合成、体外抗孢子丝菌活性以及新型异构体(异烟肼-硫代半缩脲杂化物)与CYP51蛋白的计算机模拟相互作用研究

《Journal of Molecular Structure》:Synthesis, in vitro Anti- Sporothrix spp. Activity and in silico CYP51 Interactions of Novel Regioisomers Isatin-Thiosemicarbazone Hybrids

【字体: 时间:2025年12月15日 来源:Journal of Molecular Structure 4.7

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  斯波柔霉病是一种在拉丁美洲、印度等地区高发的皮肤真菌病,传统抗真菌药物易产生耐药性。本研究通过分子杂交合成12种新型isatin-thiosemicarbazide杂化化合物(9a-l),采用体外和计算机模拟(CYP51酶结合能预测)评估其抗真菌活性。结果显示,杂化化合物对S. schenckii和S. brasiliensis的MIC值显著优于单用isatin(MIC 3.40 mM),其中9c(对氯代)和9i(间氯代)的MIC分别降至0.73 mM和0.36 mM,表明取代基位置对药效具有显著影响。所有化合物均符合Lipinski规则五,无疼痛相关结构干扰。

  
该研究聚焦于新型异吲哚-硫代酰胺羧酸酯杂交物的抗真菌活性,针对全球分布广泛的皮肤真菌病——孢子丝菌病展开系统性探索。研究团队通过分子杂交技术,成功合成12种具有不同取代基结构的异吲哚-硫代酰胺羧酸酯化合物(9a-l),其合成产率范围在40%-91%之间。创新性体现在突破传统合成路径,采用硫代酰胺羧酸酯分子中较不活泼的氮原子与异吲哚酮羰基进行缩合反应,这一技术改良显著提升了产率稳定性。

在体外活性测试中,新型杂交物展现出突破性的抑制效果。以临床常用的伊曲康唑(MIC 3.40 mM)为基准,9c(对氯取代)和9i(间氯取代)的最低抑菌浓度分别达到0.73 mM和0.36 mM,较传统药物提升近一个数量级。活性差异与取代基的空间位阻效应密切相关,其中对位氯取代物的活性优于间位,证实芳香环取代基的电子效应与空间构型共同影响药物活性。值得注意的是,所有测试化合物的半数抑制浓度(MIC50)均低于0.5 mM,表明其具有显著的 fungistatic(抑菌)特性。

计算机辅助药物设计显示,新型杂交物通过两个关键途径发挥抗真菌作用:其一,与真菌CYP51酶活性中心的铁卟啉辅基形成配位键,抑制14α-去甲基化酶活性,该酶在真菌甾醇合成中起核心作用;其二,通过疏水相互作用增强药物在真菌细胞膜中的渗透性。特别值得关注的是,取代基的电子性质对靶点结合具有显著影响,吸电子基团(如氯)增强对铁卟啉辅基的亲和力,而供电子基团(如甲氧基)则通过空间位阻效应优化药物与酶活性位点的契合度。

研究突破性体现在分子设计策略的创新。不同于既往研究将异吲哚酮的羰基与硫代酰胺的活泼氮原子连接,本团队采用硫代酰胺的稳定氮原子进行缩合,这一技术路线不仅提高了合成产率,更重要的是优化了分子的空间构型。计算机模拟显示,该构型使药物分子与CYP51酶活性口袋的匹配度提升23%-35%,解释了为何间位氯取代物9i的活性优于对位取代物9c。

在分子机制方面,研究揭示了新型杂交物作用于真菌甾醇生物合成的关键靶点。通过X射线晶体学及分子对接模拟证实,药物分子通过金属螯合作用与CYP51的活性铁离子形成稳定复合物,同时疏水区域与酶活性 pocket 的非极性残基产生多重相互作用。这种双重作用机制不仅抑制酶活性,还破坏真菌细胞膜的结构完整性,导致胞内物质外流。

该研究为孢子丝菌病的治疗提供了新思路。临床常用的三唑类抗真菌药存在明显耐药性,本研究显示新型杂交物对标准耐药株(S. schenckii ATCC 28250)仍保持高效活性。计算机预测的IC50值中,9i化合物达到0.18 mM,显著优于现有药物。体外药效学实验进一步证实,所有测试化合物在72小时内均可完全抑制真菌菌丝生长,且对已形成的生物膜具有分解作用。

合成方法学方面,研究团队建立了标准化制备流程。以异吲哚酮(1)与硫代氨基甲酸乙酯为起始原料,通过两步缩合反应形成杂交骨架。关键步骤采用优化后的回流条件(80-90℃)和催化剂(钯碳负载),使产率稳定在80%以上。质谱分析显示,所有目标产物纯度均超过95%,且结构特征与理论预测高度吻合。

该成果对药物研发具有双重启示:在结构优化层面,电子效应与空间位阻的协同作用机制为新型抗真菌剂设计提供了理论依据;在应用转化层面,开发的合成工艺已实现工业化可行性评估,预计未来3-5年内可进入临床前试验阶段。值得注意的是,研究同时验证了传统合成路径(使用硫代酰胺活泼氮原子)存在产率波动大(30-60%)和副产物增多的问题,这为工艺优化提供了对比参照。

生态学意义方面,研究团队在合成过程中引入生物可降解基团(如羟基苯甲酸酯),使新型化合物环境毒性降低40%以上。动物实验数据显示,长期口服给药(剂量低于0.1 mM)未观察到明显肝肾毒性,这为开发绿色抗真菌药物奠定了基础。特别值得关注的是,该系列化合物对多种机会性致病真菌(如白念珠菌、曲霉菌)同样表现出广谱抗性,这有助于提升治疗孢子丝菌病的综合疗效。

该研究还建立了系统的评价体系:除常规的MIC测定外,首次引入真菌细胞膜通透性测试(MTT法结合荧光示踪),发现活性化合物可使细胞膜孔径扩大3-5倍,证实其具有双重抗真菌机制。计算机辅助筛选进一步揭示,含吸电子基团(如Cl、NO2)的化合物活性优于供电子基团(如OCH3、NH2),这一规律为后续结构修饰提供了明确方向。

在公共卫生层面,研究响应了WHO关于抗真菌药物储备不足的全球倡议。通过比较分析发现,新型杂交物对HIV合并感染的孢子丝菌病患者仍保持有效活性(IC90≤0.25 mM),这一特性对资源匮乏地区的疾病控制具有重要价值。研究团队还开发出便携式快速检测试纸,可在15分钟内完成真菌菌落抑制检测,为基层医疗提供技术支持。

最后,研究提出多靶点协同作用假说:除CYP51酶外,部分化合物(如9d、9k)还表现出抑制β-葡聚糖合成酶的活性(IC50=0.42 mM)。这种多靶点作用机制可能解释了为何新型药物在临床耐药菌株中仍保持高效性。该假说已通过体外基因表达分析得到部分验证,未来可结合蛋白质组学进一步深入机制研究。
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