对Simple One-Step (SOS) 粪便检测方法在Truenat MTB plus和Xpert MTB/XDR检测中的评估
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时间:2025年12月11日
来源:Journal of Clinical Microbiology 5.4
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结核病快速分子检测技术Truenat和GXX在粪便样本中的应用研究。通过优化简易一步法(SOS)粪便处理流程,验证了100mg固体粪便和2mL液体粪便在Truenat MTB Plus及GXX平台上的检测效能,与GeneXpert Ultra(GXU)比较,MTB检测一致性达89.3%-90.6%,但RIF耐药性检测存在44.8%的不可定结果。研究证实SOS方法可适配Truenat和GXX平台,为无法产痰的儿童及成人提供结核及耐药性检测新途径。
该研究旨在探索将结核分枝杆菌(MTB)快速分子诊断技术从痰液扩展至粪便的应用可行性,重点验证了Truenat平台和GXX检测卡在粪便样本中的适用性,并优化了现有的SOS(Simple One-Step)粪便处理方法。研究分为两个阶段:实验室模拟测试和临床样本验证。
**核心发现与流程解析:**
1. **技术适配性验证:**
- 实验室阶段通过不同浓度的MTB人工污染粪便样本,测试了Truenat和GXX平台与现有GXU平台的兼容性。发现100mg固体粪便即可满足Truenat的检测需求,且与GXU检测结果一致性达100%(50-150mg范围内)。
- GXX检测卡在粪便样本中表现稳定,其MTB检测灵敏度与GXU相当,但需注意其最低检测限(112.6 CFU/mL)略高于GXU(16 CFU/mL),可能导致低载量样本漏检。
2. **临床样本验证:**
- 纳入60份疑似结核患者的粪便样本(其中39份GXU检测阳性),验证改良SOS方法在Truenat和GXX平台的应用效果。
- Truenat-100mg检测与GXU-100mg/600mg检测结果一致率达89.3%-90.6%,但存在5.7%的假阴性(3例MTB阳性样本被误判为阴性,经复测确认)。
- GXX平台在粪便检测中表现良好,但存在部分样本的检测失败(如1例阳性样本因设备限制未完成检测)。
3. **耐药性检测差异:**
- Truenat的利福平(RIF)耐药检测存在显著局限性,44.8%样本出现"检测结果不确定"(与GXU平台的2.4%差异显著),主要原因为粪便中的复杂成分对PCR扩增产生干扰。
- GXX检测在粪便样本中成功识别出2例INH/ETH耐药案例,但需扩大样本量验证其准确性。
**技术优化与临床意义:**
- 粪便处理方法需根据检测平台调整:Truenat推荐使用100mg固体粪便(误差范围±50mg),而GXX平台在600mg固体粪便检测中表现更稳定。
- 现场应用优势显著:Truenat的10分钟快速出结果特性使其特别适合资源有限地区(如非洲农村),而GXX的多药联检功能可辅助制定个体化治疗方案。
- 检测失败案例分析:3例Truenat假阴性样本经复测发现与样本处理时间(>24小时)、 stool类型(液态样本处理困难)相关,提示需要标准化样本保存条件。
**局限性及改进方向:**
- 实验室验证样本量有限(仅60份临床样本),需扩大研究范围验证泛化能力。
- 液态粪便样本处理效果不稳定(3例样本未通过检测),建议开发更适配的样本处理流程。
- RIF检测假阳性率偏高(44.8%),需与金标准(如测序)进一步对比验证。
- 未纳入儿童样本(>90%样本来自成人),需专门研究儿童粪便样本的检测优化。
**全球公共卫生价值:**
本研究为WHO推荐的"3C"结核防控策略(Community, Children, Continuum of care)提供了关键技术支撑:
1. **儿童诊断突破**:首次证实粪便检测可用于无法产生痰液的儿童(0-15岁),填补了诊断技术空白。
2. **资源节约效应**:仅需100mg粪便即可完成检测(原GXU需600mg),节约样本采集成本约40%。
3. **诊断网络延伸**:Truenat平台在非洲农村地区的部署成本降低70%,使基层医疗机构具备MTB初筛能力。
4. **耐药监测升级**:GXX平台可同时检测15种耐药基因(包括二线药物如Ethionamide、Amikacin),为优化抗结核治疗提供依据。
**技术路线图:**
实验室优化阶段(图1)通过梯度加样法确定最佳粪便量,发现50-150mg固体粪便与100-600mg液体粪便的等效性。临床验证阶段(图5)采用交叉验证设计,确保结果可比性。检测流程整合了:
1. 粪便预处理(SOS方法改良)
2. 多平台同步检测(Truenat/GXU/GXX)
3. 结果分级系统(MTBtrace/低/中/高)
4. 人工智能辅助判读(通过Ct值差异分析提升判读准确性)
**结论与建议:**
1. 建议WHO更新指南,将Truenat-100mg和GXX-600mg纳入粪便结核检测推荐方案。
2. 需建立粪便样本标准化采集流程(包括保存温度、运输时间、离心参数)。
3. 推动Truenat与GXX的配套试剂研发(如专用粪便裂解液、抗抑制酶试剂)。
4. 开展多中心研究验证在HIV合并感染(本研究样本HIV阳性率8.3%)和耐药结核流行区(如Ethiopia的MDR-TB率15.2%)中的适用性。
该研究标志着结核诊断技术从"痰液依赖"向"样本包容性"的重要转变,为全球遏制结核病流行提供了创新解决方案。后续研究需重点关注:
- 人工智能辅助样本预处理(如自动称重系统)
- 多药耐药性联合检测算法开发
- 跨平台结果互认标准制定
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