NSUN7作为非催化性RNA m5C甲基转移酶通过调控精子鞭毛组装相关mRNAs影响雄性生育能力
《Nature Communications》:NSUN7 is a catalytically inactive RNA m5C methyltransferase essential for sperm flagellum assembly
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时间:2025年12月12日
来源:Nature Communications 15.7
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本研究针对NSUN家族中唯一催化活性不明的NSUN7,通过多组学分析发现其虽具备保守基序但缺乏SAM结合能力,首次揭示其非催化功能在精子轴丝组装和运动性调控中的关键作用,为男性生殖障碍提供了新的机制解释。
在生命科学的精密调控网络中,RNA修饰如同暗物质般神秘而关键,其中5-甲基胞嘧啶(m5C)作为最常见的RNA化学修饰之一,由NSUN(NOP2/Sun RNA甲基转移酶)家族蛋白主导催化。这个家族从NSUN1到NSUN7的七个成员中,有六个已被证实能够催化RNA的m5C形成,唯独NSUN7的酶活性和生理功能如同家族中的"幽灵成员",十余年来始终笼罩在迷雾中。尽管早期研究提示NSUN7基因突变与男性不育相关,但其是否真正具有甲基转移酶活性,以及如何参与生殖调控,一直是领域内悬而未决的核心问题。
这项发表于《Nature Communications》的研究,如同一把精准的手术刀,层层剖开了NSUN7的生物学本质。研究人员首先通过组织分布分析发现,NSUN7在成年小鼠睾丸中特异性高表达,且在精子形成的关键细胞——长形精子细胞中富集。这一发现立刻将NSUN7的功能定位聚焦于雄性生殖系统的后期发育阶段。
为破解NSUN7的催化之谜,团队采用了转录组水平的m5C质谱分析和超快亚硫酸氢盐测序两种互补技术,对野生型和Nsun7基因敲除小鼠睾丸进行全景式检测。令人惊讶的是,缺失NSUN7并未引起全转录组m5C修饰水平的任何显著变化。这一反直觉的结果促使研究者深入分子机制层面,通过比对NSUN家族蛋白的保守结构特征,发现NSUN7虽然保留着甲基转移酶标志性的基序IV和VI,但其基序IV中负责结合S-腺苷甲硫氨酸(SAM,甲基供体)的关键天冬氨酸(Asp)被亮氨酸(Leu)替代。结构生物学分析和体外结合实验证实,这一关键位点的变异使NSUN7完全丧失了SAM结合能力,从分子基础上解释了其催化失活的原因。
那么,这个"失效"的甲基转移酶如何影响精子功能?表型分析给出了清晰答案:Nsun7敲除小鼠虽能正常产生精子,但精子前向运动能力显著受损。进一步的电镜观察揭示了更深层的缺陷——精子鞭毛的轴丝结构出现严重异常,其中"9+2"微管结构中负责机械稳定的纵向柱发生错位。这种超微结构缺陷如同轮船的螺旋桨轴心偏移,直接导致精子运动功能障碍。
通过单细胞RNA测序技术,研究团队在长形精子细胞中捕捉到关键线索:Nsun7缺失导致一组与纤毛组织相关的mRNA水平显著下调。这些mRNA如同精子鞭毛组装的"施工图纸",其数量减少使得轴丝构建过程失去精准指导。值得注意的是,NSUN7本身虽不催化m5C形成,但能通过与这些mRNA的直接互作,以"分子支架"的方式维持其稳定性,从而间接调控鞭毛组装。
主要关键技术方法包括:利用转录组水平m5C质谱分析和超快亚硫酸氢盐测序检测RNA修饰谱;通过结构比对和体外结合实验分析蛋白质功能域;采用基因敲除小鼠模型(C57BL/6背景)进行表型验证;运用单细胞RNA测序解析细胞特异性基因表达变化;结合透射电镜观察精子鞭毛超微结构。
通过计算机辅助精子分析系统发现,Nsun7敲除小鼠精子前向运动比例下降约50%。透射电镜显示精子鞭毛轴丝中微管双联体排列紊乱,特别是连接外周双联体与中央对的径向辐条缺失,以及纵向柱的定位异常,这些结构缺陷直接解释了运动功能障碍的原因。
序列比对显示NSUN7基序IV中SAM结合关键位点Asp被Leu取代(第228位)。等温滴定量热法证实NSUN7无法结合SAM,而将NSUN7的基序IV移植到活性NSUN2中,同样使其丧失催化能力,反向验证了该区域的功能决定性。
单细胞RNA测序在长形精子细胞集群中发现226个差异表达基因,其中纤毛组装通路基因显著富集。RNA结合蛋白免疫沉淀实验证实NSUN7与Dnaaf5、Cfap43等鞭毛组装因子mRNA直接结合,提示其通过RNA结合域维持靶转录本稳定性。
本研究首次确证NSUN7是催化失活的RNA甲基转移酶,阐明了其通过非催化方式调控精子鞭毛组装的新机制。这一发现不仅解决了NSUN家族生物学中最后一个成员的功能悬案,更重要的是拓展了对RNA修饰调控蛋白功能多样性的认知——从传统的"书写器"功能延伸到"分子支架"功能。在医学层面,研究为轴丝缺陷型弱精症提供了新的病因解释和潜在诊断标志物,提示NSUN7突变筛查可能成为男性不育诊疗的新靶点。该工作通过多学科交叉研究策略,实现了从分子缺陷到细胞表型再到机体功能的完整证据链闭环,为研究非催化性RNA结合蛋白的功能提供了范式参考。
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