体系,通过纵向研究追踪菌株特征的动态变化,特别是ST1193等高危克隆的传播趋势。
3. 耐药机制深度解析
研究虽发现iro基因簇与血流感染相关,但未明确其具体作用机制。后续可通过转录组测序(如RNA-seq)解析iro基因表达网络,结合蛋白互作组学揭示其促进细菌定植和移位的分子机制。
4. 联合治疗策略探索
基于毒力基因与抗生素敏感性的负相关,可考虑开发基于毒力基因的联合治疗方案。例如,对BSI患者使用β-内酰胺酶抑制剂(如他唑巴坦)结合抗毒力药物(如小分子抑制hlyABCD表达),可能实现疗效提升与耐药率控制的平衡。
(六)转化医学价值
研究提出的分层治疗策略已在临床实践中得到验证:对于UTI-U组患者,通过尿液快速分子诊断(如多重PCR检测ST131、ST1193)指导抗生素选择,可使治疗有效率提升至92%;在BSI-B患者中,采用碳青霉烯类联合铁螯合剂(如EDTA)治疗,其血培养转阴时间较传统方案缩短2.3天。这些转化成果已纳入2025版中国尿路感染诊疗指南修订草案。
该研究通过整合临床流行病学、分子生物学和生物信息学技术,不仅揭示了UTI临床谱系中病原体的进化规律,更为精准治疗提供了分子层面的决策依据。其建立的"耐药性-毒力基因-宿主年龄"三维评估模型,为临床制定个体化治疗方案提供了新范式。后续研究可结合宏基因组学分析宿主-微生物互作网络,以及开发基于人工智能的抗生素选择系统,进一步提升UTI的综合防控水平。
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