对美索利达嗪(mesoridazine)分子结构及其光谱特性的计算研究

【字体: 时间:2025年12月12日 来源:Next Materials CS1.9

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  抗精神病药物美索比妥(MDZ)的密度泛函理论(DFT)计算与光谱分析表明其具有独特的分子构象和电子特性,可抑制SARS-CoV-2主蛋白酶(Mpro)。研究通过DFT优化分子结构,分析振动模式与电子跃迁,发现MDZ的硫氧基团和甲基哌啶结构影响其抗病毒活性。尽管存在心脏毒性风险,但其抗氧化和神经保护特性仍具潜在应用价值。

  
该研究围绕苯硫?类化合物美索比妥(Mesoridazine, MDZ)的结构特性与光谱分析展开,结合密度泛函理论(DFT)计算与实验光谱数据,系统解析了其分子构型、电子跃迁及振动模式,并探讨了其在抗病毒和抗氧化领域的潜在应用。以下为详细解读:

### 一、研究背景与意义
苯硫?类化合物(PTZ)自20世纪中期被发现以来,已成为精神分裂症等神经精神疾病治疗的核心药物。美索比妥作为典型PTZ衍生物,除传统抗精神病作用外,近年研究发现其具有抑制SARS-CoV-2主蛋白酶(Mpro)的活性,这一特性使其成为药物重定位(repurposing)研究的重要对象。然而,MDZ因心脏毒性(如QT间期延长)已从美国市场撤出,如何在保留其生物活性的同时规避风险,成为当前研究的关键挑战。

### 二、研究方法与技术路线
1. **理论计算框架**
采用B3LYP/6-311g(d,p)基组进行分子几何优化与振动频率计算,通过Gaussian 09软件完成分子构型分析。特别针对PTZ的两种构型(平面式与蝶形式)进行对比研究,发现蝶形结构因0.003哈特里能量优势更稳定。

2. **实验验证体系**
结合拉曼光谱(Renishaw系统,785nm激光激发)与红外光谱(400-4000cm?1范围),验证计算结果的可靠性。通过对比PTZ、氯普马嗪(CPZ)、丙哌嗪(PPZ)及美索比妥的振动特征,建立四类化合物的光谱数据库。

3. **分子电势分析**
利用Molecular Electrostatic Potential(MEP)映射技术,可视化电荷分布与分子表面电势,揭示关键官能团(如硫醚氧原子)的电子效应。

### 三、核心研究成果
#### (一)分子构型与稳定性
- **PTZ构型特性**:平面构型(能量最低)与蝶形构型(能量稍高)的振动模式存在显著差异,后者在环变形(δoop)与C-H弯曲振动(933cm?1)中能量更高。
- **MDZ构型优化**:计算显示MDZ以半船式构型为主,该构型通过硫原子与氮原子的空间排列优化了分子的电子云分布,同时可能影响其与Mpro的相互作用。

#### (二)振动光谱解析
1. **特征振动区段**
- **2800-3300cm?1(CH振动区)**:包含甲基(CH?)对称/不对称伸缩振动(3045cm?1、3145cm?1)及亚甲基(CH?)振动模式,其中MDZ的两个甲基分别位于环平面内外,导致其拉曼光谱在3000-3100cm?1区域出现双峰。
- **1000-1700cm?1(环振动区)**:
- 环呼吸振动(环平面内/外变形):MDZ在1033cm?1(环平面外变形)与1062cm?1(环平面内变形)处呈现特征峰。
- 硫醚键振动(C-S1-C对称伸缩):MDZ中此峰位于1115cm?1,较PTZ(1093cm?1)红移22cm?1,可能与取代基空间位阻有关。
- 硫原子相关振动:C-S2伸缩振动在647cm?1处出现显著峰,表明硫醚基团对分子骨架的刚性影响。

2. **振动模式对比分析**
PTZ衍生物的振动光谱呈现差异化特征:
- **CPZ**:因引入氯原子导致C-Cl伸缩振动(约790cm?1)掩盖部分硫相关振动。
- **PPZ**:三环结构使C-N环振动(约1314cm?1)能量降低,反映其空间位阻更大。
- **MDZ**:特有的硫醚氧原子(S-O)与甲基取代基(N-CH?-C(CH?)?)产生协同效应,在1600-1700cm?1区域形成宽峰带,表明其芳香环的共轭程度高于其他衍生物。

#### (三)电子结构与光谱特性
1. ** frontier分子轨道分析**
- HOMO轨道主要分布在硫原子与氮原子的孤对电子区域,LUMO轨道则延伸至亚甲基链。
- HOMO-LUMO能隙计算值为3.70eV(对应波长335.15nm),处于PTZ衍生物的典型范围(3.0-3.8eV),表明其光吸收特性符合苯硫?类化合物的共性。

2. **吸收光谱特征**
TD-DFT计算显示:
- 第一激发态(S?)源于π→π*跃迁(λ=335.15nm),对应HOMO→LUMO轨道跃迁。
- 第二激发态(S?)在可见光区(约415nm),可能涉及n→π*跃迁,与硫原子电负性增强相关。

#### (四)分子表面电势与生物活性关联
- **MEP分布规律**:
MDZ分子表面呈现梯度电势分布,负电势中心(红色区域)集中在硫醚氧原子(S-O)及邻近氮原子,正电势区域(蓝色)位于甲基取代基的亚甲基链。
- **与Mpro结合位点预测**:
硫原子(电势-5.8eV)与Mpro的活性位点中的带正电残基(如His41)可能形成静电互补作用,而甲基的疏水区域可能通过范德华力稳定结合。

### 四、创新性与应用前景
1. **填补光谱数据库空白**
首次系统解析MDZ的振动模式(150个正常模式),为PTZ类药物的合成优化提供理论依据。例如,通过调整硫醚氧原子的取代基位置,可针对性调控其与Mpro的结合能。

2. **药物重定位新思路**
- **抗病毒机制**:MDZ通过占据Mpro的硫醇氧结合口袋(结合能-8.2kcal/mol),竞争性抑制病毒蛋白酶活性,且其硫醚结构可增强对蛋白酶的疏水锚定作用。
- **安全性改进策略**:研究提出通过引入体积更大的取代基(如苯基取代硫醚氧),降低对心肌细胞的毒性风险,同时保留对Mpro的抑制作用。

3. **抗氧化与神经保护潜力**
- MDZ分子中的硫醚氧与甲基形成空间位阻,使活性氧(ROS)难以攻击关键药效基团,其抗氧化能力(清除DPPH自由基效率达92.3%)显著优于CPZ(78.5%)。
- 红外光谱中C-N环振动峰(1268cm?1)与脑区神经递质调节区的电子云分布存在相似性,提示其可能通过调控GABA受体发挥神经保护作用。

### 五、局限性与未来方向
1. **实验验证不足**:当前研究依赖DFT计算与文献数据,需补充同步辐射X射线衍射实验以验证构型。
2. **生物机制待明确**:MDZ与Mpro的共晶结构尚未解析,需结合冷冻电镜技术验证结合模式。
3. **转化医学挑战**:需开发靶向递送系统(如脂质纳米颗粒包裹)以降低心脏毒性,同时评估其在肺泡巨噬细胞中的抗病毒浓度梯度。

### 六、总结
本研究通过多尺度计算与光谱分析,揭示了MDZ分子独特的构效关系:其半船式构型优化了与Mpro的结合界面,而硫醚氧与甲基的空间排布协同增强了抗病毒活性与抗氧化能力。尽管存在安全性隐患,但研究提出的结构修饰策略(如S-O取代基体积扩大化)为开发新一代抗病毒药物提供了理论支持。后续工作应聚焦于实验验证分子互作机制,并探索其在mRNA疫苗稳定剂等新型应用场景。
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