利用靶向蛋白质降解技术调控G蛋白偶联受体:CCR2分子降解剂的研发
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时间:2025年12月12日
来源:Journal of Medicinal Chemistry 6.8
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本研究成功开发了首个靶向膜结合G蛋白偶联受体(GPCR)CCR2的分子降解剂,证实其通过溶酶体途径实现持续降解,并有效抑制单核细胞迁移。
### 靶向蛋白降解(TPD)在膜结合G蛋白偶联受体(GPCR)中的应用研究:以CCR2为模型的发展与机制探索
#### 研究背景与意义
靶向蛋白降解(Targeted Protein Degradation, TPD)作为药物研发领域的前沿技术,突破了传统靶向治疗的局限性。特别是针对膜结合蛋白如GPCR的研究,因其传统药物靶点的复杂性(如高动态周转率、低表达水平),长期面临降解效率不足的问题。本研究以CCR2为模型,成功开发了首个通过自噬-溶酶体途径降解的GPCR分子降解器(PROTACs),为开发新型抗炎和抗癌药物提供了重要工具。
#### 研究目标与方法
研究团队聚焦于以下科学问题:
1. **GPCR降解机制探索**:验证PROTACs能否通过细胞内结合有效招募泛素连接酶,并触发溶酶体依赖性降解。
2. **化合物筛选与优化**:基于已知的CCR2内源性配体和泛素连接酶靶向策略,设计并合成多组PROTACs,通过高通量筛选和功能验证确定最优候选分子。
3. **降解途径的分子机制**:通过抑制剂实验和实时成像技术,解析PROTACs的作用靶点及降解通路。
研究采用“药物设计-体外验证-机制解析”三阶段流程:
- **设计阶段**:以CCR2的已知的内源性配体(化合物1)为基础,结合CRBN、VHL等泛素连接酶的靶向配体,通过模块化连接设计PROTACs骨架。
- **筛选阶段**:利用膜结合蛋白的放射配体结合实验([3H]CCR2-RA-[R])和细胞功能抑制实验(xCELLigence阻抗法)双重筛选,剔除低效分子。
- **机制验证**:通过CRBN抑制剂(Pomalidomide)、溶酶体抑制剂(Baf-A1)及蛋白酶抑制剂(Bortezomib)的竞争实验,明确降解途径依赖性。
#### 关键发现与创新点
1. **首例GPCR溶酶体依赖性降解器**
研究发现,化合物LUF7996通过结合CCR2的细胞内界面,招募CRBN泛素连接酶,诱导受体蛋白的泛素化并靶向溶酶体降解。这一机制突破了传统PROTACs依赖蛋白酶体的限制,为GPCR治疗提供了新范式。
2. **PROTACs设计策略的优化**
- **配体亲和力平衡**:通过调整连接臂的长度和疏水性(如引入丙二醇胺基或聚乙二醇链),显著提升化合物对CCR2的亲和力(pIC50值达7 nM)与膜穿透性。
- **泛素连接酶选择**:优先选择CRBN(而非VHL或MDM2),因其对GPCR的泛素化效率更高,且在炎症相关疾病中表达稳定。
3. **转化医学价值**
LUF7996在THP-1单核细胞迁移实验中展现出与临床常用拮抗剂(如INCB3344)相当的抑制效果(84% vs 80%),且通过实时HiBiT检测证实其降解效率可持续24小时。这一特性使其在治疗转移性癌症和慢性炎症(如类风湿性关节炎)中具有潜力。
#### 技术突破与实验验证
1. **高通量筛选体系**
采用膜蛋白结合实验([3H]CCR2-RA竞争法)与功能抑制实验(xCELLigence)联合评估,成功从50余种候选分子中筛选出4个高活性化合物(LUF7996、LUF8064等)。通过分子模拟发现,连接臂的疏水-亲水平衡可减少配体构象冲突,提升PROTACs稳定性。
2. **降解途径的机制解析**
- **CRBN依赖性**:合成CRBN功能缺失突变体(LUF8064突变体),其降解效率下降50%-70%,证实CRBN在PROTACs作用中不可或缺。
- **溶酶体特异性**:加入溶酶体抑制剂Baf-A1后,LUF7996的CCR2降解率从79%降至35%,而蛋白酶抑制剂Bortezomib未显著影响降解,表明其机制独立于蛋白酶体。
- **时间动态分析**:通过HiBiT实时监测发现,LUF7996在3小时内即可使CCR2水平下降50%,且降解效果在24小时后仍保持稳定,提示其长效作用机制。
3. **临床前转化潜力**
- **细胞毒性评估**:LUF7996在10 μM浓度下未对HEK293T细胞 viability(OD值>85%)及形态产生影响,安全性优于现有GPCR拮抗剂。
- **体内功能验证**:在THP-1细胞模型中,LUF7996通过抑制CCR2介导的CCL2信号通路,显著降低炎症因子表达(数据详见表2)。
#### 研究局限与未来方向
1. **当前局限**
- **靶向特异性**:需进一步验证PROTACs对其他GPCR(如CCR5)的交叉反应。
- **代谢稳定性**:化合物在体内的半衰期和代谢途径尚未明确。
2. **未来方向**
- **多靶点PROTACs开发**:结合CCR2与上下游信号分子(如NF-κB)的协同靶向策略。
- **临床前模型构建**:利用Pomabot等CRBN激动剂增强降解效率。
- **溶酶体机制深化**:解析CCR2在溶酶体中的具体定位及降解信号通路。
#### 结论
本研究建立了首个靶向GPCR的溶酶体依赖性降解器开发范式,其核心创新在于:
1. **设计策略**:基于内源性配体优化PROTACs结构,结合模块化连接臂设计提升膜穿透性。
2. **机制突破**:首次证实GPCR可通过溶酶体途径降解,为开发新型抗炎和抗癌药物提供理论依据。
3. **转化潜力**:LUF7996在单核细胞迁移抑制实验中表现优异,为后续临床前研究奠定基础。
该研究不仅拓展了PROTACs的应用范围(从胞内蛋白到膜结合受体),更为GPCR治疗提供了“双路径”策略:
- **短期调控**:通过拮抗剂阻断CCL2-CCR2信号轴。
- **长期根除**:通过PROTACs降解CCR2受体蛋白本身,解决传统拮抗剂无法触及的“药物口袋外”构象问题。
#### 数据总结与对比
| 指标 | LUF7996 | 临床拮抗剂(INCB3344) | 其他GPCR降解器(如GPER) |
|---------------------|---------|-------------------------|-------------------------|
| CCR2降解效率(10 μM) | 79% | 48% (体外功能抑制) | 30%-50%(蛋白酶体依赖) |
| 细胞穿透性 | ++ | + | + |
| 溶酶体依赖性 | 100% | N/A | 60%-80%(部分报道) |
| 24小时稳定性 | 85% | 10小时后降解率<40% | 依赖蛋白酶体活性 |
注:+/-表示降解效率(+为高效,-为低效);数据来源于本研究及公开文献。
#### 伦理与转化意义
- **临床需求**:现有CCR2拮抗剂因无法降解受体蛋白,在长期治疗中易因受体代偿性上调失效。PROTACs可同步阻断信号通路并清除异常表达的受体。
- **机制创新**:首次揭示溶酶体依赖性降解在GPCR治疗中的应用,可能解决受体内吞-循环导致的药物抵抗问题。
- **技术延伸**:开发基于PROTACs的CRBN激活疗法,或可增强降解效率并扩大治疗范围。
#### 社会影响与展望
本研究为慢性炎症性疾病(如癌症转移、类风湿性关节炎)和自身免疫性疾病(如多发性骨髓瘤)的治疗提供了新思路。若后续临床前研究证实其安全性和有效性,可能推动首个PROTACs-GPCR疗法进入临床试验阶段,预计将缩短从靶点发现到药物上市的时间周期约30%-50%。
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