人类间充质干细胞（MSCs）来源的细胞外囊泡中miRNAs的多样性及其预期影响

《Stem Cell Reviews and Reports》：Diversity and Predicted Impact of miRNAs in Human MSCs-derived Extracellular Vesicles

本研究整合461项研究，分析人间充质干细胞来源外泌体中的miRNA功能，发现hsa-miR-21-5p高频表达，靶向基因ZZZ3和PTEN，GO和KEGG分析显示轴突生成、中性粒细胞胞外陷阱形成及氨基酸tRNA合成显著富集。

　　

摘要

细胞外囊泡（EVs）通过转移microRNAs（miRNAs）来介导细胞间通信，这些miRNAs在转录后调节基因表达。来自间充质干细胞/基质细胞（MSCs）的EVs已得到广泛研究，许多研究报道了这些囊泡中存在miRNAs。然而，尚未进行过全面的数据集分析以识别miRNAs的功能模式。为填补这一空白，我们整理并分析了关于MSCs来源的EVs中miRNAs的已发表数据，以揭示共同特征并探索其调控作用。我们进行了文献搜索，以找到涉及人类MSCs的体外研究，这些研究提供了关于EVs浓度和miRNAs表征的详细方法。选定的miRNA数据集被用于后续的生物信息学分析。使用MultiMiR R包检索了经过验证的miRNA-靶基因相互作用。通过基因本体论（GO）术语和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路进行了功能富集分析，以研究所识别基因的潜在生物学作用。我们整理了461项关于MSCs来源的EVs中miRNAs的研究。研究最多的细胞类型是脂肪来源的（ADSCs）、骨髓来源的（BMMSCs）和脐带来源的（UCMSCs），其中BMMSCs贡献了最多的独特miRNAs。hsa-miR-21-5p是报道频率最高的miRNA。对于ADSCs、BMMSCs和UCMSCs，最常见的靶基因分别是ZZZ3、ZZZ3和PTEN。值得注意的是，作为染色质调节因子的ZZZ3在所有三种细胞类型中都十分突出。GO分析显示其参与轴突生成的生物过程，而KEGG分析则强调了中性粒细胞胞外陷阱形成和氨基酰-tRNA生物合成的重要作用。本研究整合了来自人类MSCs来源的细胞外囊泡中的miRNA数据。

图形摘要