Lotipaludicoccus stagni（新属新种），属于Opitutaceae科，从莲荷湿地中分离得到

《Current Microbiology》：Lotipaludicoccus stagni gen. nov., sp. nov., within the Family Opitutaceae, Isolated from a Lotus Wetland

细菌IMCC34717从韩国睡莲湿地分离，革兰氏阴性、非机动、球菌，生长适温30℃、pH7.0、0.5% NaCl。16S rRNA基因分析显示与Nibricoccus aquaticus同属Opitutaceae，相似度95.2%。基因组全长3.56 Mbp，G+C含量61.8%，与属内其他物种基因组亲缘关系低于 genus 阈值，支持新属Lotipaludicoccus成立。基因组揭示氮硫碳代谢通路及特有淀粉酶基因，呼吸醌为MK-7，脂肪酸以iso-C14:0、C16:0和anteiso-C15:0为主，极性脂类含磷脂酰乙醇胺等。

　　

摘要

一种革兰氏阴性、需氧、不动的球形细菌，被命名为IMCC34717^T，是从韩国的一个莲花湿地中分离出来的。该菌株在15–38°C（最适温度30°C）范围内生长，在pH 6.0–9.0（最适pH 7.0）的条件下也能存活，并且能够在0–0.7%（重量/体积）NaCl溶液中存活（最适浓度为0.5% NaCl）。通过对16S rRNA基因进行系统发育分析，将IMCC34717^T归类到Opitutaceae科中，其序列与Nibricoccus aquaticus HZ-65^T的相似度最高（95.2%）。该菌的完整基因组大小为3.56 Mbp，DNA的G+C含量为61.8%。IMCC34717^T与Opitutaceae科其他成员之间的基因组相关性指数处于或低于该科所提出的属间阈值，基于基因组的系统发育树显示其与已知属之间存在明显的分类差异，这支持将其认定为一个新属的代表。基因组分析揭示了该菌的氮代谢、硫代谢和碳代谢途径，其中包含一些在近缘物种Nibricoccus aquaticus中不存在的独特淀粉酶相关基因，表明该菌具有生态上的特殊性。其主要呼吸醌类物质是甲基萘醌-7（MK-7），细胞中的主要脂肪酸为异-C_14:0（28.1%）、C_16:0（25.1%）和反式-C_15:0（21.6%）。主要的极性脂质包括磷脂乙醇胺、磷脂甘油、二磷脂甘油、一种未鉴定的氨基磷脂以及三种未鉴定的脂质。根据系统发育、基因组和表型证据，IMCC34717^T被认为代表Opitutaceae科中的一个新属和新种，建议将其命名为Lotipaludicoccus stagni（新属新种）。模式菌株为IMCC34717^T（= KCTC 82067^T = KACC 23134^T = NBRC 113911^T）。