利用序列相关扩增多态性（SRAP）标记评估紫花苜蓿（Medicago sativa L.）的遗传多样性和种群结构

《Genetic Resources and Crop Evolution》：Assessment of genetic diversity and population structure in alfalfa (Medicago sativa L.) using sequence-related amplified polymorphism (SRAP) markers

本研究利用SRAP标记分析85份苜蓿种质遗传多样性，发现存在两个遗传亚群，亚群B遗传多样性更高且分化更低，亚群A分化显著。结果证实SRAP标记能有效解析苜蓿遗传结构，为种质保育和育种选亲提供依据，且基因流较大导致无地理分化。

　　

摘要

培育具有更强环境压力耐受性以及更强的病虫害抗性的品种，需要开展以了解遗传多样性为重点的育种前期工作。在本研究中，使用序列相关扩增多态性（SRAP）标记分析了85个苜蓿基因型。在10种SRAP引物组合中，共扩增出了112个等位基因，每个引物的等位基因数量介于7到19个之间。平均多态性信息含量（PIC）为0.295，表明这些标记的信息量处于中等水平。遗传多样性参数（包括Nei基因多样性He=0.27和Shannon信息指数I=0.42）显示，这些样本之间的遗传变异程度为中等到高。基于Dice相似性系数的聚类分析以及未加权对组平均法（UPGMA）将基因型分为两个主要簇。主成分分析（PCA）进一步证实了这种聚类结果，显示出个体之间的明显遗传差异。利用STRUCTURE软件进行的贝叶斯群体结构分析通过Delta K方法确定，最可能的遗传亚群数量为K=2。大多数基因型的隶属系数（Q≥0.80）较高，表明亚群内部具有较高的遗传同质性。亚群B的遗传多样性较高（He=0.2612），遗传分化程度较低（F_ST=0.2443），而亚群A的遗传差异较大（F_ST=0.3952）。这些结果证明了SRAP标记在解析苜蓿遗传结构方面的有效性，并强调了它们在筛选具有遗传多样性和独特性的个体以用于育种目的时的实用性。此外，基因型之间缺乏明显的地理结构分布，表明各采集点之间存在大量的基因流动。本研究强调了分子遗传特征分析在指导亲本系选择和加强苜蓿品种改良的种质资源保护工作方面的价值。