基于全面基因组谱分析（CGPT）的恶性脑脊髓肿瘤个体化治疗策略探索：东海大学经验

《Neuro-Oncology Advances》：10031-GEN-1Current Status and Problems of Comprehensive Genomic Profiling Test in the Treatment of Malignant Cerebrospinal Tumors at Tokai University

本研究针对恶性胶质瘤标准治疗方案有限、预后差的临床困境，回顾性分析了东海大学20例接受全面基因组谱测试（CGPT）的患者数据。结果显示，60%的患者获得靶向药物推荐，融合基因检出率达4.7%，显著高于既往报道。研究证实早期实施CGPT可为恶性胶质瘤的个体化治疗提供新策略。

　　

恶性脑脊髓肿瘤，尤其是胶质母细胞瘤，是神经外科领域最具挑战性的疾病之一。尽管近年来手术技术、放疗和化疗方案不断进步，但患者的总体预后仍然很差，中位生存期有限。这背后一个核心的难题在于肿瘤的高度异质性——不同患者的肿瘤在基因层面上存在巨大差异，导致其对标准化疗和放疗的反应千差万别。传统的“一刀切”治疗模式已触及瓶颈，临床迫切需要更为精准的个体化治疗策略。正是在这样的背景下，全面基因组谱分析（Comprehensive Genomic Profiling Test, CGPT）技术应运而生。这项基于下一代测序（Next-Generation Sequencing, NGS）的技术能够一次性检测数百个与癌症相关的基因变异，为揭示每个患者肿瘤的独特“基因身份证”提供了可能。然而，将CGPT常规应用于恶性脑脊髓肿瘤的临床诊疗，其可行性、检测结果的解读以及如何将这些基因信息转化为实际的治疗方案，仍是全球范围内探索的前沿课题。日本东海大学的研究团队开展的这项研究，旨在系统评估CGPT在该类难治性肿瘤治疗中的当前应用状况与实际价值，为推进精准医疗提供现实世界的证据。

本研究主要采用了回顾性队列分析的方法。研究人员收集了2024年5月至2025年4月期间在东海大学医院接受CGPT的20例恶性胶质瘤患者的临床资料。关键技术方法包括：利用两种市售的NGS检测 panel（其中17例使用GenMineTOP，3例使用FoundationOne^?CDx）对肿瘤组织进行CGPT分析；由专家小组（Expert Panel, EP）对检测出的基因组变异进行解读，并基于此推荐潜在的靶向治疗药物；记录从患者注册到获得EP报告的时间间隔；统计分析关注的基因组改变包括TERT、TP53、EGFR等关键基因的突变、融合基因的检出情况以及肿瘤突变负荷（Tumor Mutation Burden, TMB）等指标。

研究结果

患者基线特征与CGPT实施流程

研究共纳入20例患者，中位年龄为52岁，男性占主导（80%）。肿瘤组织的中位肿瘤细胞含量为70%，这保证了后续基因组分析的质量。绝大多数患者（85%）采用了GenMineTOP检测 panel。一个关键的流程指标是，从患者注册到获得专家小组（EP）审查报告的中位时间为36天（范围27-49天），这反映了在临床实践中获取基因组解读结果所需的周期。

基因组改变谱与推荐治疗

基因组分析揭示了丰富的变异信息。在所有患者中，有4例（20%）检出了胚系突变（Germline Mutations），这提示部分患者可能存在遗传易感因素。特别针对9例IDH野生型胶质母细胞瘤（这是最常见且预后最差的亚型）的深入分析显示，频繁出现的基因改变包括TERT启动子突变（n=4）、CDK4扩增（n=3）、TP53突变（n=2）、FGFR改变（n=2）、EGFR扩增/突变（n=2）、BRAF改变（n=2），以及BRCA1、NTRK2、PDGFRA改变各1例。尤为值得注意的是，融合基因的检出率达到4.7%，研究者认为这一比例高于以往的报道，并推测广泛使用GenMineTOP panel可能是原因之一。基于这些基因组发现，共有12例患者（60%）被专家小组推荐了至少一种（包括日本未批准或超适应症使用的）靶向治疗药物。然而，最终仅有4例患者（20%）实际接受了推荐的治疗，这凸显了从基因发现到临床应用的转化仍面临挑战。

结论与讨论

本研究的结论指出，在东海大学的恶性胶质瘤患者队列中，通过CGPT获得靶向药物推荐的比例相对较高。研究特别强调了GenMineTOP检测 panel的应用可能有助于提高融合基因的检出率。鉴于恶性胶质瘤，特别是胶质母细胞瘤，标准治疗选择有限且预后极差，研究者认为，在病程早期实施CGPT可能有助于制定更加个性化和有效的治疗策略。这项研究为CGPT在神经肿瘤领域的现实世界应用提供了有价值的数据，支持了将精准医学理念整合进恶性脑脊髓肿瘤管理流程的必要性。当然，如何优化检测流程、缩短报告时间、提高推荐药物的可及性和应用率，是未来需要进一步解决的问题。该研究发表于《Neuro-Oncology Advances》杂志，为这一重要领域增添了新的证据。