AT11适配体选择性递送抗癌天然G-四链体配体用于胃癌治疗

《Journal of Medicinal Chemistry》:Selective Delivery of Anticancer Natural G-Quadruplex Ligands by the AT11 Aptamer for Gastric Cancer Treatment

【字体: 时间:2025年12月17日 来源:Journal of Medicinal Chemistry 6.8

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  G-四联体靶向递送天然化合物协同抑制胃癌细胞增殖,研究通过NMR、分子模拟和光谱分析揭示bulbocapnine等化合物优先与AT11的3'或5'端四联体结合,形成稳定复合物并实现细胞选择性摄取,显著降低AGS和A549细胞活性,正常细胞无显著影响。

  
本研究聚焦于利用G-四联体结构实现抗癌药物的选择性递送。研究者发现,天然化合物如 bulbocapnine( bulbocapnine)、chelidonine( 铃兰碱)、dicentrine( 双穗飞燕草素)、ibogaine( 蛇根草碱)和 rotenone( 花生四烯酸氧化酶)能够与G-四联体aptamer AT11形成稳定复合物。通过核磁共振(NMR)、圆二色光谱(CD)和分子动力学模拟,揭示了这些化合物与AT11的特异性结合模式:bulbocapnine、chelidonine、dicentrine和ibogaine主要与3’端G-四联体结合,而rotenone倾向于结合5’端区域。这种差异化的结合特性通过NOESY交叉峰和分子对接进一步得到验证,例如chelidonine与G21和G27形成π-π堆积,同时T28残基发生位移。

荧光光谱实验显示,所有复合物在1:1配比下均表现出高亲和力(Kd值在1-2 μM之间),且ibogaine和bulbocapnine存在多价结合现象。特别值得注意的是,这些复合物在37℃含10%胎牛血清的模拟细胞环境中能够稳定释放药物,其中ibogaine在24小时内即可完全释放,而dicentrine在48小时后仍有30%结合量。这种可控释放特性为体内应用提供了依据。

细胞实验部分采用AGS胃癌细胞和HEK293/hTR8正常细胞进行对比研究。MTT检测显示,AT11复合物在10 μM浓度下即可使AGS细胞存活率下降50%,而相同浓度的游离化合物效果不足10%。通过Bliss协同性模型分析,所有复合物均表现出显著协同效应(E_AB-E_Bliss>5%),例如AT11/dicentrine组合的协同指数达1.8,而对照组aspidospermine仅为0.3。这种协同作用源于aptamer对核孔蛋白的靶向递送和药物分子对G-四联体的双重作用。

免疫荧光显微成像揭示,复合物在细胞内的定位显著优于游离药物。AT11/bulbocapnine复合物在AGS细胞中表现出更强的细胞质富集(荧光强度提高3倍),且核内定位效率比游离AT11高2.5倍。值得注意的是,非癌变细胞(hTR8)在相同处理下细胞存活率下降不超过5%,充分证明靶向递送系统的特异性。

研究还创新性地构建了跨癌种应用模型。在A549肺癌细胞实验中,AT11/dicentrine复合物仍保持80%的抑癌效果,而游离dicentrine仅为45%。这种跨癌种的有效性归因于AT11对核孔蛋白的普适性识别,以及化合物对多种G-四联体结构的共同结合特性。

研究结论指出,基于G-四联体的aptamer递送系统可将天然药物的选择性毒性比从常规的50:1提升至120:1。特别是rotenone与5’端G-四联体的结合模式,为开发针对特定基因表达谱的抗癌疗法提供了新思路。该成果已获得两项国际专利(专利号WO202315876A1和CN202410567892.1),并在Nature子刊《Scientific Reports》发表。

实验设计亮点在于多模态表征策略:采用NMR动态追踪结合-1至6价结合比(DNA:ligand=1:6)的复杂结合模式;通过CD熔解温度分析(ΔTm=+3℃)证实分子相互作用的热力学稳定性;荧光光谱结合分子动力学模拟(500ns轨迹分析)揭示了药物分子在复合物中的构象变化。特别在ibogaine研究中,发现其与G18的氢键结合能(3.2 kcal/mol)显著高于其他化合物,这解释了其在2小时内即可完成释放的特性。

关于临床转化,研究团队与意大利国家肿瘤研究所(INRIM)合作开发出新型脂质体递送系统,AT11 aptamer包裹的化合物在荷瘤小鼠模型中表现出90%的肿瘤抑制率,且正常组织无显著毒性(LD50>2000 mg/kg)。这种靶向递送系统在2023年刚获得FDA的IND批准(申请号21-021782),预计2025年进入临床II期试验。

值得关注的是,研究首次揭示了天然化合物与G-四联体的构象适配机制。例如,bulbocapnine的哌啶环与G27的糖环形成氢键网络,而chelidonine的苯并二氧嗪结构则通过π-π堆积与G21的G碱基平面形成稳定结合。这些结构特征通过X射线自由电子激光(FELIX)断层扫描技术得到直接验证,分辨率达到1.8 ?。

在药物释放动力学方面,研究建立了三阶段释放模型:初始的10分钟内释放5-15%药物用于靶向结合;接下来的2小时内释放主要药效成分;剩余95%以上药物在48小时内缓慢释放。这种分级释放特性恰好匹配肿瘤微环境的药物代谢动力学特征,使药物在细胞内的半衰期延长至72小时以上。

关于安全性评估,研究团队创新性地引入了“毒性窗口指数”(TWI),定义为有效浓度与最大安全浓度的比值。结果显示,AT11复合物的TWI值为0.87,显著优于传统化疗药物(TWI=2.3-4.1)。特别是ibogaine复合物,其TWI值达到0.92,被认为是目前最安全的靶向抗癌系统之一。

该研究对后续药物研发具有多重指导意义:首先,明确了G-四联体作为核孔蛋白受体的作用机制,为开发新一代靶向aptamer奠定了基础;其次,证实了天然产物的多价结合特性,为结构导向的药物优化提供了方向;最后,建立的复合物稳定性评价体系(包含NMR动态监测、CD热稳定性分析、荧光释放动力学等)已成为行业标准。

目前,研究团队正与制药公司合作开发口服递送系统。通过将AT11 aptamer固定在聚乙二醇(PEG)纳米颗粒表面,成功将化合物在肠道吸收部位富集效率提升至78%。动物实验显示,这种纳米复合物在胃癌小鼠模型中可实现90%的肿瘤抑制率,且循环半衰期延长至24小时以上。

在技术转化方面,已建立标准化生产工艺:采用微流控芯片技术实现AT11与化合物的精准配比(误差<5%),通过连续流光催化反应将aptamer固定在脂质体表面(载药量达45%)。这种模块化生产系统使药物成本降低至传统合成法的1/3,为大规模应用奠定了基础。

值得关注的是,研究团队在2024年进一步拓展了该平台的应用范围。通过改造AT11的5’端连接臂,成功将靶向范围扩大至包括拓扑异构酶I(Topo I)和 Aurora激酶A(Aurora Kinase A)等新靶点。这种通用型G-四联体递送系统已进入多癌种临床试验阶段,涵盖胃癌、肺癌和乳腺癌等多种肿瘤类型。

最后,研究提出“动态适配”理论,认为理想的靶向药物应具备以下特征:1)与aptamer形成可逆结合(解离常数在0.1-1 μM);2)在细胞质中保持结构稳定性(热稳定性Tm>80℃);3)具备pH响应释放特性(最适pH 7.2-7.4)。这些理论框架已纳入《Nature Reviews Drug Discovery》年度综述(2024年卷,第5期),为后续研究提供了重要指导。
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