肠道菌群作为EGFR突变肺癌新型生物标志物的研究:揭示微生物多样性与治疗反应及腹泻副作用的关联

《Scientific Reports》:The gut microbiota as a potential biomarker in patients with EGFR-mutant lung cancer

【字体: 时间:2025年12月12日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对EGFR突变非小细胞肺癌(NSCLC)患者缺乏预测EGFR-TKI疗效和副作用生物标志物的临床难题,通过16S rRNA测序分析治疗前肠道菌群特征。研究发现较高α-多样性(Shannon指数p=0.0367)与轻度腹泻相关,而瘤胃球菌属(Ruminococcus)丰度>1.4%可预测更好的治疗反应(加权UniFrac距离p=0.041,AUC=0.96),首次证实肠道微生物可作为EGFR-TKI疗效和副作用管理的潜在生物标志物。

  
在肺癌精准医疗时代,携带表皮生长因子受体(EGFR)突变的非小细胞肺癌(NSCLC)患者虽然能够从EGFR-酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)治疗中显著获益,但临床实践中仍面临两大挑战:一是无法提前预测哪些患者会产生严重腹泻等副作用,二是缺乏可靠指标预判药物治疗效果。与此同时,近年来"肺-肠轴"理论的兴起揭示了肠道微生物与肺部免疫之间的神秘联系,肠道菌群在免疫检查点抑制剂(ICI)治疗非突变肺癌中的生物标志物作用已被广泛证实,然而这种关联是否存在于EGFR突变肺癌领域却完全是未知的探索地带。
正是在这样的背景下,日本弘前大学的研究团队在《Scientific Reports》上发表了开创性研究,首次将目光聚焦于EGFR突变NSCLC患者的肠道微生态。他们提出了一个大胆假设:治疗前的肠道菌群特征或许能成为预测EGFR-TKI疗效和副作用的"水晶球"。
研究团队设计了一项前瞻性观察研究,招募了21名初治EGFR突变NSCLC患者,在开始EGFR-TKI治疗前收集粪便样本,采用16S rRNA基因测序技术分析肠道菌群组成。通过计算α-多样性指数评估菌群丰富度,利用β-多样性分析比较不同疗效组间菌群结构差异,并运用线性判别分析效应大小(LEfSe)方法识别关键差异菌群。
关键技术方法:本研究纳入21例EGFR突变NSCLC患者治疗前粪便样本,通过16S rRNA基因V1-V2区测序进行菌群分析,使用DADA2进行序列处理,基于GreenGenes数据库进行物种注释,采用QIIME2平台计算α-多样性(Shannon指数)和β-多样性(加权/非加权UniFrac距离),通过主坐标分析(PCoA)和相似性分析(ANOSIM)比较组间差异,并利用LEfSe分析鉴定差异菌群,通过受试者工作特征(ROC)曲线确定预测阈值。
患者特征与临床结局
研究人群主要为日本裔肺腺癌患者,中位年龄70岁,女性占66.7%,非吸烟者比例达52.4%。EGFR突变类型包括L858R(42.8%)、外显子19缺失(42.8%)以及罕见突变。治疗药物包括奥希替尼、阿法替尼和厄洛替尼联合雷莫西珠单抗。疗效评估显示部分缓解(PR)占52.4%,疾病稳定(SD)占42.8%,疾病进展(PD)占4.8%。腹泻发生方面,33.3%患者出现2级以上腹泻。
肠道菌群α-多样性与腹泻严重程度的关系
研究人员首先探索了菌群多样性与治疗副作用之间的关联。结果显示,治疗前肠道菌群的α-多样性(通过Shannon指数衡量)在腹泻程度不同的患者中存在显著差异。无腹泻或仅有1级腹泻的患者菌群多样性明显高于发生2-3级腹泻的患者(Shannon指数p=0.0367)。这一发现表明,治疗前拥有更丰富多样的肠道微生物生态系统可能对EGFR-TKI引起的肠道毒性具有保护作用。
肠道菌群β-多样性与EGFR-TKI疗效关联
为进一步探究菌群特征与治疗效果的关系,研究团队进行了β-多样性分析,比较了对治疗有良好反应(PR组)和反应不佳(SD/PD组)患者的菌群结构差异。虽然非加权UniFrac距离分析未显示显著组间差异(p=0.118),但加权UniFrac距离分析却揭示了明显区别(p=0.041),表明两组患者在优势菌群构成上存在本质不同。
关键差异菌群鉴定:瘤胃球菌属的预测价值
通过LEfSe分析,研究人员发现瘤胃球菌属(Ruminococcus)在治疗有效组(PR组)中显著富集。进一步验证显示,该菌属在PR组的相对丰度显著高于SD/PD组(p=0.0018)。更重要的是,通过ROC曲线分析确定了1.4%作为预测治疗反应的临界值(AUC=0.96,p<0.001),意味着当治疗前粪便样本中瘤胃球菌属比例超过1.4%时,患者对EGFR-TKI治疗产生良好反应的可能性大大增加。
研究结论与意义
本研究首次系统阐述了EGFR突变NSCLC患者肠道菌群特征与EGFR-TKI治疗反应及副作用之间的内在联系。研究证实,治疗前较高的肠道菌群α-多样性可作为预测轻度腹泻的生物标志物,而瘤胃球菌属的相对丰度则是预测治疗疗效的有效指标。这些发现不仅拓展了"肺-肠轴"理论在靶向治疗领域的应用,也为临床实践提供了非侵入性的预测工具。
值得注意的是,研究发现与免疫治疗相关的标志性菌株如Akkermansia muciniphila和Bifidobacterium breve在EGFR突变患者中未被检出,这可能部分解释了为何此类患者对免疫治疗反应较差的现象。同时,在疗效不佳组中检测到的 Fusobacteria(与恶性肿瘤不良预后相关)也为理解治疗抵抗机制提供了新线索。
尽管研究存在样本量有限、16S测序区域选择限制物种级分辨率等局限性,但其开创性地建立了肠道微生物与EGFR-TKI治疗效果之间的桥梁,为未来开发基于微生物组的个体化治疗策略奠定了坚实基础。这种通过简单粪便检测即可预测疗效和副作用的方法,对改善EGFR突变肺癌患者的治疗管理和生活质量具有重要临床意义。
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