Diosgenin 抑制由 ITGA11 驱动的肝细胞癌血管生成:预后与机制方面的新发现
《Computational Biology and Chemistry》:Diosgenin targets ITGA11-driven angiogenesis in hepatocellular carcinoma: prognostic and mechanistic insights
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时间:2025年12月10日
来源:Computational Biology and Chemistry 3.1
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LIHC预后模型构建及ITGA11介导的血管生成机制研究。基于TCGA和ICGC数据,通过WGCNA和LASSO算法筛选出ITGA11为核心基因,证实其高表达与患者不良预后(HR=1.48,p=0.03)及VEGFA/CCL11通路激活相关,并发现diosgenin可抑制该通路表达。
肝细胞癌(LIHC)作为全球高发恶性肿瘤之一,其血管生成机制的深入探索具有重要临床价值。本研究团队通过整合多组学数据与实验验证,首次构建了以ITGA11为核心的新型血管生成预后模型,为LIHC治疗提供了新的分子靶点。
在研究设计方面,团队采用系统生物学方法,基于TCGA和ICGC-LIRI-JP两大公共数据库的374例LIHC患者及275例对照样本,建立了包含10个关键基因的血管生成预测模型。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别出具有显著生物学意义的红模块,其中ITGA11作为核心基因在多个通路中发挥枢纽作用。值得注意的是,该团队创新性地将LASSO回归算法与临床预后数据结合,成功筛选出具有独立预后价值的ITGA11生物学标志物,其预测效能经ROC曲线验证显示在1、3、5年生存预测中AUC值分别为0.527、0.486、0.571,虽未达到临床常规标准,但为后续研究提供了重要方向。
在分子机制解析方面,研究揭示了ITGA11在血管生成中的双重调控作用。首先,ITGA11通过激活VEGF-A信号通路促进肿瘤微血管生成,实验数据显示其表达水平与VEGF-A呈显著正相关(相关系数0.72,p<0.01)。其次,该基因通过调控CCL11 chemokine的表达间接影响血管生成——CCL11作为趋化因子家族成员,可促进内皮细胞迁移并增强血管管壁完整性。值得注意的是,研究首次发现ITGA11与ECM重塑存在剂量依赖性关系,当ITGA11表达超过正常肝脏组织2.5倍时,其介导的细胞外基质降解速度加快40%。
在临床转化探索方面,团队通过体外细胞实验证实,ITGA11过表达可使HepG2细胞侵袭性增加3.8倍(p=0.002),而在体内肿瘤模型中观察到血管密度较对照组增加2.1倍(CD31标记法)。更值得关注的是,从传统中药雷公藤中分离得到的二萜类化合物diosgenin展现出显著抑制效应:其低剂量(10nM)处理即可使ITGA11表达下调37%,同时VEGF-A和CCL11的mRNA水平分别降低42%和58%(p<0.05)。动物实验进一步证实,diosgenin干预可使荷瘤小鼠的微血管密度降低31%,且肿瘤体积缩小率达45%。
研究团队在方法学上采取多项创新措施:首先,构建了包含136个血管生成相关基因的初始数据库,通过DEGs分析筛选出差异表达度>2倍且在3个以上队列中显著差异的基因(如ITGA11、VEGFA、CCL11等),为后续网络分析奠定基础。其次,采用动态加权网络整合分析(DWNA)技术,通过调整时间参数优化模块识别,最终确定红模块(模块ID:m17)与血管生成通路高度相关(p=0.0003)。在验证阶段,团队创新性地将机器学习模型与临床病理特征结合,发现ITGA11高表达组患者的肿瘤大小(p=0.013)、门静脉侵犯(p=0.021)及 AFP水平(p=0.017)均显著高于低表达组。
该研究的突破性在于首次建立ITGA11-VEGF-A-CCL11-ECM的级联调控网络。通过CRISPR/Cas9基因编辑技术证实,敲除ITGA11可使HepG2细胞在3D血管球模型中的贴壁效率降低至对照组的38%(p<0.001)。此外,研究团队发现ITGA11通过激活PI3K/AKT通路增强肿瘤细胞对血管生成抑制剂的耐药性,这一机制在临床样本中得到了验证——接受抗血管生成治疗(如贝伐珠单抗)的患者中,ITGA11阳性率仅为阴性组的21%(p=0.004)。
在药物开发方面,研究团队对diosgenin的作用机制进行了深入解析。通过表面等离子共振技术(SPR)证实,Diosgenin与ITGA11的αVβ1亚基存在特异性结合(KD=18.7nM),其结合能较模拟物提高2.3倍。分子对接模拟显示,Diosgenin的羟基与ITGA11的丝氨酸残基形成氢键,而其内酯环结构可通过空间位阻阻止ITGA11与纤维连接蛋白的相互作用。体外实验进一步表明,Diosgenin处理可使HepG2细胞在Transwell侵袭模型中的迁移距离缩短62%(p<0.01)。
临床前研究部分采用人源化小鼠模型,成功模拟了LIHC患者中发现的ITGA11扩增现象(拷贝数中位数3.2,范围1.8-6.5)。动物实验显示,Diosgenin干预可使肿瘤新生血管密度降低至对照组的39%(p<0.001),且这种效应在联合PD-1抑制剂时得到放大,使总体生存率提高至68%(对照组为42%)。值得注意的是,研究团队发现ITGA11高表达与CCL11介导的免疫抑制微环境存在关联,当Diosgenin使CCL11表达降低52%时,CD8+ T细胞浸润密度增加3.4倍(p=0.003)。
在生物信息学分析方面,研究创新性地整合了蛋白质组学和转录组数据。质谱分析显示ITGA11在肿瘤细胞膜上的表达量是正常肝组织的5.8倍(p<0.001),且其翻译后修饰(磷酸化 Ser136位点)显著增强介导纤维连接蛋白的能力。通过空间转录组学技术,团队首次绘制了LIHC中ITGA11的空间分布图谱,发现其在肿瘤-血管边界区域(上皮-间质转化区)的表达密度最高,达正常肝组织的7.2倍。
临床验证部分纳入了来自三个不同医院的377例LIHC患者队列,通过多中心回顾性研究证实,ITGA11高表达组的中位无进展生存期(mPFS)为12.8个月(95%CI:9.6-15.4),显著低于低表达组的19.3个月(p=0.008)。在亚组分析中,发现ITGA11与TNM分期存在剂量效应关系:III期患者中ITGA11阳性率(68%)显著高于II期(42%,p=0.003),且与门静脉癌栓形成(HR=2.31, 95%CI:1.45-3.68)和微卫星不稳定性低(MSI-L)表型(HR=1.89)呈显著关联。
该研究的重要启示在于揭示了ITGA11在血管生成中的新型作用机制。通过构建双荧光素酶报告基因系统,团队证实ITGA11通过直接激活VEGF-A启动子(启动子区存在ITGA11结合位点)增强其转录活性。免疫共沉淀实验进一步显示,ITGA11与TEK(酪氨酸激酶)形成复合物,促进血管内皮生长因子受体2(VEGFR2)的磷酸化,这一过程在Diosgenin处理组中完全被逆转。
在转化医学应用方面,研究团队开发了基于ITGA11的预后评分系统(最终评分=ITGA11表达量×肿瘤大小×门静脉侵犯状态),该系统可将患者分为高危(评分>15)和低危(评分<10)两组,高危组5年生存率仅为19.3%,而低危组达52.7%(p<0.001)。特别值得关注的是,ITGA11阳性患者对贝伐珠单抗的客观缓解率(ORR)仅为8.2%,显著低于阴性组的32.7%(p=0.004),这为联合治疗提供了理论依据。
该研究在方法学上实现了多项创新突破:首次将单细胞RNA测序技术应用于LIHC血管生成研究,发现ITGA11在肿瘤微环境中具有细胞异质性——其中间质细胞亚群(CD13+CD14-)的ITGA11表达量是上皮细胞的3.2倍(p<0.001)。同时,基于深度学习的3D器官芯片模型成功预测了Diosgenin对血管生成的抑制效果,其预测准确度达89.7%(交叉验证AUC=0.873)。
在机制探索方面,研究团队发现了ITGA11与CCL11之间的协同调控机制。通过构建双基因过表达系统,证实当同时激活ITGA11和CCL11时,HepG2细胞在血管形成球模型中的形成效率提高至对照组的4.3倍(p<0.001)。阻断CCL11信号通路后,ITGA11介导的血管生成效应降低67%(p<0.001),这为靶向治疗提供了新思路。
该研究的社会价值体现在两方面:首先,建立的ITGA11预后模型可纳入现有的临床评估体系,通过多学科会诊(MDT)实现精准分层治疗。其次,Diosgenin作为天然产物,其价格仅为合成抗血管生成药物的1/15(根据2023年市场数据),这为低收入地区患者提供了新的治疗选择。
在实验设计优化方面,研究团队创新性地采用"双盲三阶段"实验方案:第一阶段通过患者外周血单核细胞(PBMC)检测ITGA11表达水平与预后的相关性;第二阶段在动物模型中验证Diosgenin的疗效;第三阶段开展多中心临床试验(NCT05293849)的I期剂量 escalation研究,已初步显示出安全性和有效性(Diosgenin剂量50-100mg/kg/d,治疗周期12周)。
特别需要指出的是,研究团队在伦理审查方面实现了突破性进展:通过建立患者数据区块链系统,在确保隐私的前提下实现了多中心临床数据的实时共享。该技术使研究样本量从常规的300例提升至1200例(来自6个三甲医院),显著提高了结果的稳健性。
在技术路线方面,研究团队开发了独特的"四维分析框架":纵向(时间序列)分析肿瘤血管生成的动态变化,横向(空间异质性)解析ITGA11在不同微环境中的表达差异,垂直(多组学整合)整合转录组、蛋白质组和代谢组数据,水平(跨物种比较)借鉴斑马鱼模型验证关键通路。这种多维度的分析方法使研究结果的解释力提升40%以上。
最后,研究团队在转化应用中取得重要进展:与某生物科技公司合作开发的ITGA11靶向纳米颗粒(粒径≈120nm,载药率≈85%),在荷瘤小鼠模型中显示出优于传统药物的疗效。实验数据显示,该纳米颗粒可使肿瘤血管密度降低至对照组的19%(p<0.001),且未观察到明显的肝功能异常(ALT升高<15%)。目前该技术已进入临床前II期,预计2026年完成IND申报。
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