三阴性乳腺癌中调控化疗反应的关键枢纽基因和通路的鉴定：一项综合分析

《Cell Biochemistry and Function》：Identification of Critical Hub Genes and Pathways Regulating Chemotherapy Responses in Triple-Negative Breast Cancer: An Integrated Analysis

三阴性乳腺癌化疗响应差异表达基因及关键通路研究通过生物信息学分析发现化疗药物处理的细胞系中与细胞周期调控、DNA损伤检查点相关的差异基因集，CDK2、PLK4、BIRC5等关键基因形成蛋白互作网络核心节点，为精准治疗提供分子靶点。

　　

摘要

三阴性乳腺癌（TNBC）对全球女性健康构成了巨大威胁。TNBC具有侵袭性强、对现有疗法具有抗性以及预后较差的特点。了解乳腺癌的分子发病机制对于识别筛查标志物和治疗靶点至关重要。为了找到在经过多西他赛（GSE70690）、紫杉醇（GSE86839）、多柔比星（GSE202536）和顺铂（GSE77515）治疗的多种TNBC细胞系以及未经治疗的TNBC细胞系（GSE38959）中差异表达的基因，本研究采用了生物信息学方法。使用了R软件，分析的临界标准设定为

<0.01

且|log2FC|>±1。通过维恩图（Venn diagram）分析了接受和未接受靶向化疗药物的TNBC细胞系中共有的差异表达基因。通过对这些差异表达基因进行进一步分析，利用基因本体论（gene ontology）和Reactome通路富集分析（pathway enrichment analysis），确定了它们在特定生物过程和通路中的作用。随后建立了蛋白质-蛋白质相互作用（protein–protein interactions, PPI），并发现了核心基因。数据分析结果显示，这些差异表达基因与TNBC对化疗药物的反应有关。GO（Gene Ontology）分析表明，这些基因主要与细胞周期调控、细胞增殖和微管相关功能相关。Reactome通路分析显示，这些基因在细胞周期过程、有丝分裂阶段和DNA损伤检查点中富集。基于其在PPI网络中的高连接性，识别出了核心基因，如CDK2、PLK4和BIRC5。本研究发现的差异表达基因和通路为寻找潜在的治疗靶点和降低药物耐药性提供了依据。这些发现有助于开发针对TNBC的个性化及靶向治疗策略，最终改善患者的治疗效果。

总结

由于三阴性乳腺癌（TNBC）的分子异质性以及缺乏针对性的治疗选择，其治疗面临重大挑战。本研究整合了暴露于关键化疗药物下的TNBC细胞系的转录组数据，以识别共有的差异表达基因和富集的信号通路。研究发现的核心基因（如CDK2、PLK4和BIRC5）是细胞周期调控、有丝分裂进程和DNA损伤反应的关键调节因子。这些发现为理解化疗耐药性提供了机制上的见解，并为开发旨在提高TNBC治疗效果和临床预后的精准靶向策略提供了分子框架。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

数据可用性声明

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