菌株NBPZ-032于2025年4月从中国湖北省仙桃市（113.4430°N, 30.3278°E）人工养殖的稻田鳝肠道中分离得到。整个肠道被无菌切除，称重10克后置于10毫升无菌磷酸盐缓冲盐水（PBS）中匀浆，随后用PBS进行系列稀释并涂布在溶原菌肉汤（LB）琼脂上。在30°C下孵育2天后（HP150S，瑞华，中国），通过三轮划线法在LB平板上纯化出单个菌落，然后在30°C下用LB培养至对数中期（使用TU-1810分光光度计，PERSEE，中国）。基因组DNA的提取遵循QiAGEN公司的Blood & Cell Culture DNA Mini Kit（Cat#13323）说明书进行，纯度和定量通过NanoDrop One UV-Vis分光光度计（Thermo Fisher Scientific，美国）和Qubit 3.0荧光计（Invitrogen，美国）完成。长读长测序和短读长测序均使用同一份DNA样本进行。长读长测序采用PippinHT系统（Sage Science，美国）对大于10 kb的DNA片段进行选择。DNA文库的制备使用了Ligation Sequencing Kit V14（Cat#SQK-LSK-114；Oxford Nanopore Technologies Ltd. [ONT]，英国牛津），无需DNA剪切，并使用Nanopore PromethION测序仪（ONT）在R10.4.1流动池上进行测序。原始序列的碱基校正、条形码分割和接头序列去除采用Guppy v.5.0.16软件（
4）完成。原始数据（97,502条读长，总计1,144,952,152 bp）的平均读长为11,742.86 bp，N50值为24,867 bp；经过碱基校正和接头去除后得到97,497条读长（总计1,144,951,241 bp）。对于短读长测序，使用Covaris LE220超声仪（美国）将基因组DNA随机片段化，再用MGIEasy DNA Clean Beads（Cat#1000005279，MGI Tech Co., Ltd.，中国）将其筛选至2000-4000 bp大小。DNA文库的制备遵循MGIEasy FS PCR Free DNA library preparation set（Cat#1000013455，MGI）流程。测序在DNBSEQ-T7RS平台上进行，采用150个核苷酸长度的配对末端读长。原始数据（7,247,348条读长，总计1,087,102,200 bp）通过fastp v.0.23.1程序（
5）进行预处理，去除接头和低质量数据，最终得到6,975,838条有效读长（总计1,045,312,346 bp）。
利用Unicycler v.0.5.0软件（
6）将完整基因组（总计3,711,769 bp）组装成两个环状复制子：一个3,359,540 bp的环状染色体（GC含量52.01%，深度296.61×）和一个352,229 bp的环状质粒（GC含量49.75%，深度280.43×）。通过Type (Strain) Genome Server进行的系统发育分析显示，该菌株与
P. shigelloides标准菌株NCTC 10360（NCBI组装编号
GCA_900087055）具有密切的进化关系，这一结论得到了GGDC公式2计算得出的75.6%的DNA-DNA杂交值的支持（
7）。通过NCBI PGAP v.6.10（
8）进行注释，鉴定出3,127个蛋白质编码序列、120个tRNA基因和40个rRNA基因。除非另有说明，本研究均采用默认参数。
