藜麦（Chenopodium quinoa Willd.）中TCP基因家族的全基因组鉴定与表达分析

《Journal of Plant Growth Regulation》：Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the TCP Gene Family in Quinoa (Chenopodium quinoa Willd.)

青稞TCP基因家族首次全基因组鉴定，发现9个CqTCP基因分为CYC/TB1、CIN、PCF三亚家族，染色体分布不均，启动子富集光响应、激素响应等顺式元素，CQ037198在多种胁迫下表达差异显著，为抗逆育种提供理论依据。

　　

摘要

Teosinte branched1/cycloidea/proliferating cell factor（简称）是一种植物特异的转录因子，在植物的生长与发育、信号传导以及对外界非生物胁迫的响应中起着重要作用。近年来，由于其适应性强和营养价值丰富，藜麦在全球范围内越来越受欢迎，因此对其抗逆性的研究变得尤为重要。全基因组测序技术的快速发展使得许多植物物种中的得以被识别和表征，但迄今为止，藜麦中的尚未被研究和鉴定。因此，本研究是首次对藜麦中的进行的全基因组范围的研究。我们从藜麦基因组中鉴定出了9个基因，并将其分为3个亚家族（亚家族、亚家族和亚家族），这些基因分布在4条染色体上且分布不均。同一亚家族内的基因在保守基序和基因结构方面具有相似性；进化分析表明，藜麦中的基因与双子叶植物的基因具有更密切的亲缘关系；其启动子区域富含与光响应、激素响应、生长发育及逆境响应相关的顺式元件；表达模式分析显示，基因在淹水胁迫、干旱胁迫、高温胁迫和低温胁迫下的表达水平存在显著差异。本研究的结果可能为藜麦转录因子提供新的见解，并为进一步研究藜麦基因的功能奠定基础。同时，它还有助于深入探讨藜麦的抗逆机制，为培育高抗性藜麦品种提供理论参考。